Expression analysis of nitrogenase genes in Rhodobacter sphaeroides O.U.001 grown under different physiological conditions
Farklı fizyolojik koşullarda üretilen Rhodobacter sphaeroides O.U.001'de nitrojenaz genlerinin ifadesi
- Tez No: 177486
- Danışmanlar: PROF. UFUK GÜNDÜZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Mikrobiyoloji, Biology, Genetics, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2008
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 134
Özet
Hidrojen temiz, yenilenebilir bir enerji kaynağı olarak büyük potansiyele sahiptir. Fotosentetik bir bakteri olan Rhodobacter sphaeroides O.U.001'de hidrojen üretimi nitrojenaz enzimi ile gerçekleşir. Nitrojenazın yapısal proteinlerini nifHDK genleri kodlamaktadır. Yapısal genlerin ifadesini kontrol eden NifA proteini, nifA geni tarafından kodlanmaktadır. Bu genin ifadesi ise prrA geninin ürünü olan protein ve Ntr sisteminin kontrolü altındadır.Biyolojik hidrojen üretimini artırmak için nitrojenaz üretiminde rol alan genlerin birbirleriyle olan ilişkisinin iyi anlaşılması gerekir. Bu tez çalışmasında nitrojenazı kodlayan nifH geni ve bu genleri kontrol eden nifA, prrA genlerinin ifade düzeyleri farklı fizyolojik ortamlarda incelenmiştir. Farklı derişimlerdeki amonyum kaynağına, oksijene ve değişik ışık şiddetlerine bağlı gen ifadesi düzeylerindeki değişimlerle birlikte, hidrojen üretimi ve üreme farklılıkları da incelenmiştir.Bu çalışmada, artan amonyum klorür derişimlerinin hidrojen üretiminde düşüşe neden olduğu görülmüştür. Glutamat içeren besiyeri, daha fazla hidrojen üretme kapasitesine sahiptir. nifH ve nifA genlerinin ifadesi artan amonyum klorür derişimlerinde azalmıştır. prrA geni ile kontrolündeki nifA genlerinin ifadesi birbiriyle ters orantılıdır. Aynı nitelikteki besiyerlerinde oksijenli ortamda da bir ölçüde hidrojen üretimi gözlenmiştir.Değişik besiyerlerinin ve farklı ışık şiddetlerinin, hidrojen üretimini ve üremeyi etkilediği görülmüştür. Farklı ışık şiddetlerinde üretilen hidrojen miktarıyla, nifH geninin ifade düzeyleri arasında doğru bir orantı saptanamamıştır.
Özet (Çeviri)
Hydrogen has an extensive potential as a clean and renewable energy source. Photosynthetic, non-sulphur, purple bacteria, Rhodobacter sphaeroides O.U.001 produces molecular hydrogen by nitrogenase enzyme. Nitrogenase enzyme is encoded by nifHDK genes and expression of the structural genes, nifHDK, is controlled by NifA which is encoded by nifA gene. The transcription of nifA is under the control of Ntr system and product of prrA gene.Relationship between the genes that have roles in nitrogenase synthesis should be understood well to increase biological hydrogen production. In this work, expression levels of nitrogenase encoding nifH and control genes nifA, prrA were examined at different physiological conditions. In addition to modifications in expression levels, changes in hydrogen production and growth capacity were also investigated in response to different concentrations of ammonium source, oxygen and different light intensities.In this study, it was found that increasing concentrations of ammonium chloride caused decrease in hydrogen production. Glutamate containing medium had the capacity for higher hydrogen production. The expression levels of nifH and nifA genes decreased with the increase in concentrations of ammonium chloride. There was a negative correlation between the expression levels of prrA gene and its target, nifA gene. Hydrogen production was observed even in aerobic conditions of the same media compositions.It was observed that different culture media had changing growth and hydrogen production capabilities at different light intensities. There was no direct proportion between the expression levels of nifH gene and amount of hydrogen at different light intensities.
Benzer Tezler
- Diazotrofik koşullarda çoğaltılan Rhodobacter sphaeroides O.U 001 ile hidrojen üretimi ve Nifh gen ifade analizi
Hydrogen production by rhodobacter sphaeroides O.U 001 grown under diazotrophic conditions and expression analysis of Nifh gene
MERVE SERT
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
GenetikNecmettin Erbakan ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÖKHAN KARS
- Transcriptional analysis of hydrogenase genes in Rhodobacter sphaeroides O.U.001
Rhodobacter sphaeroides O.U.001 hidrojenaz genlerinde ekspresyon çalışmaları
NİHAL DOĞRUSÖZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2004
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. MERAL YÜCEL
PROF.DR. UFUK GÜNDÜZ
- Hydrogen and poly-beta hydroxy butyric acid production and expression analyses of related genes in Rhodobacter capsulatus at different acetate concentrations
Farklı asetat konsantrasyonlarında Rhodobacter capsulatus?un poly- beta hidroksi bütirik asit ve hidrojen üretimi ve ilgili gen ifadelerinin incelenmesi
BURCU ÖZSOY
Yüksek Lisans
İngilizce
2012
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Bölümü
PROF. DR. UFUK GÜNDÜZ
YRD. DOÇ. DR. GÖKHAN KARS
- Microarray analysis of the effects of light intensity on hydrogen production metabolism of Rhodobacter capsulatus
Işık şiddetinin Rhodobacter capsulatus bakterisinin hidrojen üretim metabolizması üzerine etkilerinin mikrodizin yöntemi ile incelenmesi
MUAZZEZ GÜRGAN ESER
Doktora
İngilizce
2017
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE MERAL YÜCEL
YRD. DOÇ. HARUN KOKU
- Proteomic and genetic analyses of heat-resistant Rhodobacter capsulatus mutants with modified hydrogen production capacity
Isı stresine dayanıklı ve hidrojen üretim kapasiteleri farklılaşmış Rhodobacter capsulatus mutant suşlarının proteomik ve genetik analizleri
ABDULMECİT GÖKÇE
Doktora
İngilizce
2017
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR