Optimization and application of AFLP molecular marker system on Turkish durum wheat varieties for genetic analyses
Genetik analizler için AFLP moleküler markör sisteminin tür durum buğday çeşitleri üzerinde optimizasyonu ve uygulanması
- Tez No: 82640
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MAHİNUR S. AKKAYA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: AFLP, parmak izi, durum buğdayı, moleküler markörler. VI, Buğday, Genetik algoritmalar, Makarnalık buğday, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, AFLP, fingerprinting, durum wheat, molecular markers. IV, Wheat, Genetic algorithms, Fingerprint, Polymerase chain reaction
- Yıl: 1999
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
öz GENETİK ANALİZLER İÇİN AFLP MOLEKÜLER MARKÖR SİSTEMİNİN TÜRK DURUM BUĞDAY ÇEŞİTLERİ ÜZERİNDE OPTİMİZASYONU VE UYGULANMASI İncirli, Aytül Yüksek Lisans. Kimya Bölümü Tez Yöneticisi: Doç. Dr. Mahinur S. Akkaya Ağustos 1999, 97 sayfa Çoğaltılan Parça Uzunluğu Farklılığı (AFLP; Vos et al., 1995) Polimeraz Zincir Reaksiyonu'na (PZR) bağlı moleküler markör sistemidir. AFLP diğer PZR tabanlı moleküler markörlere göre sıralı enzimatik reaksiyon aşamalarında daha uzmanlaşmış beceriler gerektirir. Ayrıca, AFLP markörlerinin tekrarlanabilirliği, üzerinde çalışılan DNA örneklerinin niteliği ve saflığına bağlıdır. Tek bir PZR reaksiyonunda bağımsızyüzlerce genetik lokusun belirlenmesine ek olarak, bu üstün DNA parmak izi tekniğinde sekans karakterizasyonunun bilinmesine gerek yoktur. Oldukça bilgilendirici, güvenilir, tekrarlanabilir, hızlı ve daha az masraflıdır. Bu çalışma, reaksiyon koşullarının optimizasyonu, biri kışlık, diğeri yazlık olmak üzere iki sınıf Türk durum buğdayı üzerine uygulanan 36 seçici çoğaltma primer setleri arasından en polimorfik olanlarının belirlenmesini ve bu primer seti tüm örnekler üzerinde uygulanmasını içermektedir. Bunlar arasından seçilen 18 polimorfik primer kombinasyonun 15 Türk durum buğdayı üzerine uygulanması sonucu sınıflandırma analizleri yapılmıştır. AFLP ürünleri 50'den fazla bantla (50-157) sonuçlandı. Elde edilen polimorfik AFLP lokusları 4 ile 28 arasında değişmektedir.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT OPTIMIZATION AND APPLICATION OF AFLP MOLECULAR MARKER SYSTEM ON TURKISH DURUM WHEAT VARIETIES FOR GENETIC ANALYSES İncirli, Aytül M. S. Department of Chemistry Supervisor: Assoc. Prof. Dr. Mahinur S. Akkaya August 1999, 97 pages Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP; Vos et al., 1995) is a PCR-based molecular marker system. AFLP, probably requires more skilled performances for the sequential enzymatic reaction steps, than those of other PCR-based molecular markers. Also, the reproducibility of AFLP markers is much more dependent on the quality and the purity of the DNA samples to be processed. In addition to its 111high detection limit of hundreds of independent genetic loci in a single PCR reaction, this powerful DNA fingerprinting technique also needs no prior sequence characterization. It is highly informative, reliable, reproducible, fast and cost effective. The present study describes optimization of reaction conditions, determination of most polymorphic selective amplification primer sets among the 36 combinations studied, by comparing one winter and one spring type Turkish durum wheat varieties and application of these primer sets to all samples. The polymorphic 18 primer combination AFLP results of fifteen durum wheat varieties were used for cluster analyses. AFLP products resulted in more than 50 bands (50 to 157), the number of polymorphic AFLP loci obtained, ranged from 4 to 28 per selective primer combination.
Benzer Tezler
- The genetic diversity of the Galanthus L. species in Turkey
Türkiye?deki Galanthus L. türlerinin genetik çeşitliliği
NIVART TAŞÇI
Yüksek Lisans
İngilizce
2008
BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEŞ'E BİLGİN
- Karınca algoritması ve tesis yerleşimi problemlerine uygulanması
Ant algorithm and application for problem of facility location
DURAN TOKSARI
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
Endüstri ve Endüstri MühendisliğiYıldız Teknik ÜniversitesiEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Y.DOÇ.DR. NİHAN ÇETİN DEMİREL
- Novel global optimization techniques with applications and image processing system with theoretical and computational analysis
Uygulamalarla yeni global optimizasyon teknikleri ve teorik ve hesaplamalı analizli görüntü işleme sistemi
MUHAMMAD WASIM AWAN
Doktora
İngilizce
2025
MatematikSüleyman Demirel ÜniversitesiMatematik Eğitimi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET ŞAHİNER
- Scenario-based robust facility layout design for multi-block manufacturing: a data-driven MILP framework with an ındustrial application
Çok bloklu i̇malat için senaryo tabanli dayanikli tesis yerleşim tasarimi: endüstriyel uygulamali veri odakli bir karma tamsayili doğrusal programlama (MILP) çerçevesi
SADRA SHOARINEJAD
Doktora
İngilizce
2025
Endüstri ve Endüstri MühendisliğiKoç ÜniversitesiEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METİN TÜRKAY
- Bulanık doğrusal programlama ile feldspat karışım optimizasyonu
Feldspat blending optimization with fuzzy linear programming
İREM ÇELEBİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Endüstri ve Endüstri Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZGÜR KABAK