Optimization and application of AFLP molecular marker system on Turkish durum wheat varieties for genetic analyses
Genetik analizler için AFLP moleküler markör sisteminin tür durum buğday çeşitleri üzerinde optimizasyonu ve uygulanması
- Tez No: 82640
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MAHİNUR S. AKKAYA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: AFLP, parmak izi, durum buğdayı, moleküler markörler. VI, AFLP, fingerprinting, durum wheat, molecular markers. IV
- Yıl: 1999
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 97
Özet
öz GENETİK ANALİZLER İÇİN AFLP MOLEKÜLER MARKÖR SİSTEMİNİN TÜRK DURUM BUĞDAY ÇEŞİTLERİ ÜZERİNDE OPTİMİZASYONU VE UYGULANMASI İncirli, Aytül Yüksek Lisans. Kimya Bölümü Tez Yöneticisi: Doç. Dr. Mahinur S. Akkaya Ağustos 1999, 97 sayfa Çoğaltılan Parça Uzunluğu Farklılığı (AFLP; Vos et al., 1995) Polimeraz Zincir Reaksiyonu'na (PZR) bağlı moleküler markör sistemidir. AFLP diğer PZR tabanlı moleküler markörlere göre sıralı enzimatik reaksiyon aşamalarında daha uzmanlaşmış beceriler gerektirir. Ayrıca, AFLP markörlerinin tekrarlanabilirliği, üzerinde çalışılan DNA örneklerinin niteliği ve saflığına bağlıdır. Tek bir PZR reaksiyonunda bağımsızyüzlerce genetik lokusun belirlenmesine ek olarak, bu üstün DNA parmak izi tekniğinde sekans karakterizasyonunun bilinmesine gerek yoktur. Oldukça bilgilendirici, güvenilir, tekrarlanabilir, hızlı ve daha az masraflıdır. Bu çalışma, reaksiyon koşullarının optimizasyonu, biri kışlık, diğeri yazlık olmak üzere iki sınıf Türk durum buğdayı üzerine uygulanan 36 seçici çoğaltma primer setleri arasından en polimorfik olanlarının belirlenmesini ve bu primer seti tüm örnekler üzerinde uygulanmasını içermektedir. Bunlar arasından seçilen 18 polimorfik primer kombinasyonun 15 Türk durum buğdayı üzerine uygulanması sonucu sınıflandırma analizleri yapılmıştır. AFLP ürünleri 50'den fazla bantla (50-157) sonuçlandı. Elde edilen polimorfik AFLP lokusları 4 ile 28 arasında değişmektedir.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT OPTIMIZATION AND APPLICATION OF AFLP MOLECULAR MARKER SYSTEM ON TURKISH DURUM WHEAT VARIETIES FOR GENETIC ANALYSES İncirli, Aytül M. S. Department of Chemistry Supervisor: Assoc. Prof. Dr. Mahinur S. Akkaya August 1999, 97 pages Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP; Vos et al., 1995) is a PCR-based molecular marker system. AFLP, probably requires more skilled performances for the sequential enzymatic reaction steps, than those of other PCR-based molecular markers. Also, the reproducibility of AFLP markers is much more dependent on the quality and the purity of the DNA samples to be processed. In addition to its 111high detection limit of hundreds of independent genetic loci in a single PCR reaction, this powerful DNA fingerprinting technique also needs no prior sequence characterization. It is highly informative, reliable, reproducible, fast and cost effective. The present study describes optimization of reaction conditions, determination of most polymorphic selective amplification primer sets among the 36 combinations studied, by comparing one winter and one spring type Turkish durum wheat varieties and application of these primer sets to all samples. The polymorphic 18 primer combination AFLP results of fifteen durum wheat varieties were used for cluster analyses. AFLP products resulted in more than 50 bands (50 to 157), the number of polymorphic AFLP loci obtained, ranged from 4 to 28 per selective primer combination.
Benzer Tezler
- The genetic diversity of the Galanthus L. species in Turkey
Türkiye?deki Galanthus L. türlerinin genetik çeşitliliği
NIVART TAŞÇI
Yüksek Lisans
İngilizce
2008
BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEŞ'E BİLGİN
- Antep fıstığında (Pistacia vera L.) gıda aldatmacasının belirlenmesinde yüksek çözünürlüklü erime (HRM) yönteminin optimizasyonu ve uygulaması
Optimization and application of the high resolution melting (HRM) technique for detection of food adulteration in pistachio (Pistacia vera L.)
NESLİHAN AY
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiIğdır ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ KAAN HÜRKAN
- Optimization and application of Stirling engine for waste heat recovery from a heavy-duty truck engine
Ağır vasıta motorundan atık ısının geri kazanımı ̇için Stirling motorunun optimizasyonu ve uygulaması
METİN GÜVEN
Doktora
İngilizce
2023
Makine MühendisliğiBoğaziçi ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜNAY ANLAŞ
PROF. DR. HASAN BEDİR
- Yapay zeka algoritmaları kullanılarak X bandı için mikroşerit yama anten boyut optimizasyonu ve uygulaması
Dimension optimization and application of microstrip patch antenna in X band via artificial intelligent algorithms
UMUT ÖZKAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiSelçuk ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. LEVENT SEYFİ
- White space cost optimization and application of parametric modeling on white space design improvement process
Sistem odası maliyet optimizasyonu ve parametrik modelleme yaklaşımının sistem odası tasarım iyileştirme sürecinde uygulanması
TUĞÇE KAYA SEVER
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Makine Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. VEDAT TEMİZ