Geri Dön

Identification of the genes involved in“Phyotsiderophore”synthesis and metal ion uptake in wheat using RT-PCR

Buğdayda“Fitosiderofor”sentezinde ve metal iyon alımında görev alan genlerin RT-PCR ile tanımlanması

  1. Tez No: 143396
  2. Yazar: YASEMİN AKTAŞ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MAHİNUR AKKAYA, PROF. DR. SEMRA KOCABIYIK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Buğday, fitosidorofor, demir eksikliği, çinko eksikliği, ters transkriptaz zincir reaksiyonu, SAM-synthetase, IDI-1, Wheat, phytosiderophores, iron deficiency, zinc deficiency, RT-PCR, SAM-synthetase, IDI-1
  7. Yıl: 2003
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Tarımsal alanların çoğunda topraklar, çinko ve demir elementlerinin düşük çözünürlüğü ve ulaşılabilirliği ile sonuçlanan yüksek pH'a sahiptir. Bu tip topraklarda yetişen bitkiler çinko ve demir eksikliği ile karşılaşırlar. Bu tip topraklarda normal gelişimlerine devam edebilen dayanıklı bitkilerin toprakta düşük çözünürlükte bulunan demiri alabilmek için çeşitli stratejiler geliştirdikleri tespit edilmiştir. Demir eksikliğine dayanıklı monokotlar, demir stresine cevap olarak topraktaki düşük çözünürlüklü demiri bağlayan mugineik asit ailesine bağlı fîtosideroforlan salgılarlar. Bir çok araştırıcı fitosidoroforlann graminelerin çinko beslenmesinde ve çinko eksikliğine dayanıklılık mekanizmasında da rol oynadıklarını öne sürmüşler. Fitosiderofor sentezinde rol aldığı düşünülen veya demir eksikliği sırasında uyarılan bir çok gen bazı organizmada gösterilmiş ancak henüz bu genler buğdayda araştırılmamıştır. Bu çalışmada, dayanıklı bir arpa kültüvan olan Tokak-157, dayanıklı buğday kültüvan Kıraç-66 ve daha az dayanıklı bir buğday kültüvan olan BDMM-19 bitkileri normal büyüme koşullannda 1 hafta yetiştirildikten sonra çinko içermeyen, demir içermeyen ve hem çinko hem de demir içermeyen olmak üzere 3 farklı solüsyona aktanlıp yetiştirilmeye devam edilmiştir. 1 hafta sonunda hem çinko hemde demir yönünden eksik ortamda yetiştirilen bitkiler tekrar normal büyüme koşullanna transfer edilmiştir. Daha önce buğday dışındaki diğer bitkilerde fitosiderofor sentezinde rol aldığı bulunmuş genlerin ortak ve korunmuş bölgeleri için dejenere primerler dizayn edilmiş ve bu primerler kullanılarak RT-PCR (ters transkriptaz zincir reaksiyonu) yapılmıştır. Sonuçta; buğday IDI-1 geni ve buğday SAM-synthetase gen fragmanı bulunmuştur.

Özet (Çeviri)

Soils in many agricultural areas have high pH, resulting in low availability of zinc and iron. Plants grown on such soils suffer from either Zn or Fe deficiency or both. The efficient plant genotypes grown normally in calcerous soils were found to evolve some strategies to acquire the iron which is in insoluble form. Iron efficient graminaceous monocots release iron chelating substances, mugineic acid family p hytosiderophores (MAs), in response to iron deficiency stress. Several researchers have suggested that phytosiderophores also can play role in grass Zn nutrition and thus it may be possible that it is the uptake mechanism for Zn efficiency. Several possible genes that take role in phytosiderophore synthesis or found to be induced under iron deficient conditions were identified in several organisms but not on wheat. In this study, the efficient barley cultivar Tokak-157, efficient wheat cultivar Kıraç -66 and relatively less efficient wheat cultivar BDMM-19 were grown in normal growth conditions for 1 week and transfered to zinc deficient, iron deficient and both zinc and iron deficient nutrient solutions. After growing 1 week on these conditions, plants grown on both zinc and iron deficient nutrient solutions were retransfered to zinc and iron sufficient conditions. Degenerate primers were designed for the conserved regions of previously identified genes that take role in phytosiderophore synthesis or induced under iron deficient conditions and RT-PCRs were performed. The complete open reading frame of IDI-l(Iron deficiency induced-1) gene and the putative gene fragment for SAM-s (S-adenosylmethionine synthetase) were identified.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    409284

    Identification of novel genes involved in the etiology of benign neonatal/infantile epilepsy syndromes and genetic epilepsy with febrile seizures plus (GEFS+)

    Selim yenidoğan/bebeklik epilepsi sendromları ve ateşli nöbetli genetik epilepsi etiyolojisinde yer alan yeni genlerin belirlenmesi

    SUNAY USLUER

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    Moleküler TıpBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERVER HANDE ÇAĞLAYAN

  2. Tez No

    371780

    Identification of novel genes involved in planar cell polarity establishment in the Drosophila eye

    Drosophila gözünde düzlemsel hücre kutuplaşması kurulmasında rol oynayan yeni genlerin tespit edilmesi

    DUYGU KOLDERE

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    BiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ARZU ÇELİK FUSS

  3. Tez No

    787680

    Identification and functional characterization of essential genes involved in the development of malignant pleural mesothelioma using CRISPR/Cas9-based negative selection screening

    Malign plevral mezotelyoma gelişiminde rol oynayan esansiyel genlerin CRISPR/Cas9 bazlı negatif seçilim tarama yöntemiyle tanımlanması

    ECE ÇAKIROĞLU

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    OnkolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ŞERİF ŞENTÜRK

  4. Tez No

    959505

    Tuzluluk stresine cevapta rol oynayan genlerin türler arası transkriptomik analizler ile araştırılması

    Interspecific transcriptome analyses for the identification of genes involved in salt stress responses

    FATMA NUR ÖLMEZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    GenetikNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ALİ TEVFİK UNCU

  5. Tez No

    139272

    Identification of genes involved in hepatocellular carcinoma : Evaluation of hCdc4 and B-Raf genes

    Hepatoselüler karsinomda R01 alan genlerinin tanımlanması: hCdc4 and B-Raf genlerinin değerlendirilmesi

    BANU SÜRÜCÜ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2003

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. CENGİZ YAKICIER

Geri Dön