Geri Dön

Hepatit B virüsünün kesim enzimleri kullanılarak tiplendirilmesi

Determine genotypes of the hepatitis B virus using restriction fragment lenght polymorphism(RFLP)

PDF İndir

  1. Tez No: 144446
  2. Yazar: AZİZ AKSOY
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. AYKUT ÖZDARENDERELİ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Hepatitis B virus, PCR, RFLP, genotypes of HBV
  7. Yıl: 2005
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Fırat Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

1. ÖZET Hepatit B virüsü (HBV), dünyada en fazla yaygın olan enfeksiyon etkenlerinden birisidir. Dünyada ortalama 350 milyon kronik hepatit B virüs taşıyıcısı olduğu tahmin edilmektedir. Hepatit B virüsünün tam genom nükleotid dizisi baz olarak alındığında %8'lik veya daha fazla nükleotid farklılıklarına göre HBV'nin 8 genotipi (A-H) bulunmaktadır. Farklı HBV genotipleri hastalığın klinik durumunu etkileyebilmektedir. Restriksiyon enzimleri kullanarak yapılan enzim kesim deneyleri (RFLP) HBV genotiplendirilmesinde kullanılmaktadır. Hepatit B virüsü S gen dizisi kullanılarak yapılan genotiplendirme ile tam genom belirlenerek yapılan tiplendirme sonuçları arasında uyum vardır. Bu çalışmada, HBV DNA pozitif 127 hastada, RFLP yöntemi ile virüsün genotiplendirilmesi amaçlandı. Semi-nested polimeraz zincir reaksiyonuyla (PZR) çoğaltılan spesifik S gen bölgesi RFLP ile analiz edildi. HBV S geninin genotip spesifik bölgelerinde bulunan Alwl, Earl, Hphl, Neil, and NlalW enzim kesim bölgeleri kullanıldı. RFLP sonuçları 127 örneğin tamamında genotip D'nin varlığını ortaya koydu. Bu sonuçlar, bölgemizdeki Hepatit B hastalarında dominant olarak genotip D'nin bulunduğunu ve HBV genotiplendirmede kullanılan RFLP yönteminin kolay ve yapılabilir olduğunu göstermektedir. Anahtar Kelimeler; Hepatit B virüsü, PZR, RFLP, HBV genotipleri.

Özet (Çeviri)

2. ABSTRACT Hepatitis B is one of the most common infectious diseases in the world. It has teen estimated that 350 million people world-wide are chronic hepatitis B virus (HBV) carriers. Hepatitis B virus (HBV) has been classified into 8 genotypes (A~H) based on an intergroup divergence of 8% or more in the complete nucleotide. Different genotypes of the hepatitis B virus may influence the clinical outcome of the disease. The Hepatitis B virus genotyping method using restriction fragment length polymorphism (RFLP) can reliably identify genotypes. HBV genotyping with the S gene sequence is consistent with genetic analysis using the foil genomic sequence. The aim of this study was to determine genotypes of the Hepatitis B virus using restriction fragment length polymorphism (RFLP) in the region of Elazig. A total of 127 HBV DNA positive patients were included in this study. Semi-nested PCR was performed to amplify a spesific part of S gene of HBV. Then, the PCR products were used for RFLP assay. After alignment of the S sequences, genotype specific regions are identified and digested by the restriction enzymes, Alwl, Earl, Hphl, Neil, and NlaN. The RFLP assay indicated that genotype D was the only detected type found in 127 samples. In conclusion, genotype D is the predominant type among hepatitis B patients in our region. This simple and easy HBV genotyping system using RFLP is considered to be useful for research on genotyping of HBV.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    118445

    Hepatit B virüsünün HBsAg geninin polimeraz zincir reaksiyonu yöntemiyle gösterilmesi

    Detection of HBsAg gene of hepatitis B virus by polymerase chain reaction

    NESLİHAN KELEŞTEMUR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    MikrobiyolojiFırat Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. AYKUT ÖZDARENDELİ

  2. Tez No

    389407

    The effect of HLA DPB1 alleles on the immune response in chronic Hepatitis B

    Kronik Hepatit B hastalığında HLA DPB1 allelerin hastalığın immun yanıta etkisi

    NİLAY GURBET KARATAŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    Tıbbi Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    DOÇ. GİZEM DİNLER DOĞANAY

  3. Tez No

    503177

    Hepatit E virüsünün kronik hepatit B ve kronik delta hepatitli hastalarda klinik ve laboratuvar parametreleri üzerine etkisi

    "the effect on clinical and laboratory parameters in patients with chronic hepatitis B and chronic delta hepatitis of hepatitis E virus

    AYSUN ÖZEL YEŞİLYURT

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    GastroenterolojiYüzüncü Yıl Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET ASLAN

  4. Tez No

    157808

    Hepatit B virusunun ve tedavisinde kullanılan anti-viral ajanların konak DNA`sına olan genotoksik etkisi

    The genotoxic effects of hepatitis B virus and the anti-viral agents used for its treatment to the host DNA

    PINAR ÖZKAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    Tıbbi BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. HATİCE ILGIN RUHİ

  5. Tez No

    841203

    Investigation of Hepatitis D virus from the Hepatitis B virus patients in Iraq

    Irak'ta Hepatı̇t B vı̇rüsü hastalarında Hepatı̇t D vı̇rüsünün araştırılması

    GHUFRAN SAAD YOUSIF ALSAMARRAI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÜLKÜ NİHAN YAZGAN TAVŞANOĞLU

    DOÇ. DR. ANSAM DAWOD SALMAN

Geri Dön