Türkiye'de sert çekirdekli meyve ağaçlarındaki Prunus necrotic ringspot virüsü (PNRSV)'nün moleküler tekniklerle tanımı ve izolatlar arasındaki farlılıkların belirlenmesi
Molecular detection and determination of isolate variability for Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV) of stonefruit trees in Turkey
- Tez No: 135777
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET ASİL YILMAZ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: PNRSV, PCR, klonlama, gen dizilimi, ırk ayrımı, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, PNRSV, PCR, cloning, sequencing, strain differentiation, Prunus necrotic ringspot virus, Polymerase chain reaction
- Yıl: 2003
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışma, yerel (Türkiye) ve yabancı (ABD, İsrail, Macaristan) Prunus necrotic ringspot virüs (PNRSV) izolatlarının moleküler teknikler kullanarak teşhisinin yapılması ve izolatlar arasındaki farklılığın belirlenmesine yönelik yapılan araştırmalardan oluşmuştur. PNRSV'nin bitki dokusundan RT-PCR ile teşhisi; RT-PCR ürünlerinin klonlanarak nükleik asit dizilimlerinin saptanması, RFLP ve TCP analizlerini kullanarak izolatlar arasındaki farklılıkların genom düzeyinde ortaya konulması sağlanmıştır. Bu çalışmada yer alan Türk izolatlarının genel genomik gruplandırmada 2 ayrı grubun üyeleri olduğu saptanmıştır. Ayrıca, hastalığın RT-PCR ile tanımını rutin ve güvenilir bir şekilde yapabilecek bir sistem oturtulmuş olup sertifıkasyon ve karantina amaçlı yapılacak testlemelerde kullanılmak üzere önerilmiştir.
Özet (Çeviri)
In this thesis, some of the Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV) isolates from Turkey and the world (Israel, Hungary, USA) were studied for their detection and differentiation among isolates by using molecular techniques. The extraction of PNRSV from plant tissue and amplification of genom through RT-PCR for detection of the virus; cloning of RT-PCR products, sequencing, RFLP and TCP analysis were used in order to identify the differentiation among isolates. According to the analysis, the variability among isolates were made on the basis of genom structures. The isolates from Turkey in this study were classified for their molecular grouping for the first time and found the presence of 2 different groups. Detection of PNRSV by RT-PCR was recomended as the routine detection method for its sensitivity and the trustable resultings in the certification and quarantine programs.
Benzer Tezler
- Sert çekirdekli meyve türlerinde viral hastalık etmenlerinin RT-PCR yöntemi kullanılarak belirlenmesi
RT-PCR method of viral disease agents in stone fruit speciesdetermining using
MERVE KAFA
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
ZiraatErciyes ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. KAHRAMAN GÜRCAN
- Isparta kiraz üretim alanlarında görülen önemli virüslerin serolojik ve moleküler yöntemlerle teşhisi ve kılıf protein gen dizilimlerinin belirlenmesi
Detection of important viruses on cherry production region of Isparta by serological, moloculer methods and determination of coat protein gene sequences
YUSUF ÖZTÜRK
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
ZiraatSüleyman Demirel ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BAYRAM ÇEVİK
- Морфо-культуральная и молекулярная характеристика возбудителя бактериального рака (Pseudomonas syringae pv. syringae) косточковых плодовых культур кыргызстана
Kırgızistan'da sert çekirdekli meyve ağaçlarında bakteriyel kanser hastalığı pseudomonas syringae pv. syringae'nin morfo-kültülrel ve moleküler özellikleri
MAKSATAY AVAZOVA
Yüksek Lisans
Kırgızca
2019
ZiraatKırgızistan-Türkiye Manas ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DR. SAYKAL BOBUŞOVA
- Iğdır ve Kars (Kağızman) illerinde yumuşak ve sert çekirdekli meyve türlerinde bulunan zararlı böcek türleri
Determination of insects pests on stone and pome fruit trees in Igdir and Kars (Kagizman) provinces
YEŞİM BULAK KORKMAZ
- Sert çekirdekli meyvelerde RT-PCR yöntemi ile plum pox virus (PPV) taraması
Plum pox virus (PPV) screening by RT-PCR method in stone fruits
DUYGU KAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
ZiraatErciyes ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. KAHRAMAN GÜRCAN