The effects of twelve quorum-sensing gene products on the expression of Bacabcde operon in Bacillus subtilis
12 adet hücre sinyali algılama mekanizması gen ürününün Bacillus subtilis Bacabcde operon ekspresyonu üzerine etkileri
- Tez No: 176814
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AYTEN YAZGAN KARATAŞ, PROF. DR. GÜLAY ÖZCENGİZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2008
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bacillus subtilis'te genetik kompetans, sporulation ve antibiyotik üretimi hücre yoğunluğu sinyali mekanizması ile kontrol edilmektedir. B. subtilis'in bazı suşları tarafından sentezlenen basilisin, L-alanin ve L-antikapsinden oluşmuş bir dipeptitdir. Basilisin biyosentezinin, ComQ/ComX, PhrC (CSF), ComP/ComA'nın etkisinde hücre yogunluğu sinyali mekanizmasının kontrolü altında olduğunu ve bunun Spo0K (Opp)'ye bağlı bir biçimde gerçekleştiğini daha önceki çalışmalarımızda göstermiştik. Kısa bir süre önce, B. subtilis 168'in ywfBCDEF genlerinin basilisin biyosentetik fonksiyonlar taşıdığı gösterilmiş ve ilgili operon bacABCDE olarak yeniden adlandırılmıştır. Şimdiki çalışma, daha önce tanımlanan srfA, oppA, comA, phrC, phrF, phrK, comQ(comX), comP, spo0H, spo0A, abrB ve codY regülator genlerinin bacABCDE basilisin biyosentetik operonunun üzerine transkripsiyon düzeyinde etkilerinin belirlenmesini amaçlamaktadır. bac operon ekspresyon düzeyinin ölçülmesi için, Bacillus subtilis'e özgü, bacA gen lokusu ile füzyon oluşturacak bir lacZ geni içeren, B. subtilis PY79 bacA::lacZ::erm füzyonu taşıyan suşu oluşturulmuştur. Daha sonra çalışılan hücre yoğunluğu sinyali genleri, bloke edilmiş uygun mutant suşlar kullanılarak bacA::lacZ::erm füzyonu taşıyan suşun kompetent hücre transformasyonu sonucunda inaktive edilmiştir. Elde edilen suşlar ve füzyonu taşıyan suş (kontrol) PA besiyeri içerisinde büyültülmüş ve bacA genine bağlı ß-galaktosidaz aktiviteleri ölçülmüştür. bacA-lacZ ekspresyonu srfA, oppA, comA, phrC, phrF, phrK, comQ (comX), comP, spo0H and spo0A inaktif mutantlarda ciddi şekilde azalmıştır. Diğer yandan, abrB geni bloke edilmiş mutantta bacA ekspresyon düzeyi logaritmik büyüme fazı sırasında yaklaşık iki artmış, codY inaktif mutantta ise durağan fazı sırasında ciddi şekilde azalmıştır.
Özet (Çeviri)
In Bacillus subtilis, genetic competence, sporulation and antibiotic production are controlled by quorum-sensing global regulatory mechanism. Bacilysin, being produced and excreted by certain strains of Bacillus subtilis, is a dipeptide antibiotic composed of L-alanine and L-anticapsin. We showed that the biosynthesis of bacilysin is under the control of quorum sensing global regulatory pathway through the action of ComQ/ComX, PhrC (CSF), ComP/ComA in a Spo0K (Opp)-dependent manner. Recently, the ywfBCDEF genes of B. subtilis 168 were shown to carry biosynthetic core function and renamed as bacABCDE operon. The objective of the present study is to elucidate the effects of previously-identified genes srfA, oppA, comA, phrC, phrF, phrK, comQ (comX), comP, spo0H, spo0A, abrB and codY on the expression of bacilysin biosynthetic operon bacABCDE. In order to monitor the expression of bac operon a B. subtilis strain, namely OGU1, containing a transcriptional bacA-lacZ fusion at bacA locus was constructed. Subsequently, each of the above-mentioned genes of cell density signaling was insertionally inactivated by transforming the competent cells of OGU1 with chromosomal DNA of the corresponding blocked mutant strains. The resulting strains and OGU1 as the control were cultured in PA medium and bacA-directed ß-galactosidase activities were monitored. bacA-lacZ expression was severely impaired in the srfA, oppA, comA, phrC, phrF, phrK, comQ (comX), comP, spo0H and spo0A disrupted mutants. On the other hand, in the abrB single mutant bacA expression level increased nearly 2-fold during exponential growth and in the codY mutant it severely decreased during the stationary phase.
Benzer Tezler
- 12 haftalık yüzme temel eğitim çalışmalarının 7-12 yaş grubu kız ve erkek yüzücülerin fiziksel ve motorsal özellikleri üzerine etkisi
The effects of twelve weeks basic swimming training on physical and motorical qualifications of 7-12 years aged boy and girl swimmers
BAHAR ODABAŞ
- Huzurevinde kalan yaşlılara uygulanan 12 haftalık sportif rekreasyon programının bazı antropometrik ve fizyolojik parametrelere etkisinin incelenmesi
Researching the effects of the twelve weeks sporting recreational activities of old people who stay at a. rest home on some anthropometric appropriateness and physiologic parameters
ASLI TAŞKIRAN
- 8-10 yaş arası çocuklarda 12 haftalık tenise özgü antrenmanlarının görsel ve işitsel reaksiyon zamanına etkisinin incelenmesi
Inspection of the effects of twelve-week tennis courses on visual and auditory reaction times of 8-10 years old children
ŞENİZ KARAGÖZ
- The effects of using task-based language teaching activities on students' attitudes and vocabulary learning through the use of poetry in the classroom
Sınıfta görev tabanlı öğrenme yaklaşımıyla gerçekleştirilen şiir kullanımının öğrencilerin tutumları ve kelime öğrenmeleri üzerindeki etkileri
GÜLŞAH TIKIZ
- An empirical analysis of the trade liberalisation effects onthe gender wage gap: The case study of Latin American countries
Ticaret liberalizasyonunun cinsiyetlere göre ücret farkı üzerindeki etkilerinin ampirik bir analizi: Latin Amerika ülkeleri üzerine örnek bir inceleme
GÜLŞAH ADAM
