Geri Dön

PCR cloning and heterologous expression of scytalidium thermophilum laccase gene in aspergillus sojae

Scytalidium thermophilum lakkaz geninin PCR tekniği ile klonlanması ve Aspergillus Sojae'de heterolog ekspresyonu

  1. Tez No: 166993
  2. Yazar: GÜLDEN KOÇLAR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ZÜMRÜT BEGÜM ÖĞEL, PROF. DR. UFUK BAKIR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: lakkaz, gen klonlama, Scytalidium thermophilum, laccase, gene cloning, Scytalidium thermophilum, propeptide
  7. Yıl: 2005
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 128

Özet

organizmasına klonlanmıştır. Glukoamilaz geninin signal peptit bölgesi altına takılan genin, gliseraldehit 3-fosfat dehidrojenaz promoton kontrolünde, glukoz içeren ortamda heterolog ekpresyonu gözlenmiştir. Lakkaz geninin heterolog üretimi, enzimin ökaryotik GRAS bir organizmada yüksek düzeyde ekspresyonunu sağlamak ve daha sonraki biotransformasyon ve enzim mühendisliği çalışmalarında kullanılması yönünde atılmış önemli bir adımdır. Bu çalışmada ayrıca lakazları da içeren küf proteinlerin N ve C uçlarındaki propeptit kesim bölgeleri incelenmiştir.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT PCR CLONING AND HETEROLOGOUS EXPRESSION OF SCYTALIDIUM THERMOPHILUM LACCASE GENE IN ASPERGILLUS SOJAE Koçlar, Gülden M.S., Department of Biotechnology Supervisor: Prof. Dr. Zümrüt Begüm Ögel Co-Supervisor: Prof. Dr. Ufuk Bakır December 2005, lllpages In this study, Scytalidium thermophilum laccase gene was first cloned into E. coli and then heterologously expressed in A. sojae. S. thermophilum is a thermophilic fungus with an important role in determining selectivity of compost produced for growing Agaricus bisporus. S. thermophilum laccase gene was first cloned by Novo Nordisk Bio Tech, Inc. in 1998. This laccase gene (IccS) has an open reading frame of 2092bp. It is composed of five exons punctuated by four small introns. The coding region, excluding intervening sequences is very GC-rich (60.8% G+C) and encodes a preproenzyme of 616 amino acids: a 21 amino acid signal peptide and a 24 amino acid predicted propeptide. IccS gene was amplified using specific primers to exclude the signal and pro-peptide coding regions and ligated to expression vector pAN52-4. The recombinant plasmid was used to transform Aspergillus sojae ATCC11906 (pyrG"). Heterologuos expression was observed in glucose-containing media, under IVthe control of the glyceraldehydes 3 -phosphate dehydnogenese promoter and the secretion signal of glucoamylase gene. Laccase gene is an important step towards the high level expression of this enzyme in a GRAS eucaryotic host and for further biotransformation and enzyme engineering studies. In this study also bioinformatic analysis of N-terminal and C-terminal propeptide cleavage sites of fungal proteins including laccases were studied.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    172239

    Cloning and expression of periplasmic (CLpP-LIKE) and memrane-bound serine protease genes of thermoplasma volcanium in escherichia coli

    Thermoplasma volcaniumun periplazmik (CLpP-benzeri) ve membrana-bağlı serin proteaz enzim genlerinin escherichia colide klonlanması ve anlatımı

    BURÇAK DEMİROK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2006

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    PROF.DR. SEMRA KOCABIYIK

  2. Tez No

    184423

    Bitki genlerinin Schizosaccharomyces pombe'de anlatımı

    Expression of plant genes in Schizosaccharomyces pombe

    BEDİA GEMİCİ PALABIYIK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    Biyolojiİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLER TEMİZKAN

  3. Tez No

    863790

    Cloning two tomato pathogenesis-related-1 (SlPR-1) genes and generating vectors for their heterologous expression

    İki adet domates patojen ilişkili-1 (SlPR-1) genin klonlanması ve heterolog ifadelerinin belirlenmesi için farklı vektörlerin oluşturulması

    KÜBRA YILDIZ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyoteknolojiAkdeniz Üniversitesi

    Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET AYDIN AKBUDAK

  4. Tez No

    153386

    Cloning, expression and sequencing of citrate synthase from Thermoplasma volcanium

    Thermoplasma volcaniumun sitrat sentaz geninin klonlanması, ekspresyonu ve nükleik asit diziliminin belirlenmesi

    ÇAĞLAR ÇEKİÇ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2004

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMRA KOCABIYIK

    PROF. DR. MAHİNUR AKKAYA

  5. Tez No

    600779

    Cloning, expression and characterization of the niger XYNB gene

    Başlık çevirisi yok

    KÜBRA BAYRAK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    BiyoteknolojiGebze Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SALİHA İŞSEVER ÖZTÜRK

    DOÇ. DR. SEVNUR MANDACI

Geri Dön