AFLP ve Matk sekans analizi ile bazı yabani buğday türlerinin filogenetik ilişkisinin araştırılması
Investigation of phylogenetic relationships of some wild wheat species by AFLP and Matk sequance analysis
- Tez No: 155438
- Danışmanlar: DOÇ.DR. SİBEL SÜMER
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Yabani buğday, AFLP analizi, mafK sekans analizi, filogenetik analiz, Wild wheat, AFLP analysis, matK sequence analysis, phylogenetic analysis
- Yıl: 2004
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
AFLP VE MATK SEKANS ANALİZİ İLE BAZİ YABANİ BUĞDAY TÜRLERİNİN FİLOGENETİK İLİŞKİSİNİN ARAŞTIRILMASI Selma Gülbitti Onarıcı ÖZ Buğday dünyadaki en önemli tahıldır. Buğday binlerce yıldır ıslah edildiğinden dolayı genetik kaynağında ağır bir erozyon söz konusudur. Bu nedenle genetik çeşitliliğin seviyesini arttırmak ıslah programlarının başarısı için önemlidir. Yabani buğdayların sahip olduğu genetik çeşitlilik hakkındaki bilgiler, bitki ıslah programlarında onlara ait genetik imkanların en iyi seviyede kullanımı için önemlidir. Bu çalışmada, Türkiye'den dört Triticum türünün genetik çeşitliliğini araştırmak üzere AFLP analizi (amplified fragment length polymorphism) kullanılmıştır. Bu analiz sonunda, değişik lokalitelere bağlı olarak en fazla genetik çeşitlenme T. monococcum var. boeoticum'a ait bireylerde bulunmuştur. Bu türü, T. urartu ve T. dicoccoides takip etmektedir. Bireyler arasındaki gen çeşitliliği değerleri, efektif allel sayıları, Shannon informasyon indeksleri, polimorfik lokus sayıları ve polimorfik lokus yüzdeleri dikkate alındığında, en düşük değerlerin T. dicoccoides 'e ait bireyler arasında olduğu bulunmuştur. En düşük genetik uzaklık T. aestivum ve T. dicoccoides arasında bulunurken, en yüksek değerler T. monococcum var. boeoticum ile T. dicoccoides arasında ve T. monococcum var. boeoticum ile T. aestivum arasında bulunmuştur. Bu çalışmanın sonuçları, T. urartu'nun (yabani, diploid buğday) T. dicoccoides ve T. aestivum için AA genom vericisi olduğu hipotezini desteklemektedir. Bu çalışmada, ayrıca aynı türlerin mafK genlerinin yaklaşık 600 bç'lik bölgesindeki polimorfizm düzeyi de araştırılmıştır. Sekans analizi sonucunda sadece iki pozisyonda baz değişikliği bulunmuştur, ancak sadece iki baz değişikliği filogenetik bir yorum yapmak için yeterli değildir. Bu çalışmada ekolojik ve klimatik faktörlerle genetik uzaklıklar arasında dikkat çekici bir bağlantı bulunamamıştır.
Özet (Çeviri)
INVESTIGATION OF PHYLOGENETIC RELATIONSHIPS OF SOME WILD WHEAT SPECIES BY AFLP AND MATK SEQUENCE ANALYSIS Selma Gülbitti Onarıcı Hacettepe University, Science Faculty, Department of Biology ABSTRACT Wheat is the most important cereal in the world. It has been improved for thousands of years, therefore there has been a drastic erosion of their genetic resource. To increase the range of genetic diversity is critical for the success of the breeding programs. Knowledge about genetic variability within the wild species is crucise for the optimal use of their genetic resources in plant breeding programs. In this study, AFLP analysis (amplified fragment length polymorphism) was used to investigate the phylogenetic relationship of four Triticum species from Turkey. Obtained data has shown the presence of, the highest genetic diversity in the individuals of T. monococcum var. boeoticum (depending on different localities) by T. urartu and T. dicoccoides respectively. Considering the the gene diversity, effective numbers of alleles, Shannon's information indexes, numbers of polymorphic loci and % polymorphic loci, the lowest values has been found between the individuals of T. dicoccoides. The lowest genetic distance was presented between T. aestivum and T. dicoccoides, whereas the highest values were observed between T. monococcum var. boeoticum and T. urartu. Our results support the hypothesis that T. urartu (wild, diploid wheat) may the donor of AA genome for T. aestivum and T. dicoccoides. In this study, the level of polymorphism in the approximately 600 bp region of matK gene in the same species was also investigated., Although it is not enough to make a phylogenetical interpretation nucleotide differences at two position have been demostrated by sequence analysis. It was not found significant correlation has not been found between the genetic distance and ecological and climatical factors in this study.
Benzer Tezler
- Psephellus aucherianus (DC.) boiss. (asteraceae) kompleksine ait tür populasyonlarında genetik çeşitliliğin belirlenmesi
Determination of the genetic variation in populations belonging to Psephellus aucherianus (DC.) boiss. (asteraceae) complex species
MERYEM BOZKURT
- Antalya ve çevresinde kültür bitkilerinde zararlı olan beyazsinek türlerinin (homoptera: aleyrodidae) aflp (amplified fragment length polymorphism) tekniği kullanılarak incelenmesi
Investigating whiteflies obtained from at various locations of Antalya using aflp (amplified fragment lenght polymorphism) technique
ZÜBEYİR DEVRAN
- Domateste demir kloruzuna toleransın haritalanmasında kullanılacak rekombinant saf hatlarda DNA izolasyonu ve AFLP optimizasyonu
DNA isolation and AFLP optimization in recombinant inbred lines used to map iron chlorosis tolerance in tomato
GÜL BETÜL YAŞAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
ZiraatYüzüncü Yıl ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SUAT ŞENSOY
- Beyaz nektarin tiplerinin AFLP moleküler markör polimorfizmi ile aroma bileşenlerinin Prunus cinsine giren önemli tür ve çeşitlerle karşılaştırılması ve melez populasyonların oluşturulması
Comparison of AFLP polymorphism and aromatic compaunds of white nectarine types with important Prunus species and varieties, creation of hybrid populations
ENGİN GÜR
Doktora
Türkçe
2012
ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MURAT ŞEKER
- Hastane enfeksiyonlarından izole edilen a.baumannii suşlarının AFLP ve pfge yöntemi ile moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of a. baumannii strains isolated from nosocomial infections by AFLP and pfge methods
IŞILAY GÖKÇE BENK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH KÖKSAL