Controlling discrete genetic regulatory networks
Kesikli genetik düzenleyici ağların kontrolü
- Tez No: 167421
- Danışmanlar: PROF.DR. FARUK POLAT, PROF.DR. REDA ALHAJJ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Computer Engineering and Computer Science and Control
- Anahtar Kelimeler: mikroarray, veri madenciliği, öğrenme, farklı gen ifadesi, genetik düzenleyici ağ modelleme, genetik düzenleyici ağ kontrolü, saccharomyces cerevisiae, microarray, data mining, learning, differential gene expression, genetic regulatory network modeling, genetic regulatory network control, saccharomyces cerevisiae. IV
- Yıl: 2005
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bilgisayar Mühendisliği Bölümü
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 154
Özet
ÖZ KESİKLİ GENETİK DÜZENLEYİCİ AĞLARIN KONTROLÜ Abul, Osman Doktora, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü Tez Yöneticisi: Prof.Dr. Faruk Polat Ortak Tez Yöneticisi: Prof.Dr. Reda Alhajj Ocak 2005, 141 sayfa Genetik düzenleyici ağlar hücre dinamiklerini modelleyebilmektedirler. Bu ağlar aynı zamanda dahili ve harici müdahalelerin etkilerini araştırmaya izin vermektedirler. Bu çalışmada harici müdahalelerin genetik ağlara etkileri konusu üzerinde çalışılmıştır. Etkiler farklı gen ifadesi analizi kullanılarak belirlenmiştir. Farklı gen ifadesi problemi üzerinde yöntemin gücünü artırmak için ilave çalışma da yapılmıştır. Kesikli dinamik düzenleyici ağlar için kontrol problemi formüle edilmiştir. Ayrıca bu formülasyonda, sonlu kontrol, sonsuz kontrol, ağ durumu ve müdahale masraflarının farklı biçimlerde hesaba katılması gerekleri gibi çeşitli hususlar da göz önünde bulundurulmuştur. Küçük ve büyük ölçekli ağlar için kontrol düzenleri önerilmiş ve örneklendirilmiştir. Bir durum çalışması üzerinde önerilerin nasıl çalıştığı gösterilmiştir. Aynı zamanda, Önerilen yöntemlere olan gerekler ve bu yöntemlerin etkililiği verilmiştir.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT CONTROLLING DISCRETE GENETIC REGULATORY NETWORKS Abul, Osman PhD., Department of Computer Engineering Supervisor: Prof.Dr. Faruk Polat Co-supervisor: Prof.Dr. Reda Alhajj January 2005, 141 pages Genetic regulatory networks can model dynamics of cells. They also allow for study ing the effect of internal or external interventions. Selectively applying interventions towards a certain objective is known as controlling network dynamics. In this thesis work, the issue of how the external interventions affect the network is studied. The effects are determined using differential gene expression analysis. The differential gene expression problem is further studied to improve the power of the given method. Control problem for dynamic discrete regulatory networks is formulated. This also addresses the needs for various control strategies, e.g., finite horizon, infinite hori zon, and various accounting of state and intervention costs. Control schemes for small to large networks are proposed and experimented. A case study is provided to show how the proposals are exploited; also given is the need for and effectiveness of various control schemes.
Benzer Tezler
- Yapay atom algoritması ve ayrık problemlere uygulanması
Artificial atom algorithm and its application to discrete problems
AYŞE ERDOĞAN YILDIRIM
Doktora
Türkçe
2018
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİnönü ÜniversitesiBilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ KARCI
- Optimization of surgery delivery systems
Ameliyat uygulama sistemlerinin optimizasyonu
SERHAT GÜL
Doktora
İngilizce
2010
Endüstri ve Endüstri MühendisliğiArizona State UniversityEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. JOHN W. FOWLER
PROF. DR. BRIAN T. DENTON
- Optimization of surgery delivery systems
Başlık çevirisi yok
SERHAT GÜL
Doktora
İngilizce
2010
Endüstri ve Endüstri MühendisliğiArizona State UniversityDR. JOHN W. FOWLER
DR. BRIAN T. DENTON
- Bir endüstriyel kontrol sisteminin petri netler yardımıyla modellennmesi ve xilinx XC2S200 FPGA'sı ile gerçekleştirilmesi
Moddelling an industrial system using petri nets and its implementation by means of a xilinx XC2S200 FPGA
İBRAHİM BURAK KOÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiNiğde ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. MURAT UZAM
- Dijital elektrohidrolik sistemlerin popet tipi hidrolik valflerle pekiştirmeli öğrenme kullanılarak denetlenmesi
Control of digital electrohydraulic systems driven by poppet-type hydraulic valves using reinforcement learning
MUSTAFA YAVUZ COŞKUN
Doktora
Türkçe
2023
Makine MühendisliğiKaradeniz Teknik ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET İTİK