Identification of genes induced by BRCA1 in breast cancer cells
Meme kanseri hücrelerinde BRCA1 tarafından indüklenen genlerin tanımlanması
- Tez No: 129237
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. IŞIK YULUĞ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: BRCA1, Genler, Meme neoplazmları, BRCA1, Genes, Breast neoplasms
- Yıl: 2002
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
ÖZET MEME KANSERİ HÜCRELERİNDE BRCA1 TARAFINDAN İNDÜKLENEN GENLERİN TANIMLANMASI ARZU ATALAY Doktora Tezi, Molekül er Biyoloji ve Genetik Bölümü Tez Yöneticisi: Yar. Doç. Dr. Işık G.Yuluğ Aralık 2002, 235 sayfa BRCA1 geninin kalıtsal mutasyonları meme, rahim ve diğer organlarda kansere yatkınlığa yol açar. BRCA1 -eksik hücrelerde yeni kromozomal düzenlenmeler görüldüğünden BRCA1 protein ürününün kromozomal bütünlüğün devam ettirilmesinde görevli olduğu düşünülmektedir. BRCA1 -eksik hücrelerdeki kromozomal dengesizlik DNA çift-ipliğinin yanlış tamiriyle ilişkilidir. BRCA1 geninin kromozomal bütünlüğün sağlanmasındaki rolü protein ürününün transkripsiyonel düzenleme dahil bir kaç biyolojik özelliğine bağlıdır. Bu çalışmanın amacı BRCA1 tarafından düzenlenen genlerin tanımlanmasıdır. BRCAl'i meme kanseri hücrelerinde sıkı-düzenlenen“ecdysone”ile indüklenebilen bir sistemle fazla ifade etmek için yapılan ilk çalışmalar, istenen düzeyde BRCA1 proteini vermemiştir ve bu nedenle ektopik BRCA1 ifadesi konstitütif ekspresyon vektörü kullanılarak yapılmıştır. Bu çalışmada MCF7 meme kanseri hücrelerinde BRCAl'in fazla ifade edilmesi sonucu ifade düzeyleri artan genler“Suppression Subtractive Hybridisation”(SSH) metodu kullanılarak tanımlanmıştır. Ayrımsal tarama, dizileme ve homoloji araştırma çalışmaları meme kanseri hücrelerinde BRCAl'in fazla ifade edilmesinin DNA tamiri, kromozom yapımı ve ayrılması, sinyal iletimi, RNA tarama, ubikitin aracılıklı proteoliz, amino asit taşınımı, RNA metabolizması ve glukoz metabolizması gibi hücresel olaylarda yer alan proteinleri kodlayan farklı gen gruplarının ifadelerinde artışa yol açtığını göstermiştir. Bu çalışma meme karsinom hücrelerinde SSH tekniği kullanılarak BRCA1 tarafından indüklenen genleri gösteren ilk çalışmadır. Bu çalışmada tanımlanan genler BRCAl'in tümör baskılayıcı görevlerine yeni bir bakış açısı sağlayabilir. IV
Özet (Çeviri)
ABSTRACT IDENTIFICATION OF GENES INDUCED BY BRCA1 IN BREAST CANCER CELLS ARZU ATALAY Ph.D. in Molecular Biology and Genetics Supervisor: Assist. Prof. Işık G.Yuluğ December 2002, 235 Pages Inherited mutations of the BRCA1 gene predispose to cancer of the breast, ovaries and other organs. The BRCA1 protein product is implicated in the maintenance of chromosomal integrity as BRCA1 -deficient cells display gross chromosomal rearrangements. Chromosomal instability in BRCA1 -deficient cells is related to inappropriate DNA double-strand break repair. The role of the BRCA1 gene in the maintenance of chromosomal integrity is linked to a number of biological properties of its protein product including transcriptional regulation. The aim of this study is to identify genes that are regulated by BRCA1. Initial attempts to overexpress BRCA1 in breast cancer cells with the tightly-regulated ecdysone inducible system did not result in the desired levels of BRCA1 protein and ectopic BRCA1 expression was therefore performed by using the constitutive expression vector. In this study, we have identified genes whose expression levels are upregulated as a result of BRCA1 overexpression in MCF7 breast carcinoma cells by using the suppression subtractive hybridisation (SSH) method. Differential screening, sequencing and homology search studies showed that BRCA1 overexpression in breast cancer cells leads to transcriptional upregulation of distinct classes of genes encoding proteins involved in cellular processes such as DNA repair, chromosome assembly and segregation, signal transduction, RNA surveillance, ubiquitin-mediated proteolysis, amino acid transport, RNA metabolism and glucose metabolism. This study is the first to report BRCA1- induced genes in breast carcinoma cells with the SSH technique. The identified genes in this study may provide new insights into the tumour suppressor functions of BRCA1.
Benzer Tezler
- Analysis of differentially expressed genes in breast cancer: BRCA1-induced gene expression profiles and meta-analysis gene signature
Meme kanserinde farklılaşmış ifade gösteren genlerin analizi: BRCA1 tarafından indüklenen gen ifade profilleri ve meta-analiz gen imzası
BALA GÜR DEDEOĞLU
Doktora
İngilizce
2009
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. IŞIK G. YULUĞ
- Identification of differentially expressed ferroptosis-related hub genes and their association with cigarette smoke-induced chronic obstructive pulmonary disease by bioinformatic analysis
Diferansiyel olarak eksprese edilen spesifik ferroptoz genlerinin tanımlanması ve sigara dumanına bağlı kronik obstrüktif akciğer hastalığı ile ilişkisinin biyoinformatik analizler yoluyla belirlenmesi
FATMA ŞİMAL LAÇİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Allerji ve İmmünolojiKoç Üniversitesiİmmünoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN BAYRAM
- Identification of oncostatin M target genes by RNA-seq in mouse primary myotube cells
Fare birincil miyotüp hücrelerinde RNA-seq ile oncostatin M hedef genlerinin tanımlanması
AYNUR ERKIN KASHGARI
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
GenetikKoç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SERKAN KIR
- Kalıtsal duyma kayıplarına neden olan genlerin; haritalama, kritik bölge analizi ve mutasyon tarama yöntemleri ile saptanması
Identification of genes causing hereditary hearing loss by gene mapping, linkage analysis and mutation screening
ABDULLAH ÜZÜMCÜ
- Biyoinformatik analiz ile dilate kardiyomiyopati ilişkili anahtar genlerin belirlenmesi ve monosodyum glutamat ve tannik asit uygulanan sıçanların kalp dokularında incelenmesi
Identification of key genes associated with dilated cardiomyopathy by bioinformatics analysis, examining in heart tissues of rats treated with monosodium glutamate and tannic acid
HABİBE KARADAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
BiyolojiAtatürk ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HAMİD CEYLAN