Molecular analysis of polyglutamine diseases and investigation of the interaction between huntingtin and nuclear receptor corepressor
Poliglutamin hastalıklarının moleküler tanısı ve huntingtin ve nükleer korepresör arasındaki ilişkinin araştırılması
- Tez No: 170840
- Danışmanlar: PROF. NAZLI BAŞAK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biyomühendislik, Biochemistry, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2005
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 217
Özet
Xll ÖZET POLIGLUTAMİN HASTALIKLARININ MOLEKÜLER ANALİZİ VE HUNTİNGTİN VE NÜKLEER RESEPTÖR KOREPRESÖR ARASINDAKİ İLİŞKİNİN ARAŞTIRILMASI Poliglutamin hastalıkları Huntington Hastalığı (HD), Dentato-Rubral Pallidoluysiyan Atrofi, Spinal ve Bulbar Müsküler Atrofî (SBMA) ve Spinoserebellar Atrofi (SCA) Tip 1, 2, 3, 6, 7 ve 17'yi kapsar. Tüm bu hastalıklar geç başlangıçlıdır, ve X'e bağlı çekinik geçiş gösteren SBMA dışındakiler otozomal baskın karıtılırlar. Poliglutamin toksisitesine yol açan moleküler mekanizmalar henüz tam olarak açığa kavuşmamıştır. Bu hastalıkların klinik belirtilerinin örtüşmesi ve henüz kesin sağaltım ve tedavi olmaması genetik tanıyı gerekli kılmaktadır. Buna ek olarak, moleküler tanı kriterlerinin oluşturulması için her topluma özgü normal ve patolojik tekrar sayılarının belirlenmesi gereklidir. Bu tezin ilk bölümünde, Türk toplumunda görülen tüm poliQ hastalıkları incelenmiş, ikinci bölümde ise huntingtin (htt) ile nükleer korepresör (NCoR) arasındaki ilişki araştırılmıştır; bu etkileşim HD patogenezine neden olabilecek bir transkripsiyonel disregülasyon mekanizmasına ışık tutabilir. Bu çalışmada 71 aile konfirmatif, 14 birey ayırıcı, 18 birey ise presemptomatik tam talebiyle incelenmiştir. HD hastalarının tekrar sayılan 39-78, ortalama ise 45 olarak bulunmuştur. SCA1 ve SCA2 lokuslarında normal tekrar aralıklarının 26-34 ve 21-24 CAG tekrarı olduğu gösterilmiştir. Analiz edilen 111 aileden beşinde SCA1, üçünde SCA2 saptanmıştır. Htt ve NCoR arasındaki ilişki floresan-rezonans-enerji-transferi metoduyla gösterilmiş ve bu ilişkinin olası sonuçlan hücre lokalizasyon çalışmalarıyla araştırılmıştır. Alınan sonuçlar, mutant htt'nin NCoR'u hücrede bulunması gereken işlevsel bölgesinden uzaklaştırmadığına ve HD patogenezinin erken aşamalarında NCoR-kaynaklı bir transkripsiyonel disregülasyonun olmadığına işaret etmektedir.
Özet (Çeviri)
XI ABSTRACT MOLECULAR ANALYSIS OF POLYGLUTAMINE DISEASES AND INVESTIGATION OF THE INTERACTION BETWEEN HUNTINGTIN AND NUCLEAR RECEPTOR COREPRESSOR Polyglutamine diseases include Huntington's Disease (HD), Dentato-Rubral Pallidoluysian Atrophy, Spinal and Bulbar Muscular Atrophy (SBMA) and Spinocerebellar Ataxia (SCA) Type 1, 2, 3, 6, 7 and 17. All are autosomal dominant adult-onset diseases, except X-linked recessive SBMA. The molecular mechanisms causing polyQ toxicity have not been clarified yet. Clinical symptoms of polyglutamine diseases overlap, and since there is no cure or therapy available, genetic diagnoses of polyglutamine diseases are of great importance. In addition, establishment of the molecular diagnostic criteria requires the investigation of normal and expanded CAG repeat size ranges for each population. In the first part of this thesis, all known polyglutamine diseases were investigated in the Turkish population, and in the second part the interaction between huntingtin (htt) and nuclear corepressor (NCoR) was analyzed; this may help in elucidating a possible transcriptional dysregulation mechanism in HD pathogenesis. Throughout this study, 71 families required corifirmatory genetic testing, 14 individuals differential diagnosis and 18 required presymptomatic testing for HD. The expanded CAG repeats of HD patients were identified to be 39-78 repeats, the mean being 45. Normal ranges at the SCA1 and SCA2 loci were shown to be 26-34 and 21-24 CAG repeats. Out of 111 families analyzed, SCA1 was described in five, and SCA2 in three families. The interaction between htt and NCoR was demonstrated using fluorescence resonance energy transfer, and possible implications of an aberrant interaction were investigated by cellular localization studies. The results have shown that mutant htt does not sequester NCoR from its site of action, and NCoR-mediated transcriptional dysregulation is not an early event in HD pathogenesis.
Benzer Tezler
- Molecular analysis of the CAG repeat length at the IT 15 locus in the Turkish population and molecular diagnosis of CAG/Polyglutamine repeat diseases
Türk toplumunda IT 15 lokusundaki CAG tekrar sayısının moleküler analizi ve CAG/Poliglutamin tekrarı hastalıklarının moleküler tanısı
NAGEHAN ERSOY
Yüksek Lisans
İngilizce
1999
BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. A. NAZLI BAŞAK
- Türk toplumunda CAG tekrarlı spinoserebellar ataksi lokuslarının moleküler analizi
Molecular analysis of SCA loci with CAG repeats in the Turkish population
MUSTAFA ÖMÜR KÖSE
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
GenetikHaliç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NAGEHAN ERSOY
- Hiperfosfatazya mental retardasyon sendromu düşünülen olgularda tüm ekzom sekanslama ile moleküler etiyolojinin belirlenmesi
Determination of molecular etiology by whole exome sequencing in suspected cases of hyperphosphatasia mental retardation syndrome
SELİN UZUN KARAÜZÜM
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıEge ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FERİŞTAH FERDA ÖZKINAY
- A computational study on pathogenic exon-1 Huntington fragment fiber structure and its nucleation
Patojenik ekson-1 Huntington fragment lif yapısı ve çekirdeklenmesi üzerine hesaplamalı bir çalışma
MERVE KUNAK
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyokimyaKoç ÜniversitesiBiyomedikal Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET SAYAR
- Genetic factors contributing to ALS in Turkey: ATXN2 polyq repeat expansions and SNP/CNV associations
Türkiye'de ALS'ye etki eden genetik faktörler: ATXN2 poliglutamin tekrar artışları ve SNP/CNV ilişkilendirme çalışmaları
ÖZGÜR ÖMÜR
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE NAZLI BAŞAK