Geri Dön

Karadeniz'in Türkiye kıyılarında dağılım gösteren mersin balığı türlerinin (Acipenser stellatus PALLAS, 1771, Acipenser gueldenstaedtii BRANDT, l833, Huso huso LINNAEUS, 1758)mitokondrial DNA sekans analizi yöntemiyle tanımlanmas

Characterization of three sturgeon species (A. stellatus Pallas, 1771, A. gueldenstaedtii Brandt, 1833, H. huso Linnaeus, 1758 ) from Black Sea Coasts of Turkey by mtDNA sequence analysis

PDF İndir

  1. Tez No: 179956
  2. Yazar: OĞUZHAN EROĞLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. İBRAHİM OKUMUŞ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Balıkçılık Teknolojisi, Su Ürünleri, Fisheries Technology, Aquatic Products
  6. Anahtar Kelimeler: Mersin Balığı, Türkiye, Karadeniz, MtDNA, Sekans analizi, Filogenetik, Heteroplazmi, Boy varyasyonu, Sturgeon, Turkey, Black sea, mtDNA, Cyt-b, Sequence Analysis, Phylogenetics, Heteroplasmy, Length Variation
  7. Yıl: 2008
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Balıkçılık Teknolojisi Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 164

Özet

ÖZETMersin balıklarının Tethis Denizi kökenli olduğu ve farklılaşma merkezinin Karadeniz olduğu düşünüldüğünde Türkiye çok önemli bir yere sahiptir. Türün tehlikede olmasından dolayı son yıllarda koruma ve yetiştiricilik faaliyetleri hız kazanmıştır. Karadeniz'deki mersin balığı türleri hakkında yapılmış çalışmalar bulunmasına rağmen Türkiye kıyılarından örnekleme yapılmamıştır.2005-2007 yılları arasında Türkiye kıyılarından örneklenen 4 türe ait (Acipenser stellatus, A. gueldenstaedtii, H. huso, A. baerii/benzeri) 82 bireyde mtDNA tRNAproD-loop geni boy varyasyonu ve heteroplazmi oranlarının belirlenmesinde kullanılmıştır. Ayrıca 28 örnekte Cyt-b geni sekans verilerinden genetik mesafeler ve filogenetik dendogramlar oluşturulmuş ve kladistik analizler yapılmıştır.Cyt-b geninde 19 haplotip ve % 81,8 - % 96,4 arasında değişen haplotip çeşitliliği belirlenmiştir. Türler arasında 7 yerde aminoasit kodlamasında değişim meydana geldiği belirlenmiştir. A+T oranı tüm türler için %52,6 ila 53,8 arasında bulunmuştur. Ti/Tv oranı A. gueldenstaedtii'de (9:1), A. stellatus'ta (7:2) ve Huso huso için (6:0) olarak bulunmuştur. Nükleotid çeşitliliği ve nükleotid farklılığının sırasıyla %0,167 - %0,378 ve 1,89 ? 4,2 arasında değiştiği belirlenmiştir. Türler arası mesafe Kimura-2 parametresine göre % 1,258 ? 5,288 arasında hesaplanmıştır. Filogenetik ağaçlar sonucunda %100'lük seç-bağla değeri ile türler ayrılmıştır.Karadeniz'de 1 adet A. baerii/benzer birey tespit edilmiştir. A. gueldenstaedtii örneklerinin Karadeniz soy grubu içerisinde yer aldığı ve 2 farklı gruba (A ve B) ayrıldığı belirlenmiştir. Benzer olarak A. stellatus örneklerinin de 2 gruba (S1 ve S2) ayrıldığı tespit edilmiştir. H. huso örneklerinde ayrılma görülmemiştir. Tüm türlerde heteroplazmik bireyler görülmüştür (%2,17-45,45) ve her tür için tekrar bölgesinin sayısı 2-6 olarak belirlenmiştir. Tekrar bölgesinin uzunluğu 82 bp olarak belirlenmiştir. En çok görülen tekrar ise % 39,5 ile 3 tekrarlı yapı olmuştur. Boy varyasyonu (Gıp) 0,656 -0,9871 olarak bulunmuştur.

Özet (Çeviri)

SUMMARYCharacterization of Three Sturgeon Species (A. stellatus Pallas, 1771, A. gueldenstaedtii Brandt, 1833, H. huso Linnaeus, 1758 ) from Black Sea Coasts of Turkey by mtDNA Sequence AnalysisIt has been thought that sturgeons originated from Tethys Sea, the Black Sea is the most important diversification center for them. Hence Turkey has a significant place through history. Recently, aquaculture and conservation activities have been increased due to being endangered species. Although there are some genetic studies about sturgeon species inhabiting the Black Sea, these studies don?t include samples from Turkey.In this study, length variation and heteroplasmy rates were determined from control region (D-loop) of mtDNA of 4 sturgeon species (n = 82), collected from Turkish coast of the Black Sea between 2005 and 2007. Besides, 28 specimen Cyt-b gene sequences were used to investigate phylogenetic relationship, and find out cladistic positions and genetic variation.Nineteen haplotypes and haplotypes diversity ranging from 81.8% to 96.4% were detected from Cyt-b sequences. Amino acid sequence changes were determined on 7 codon among species. Studied A+T rates were found between 52.6 and 53.8% for all species. Ti/Tv rates were estimated for each species; A. gueldenstaedtii (9:1), A. stellatus (7:2), and H. huso (6:0). Nucleotide diversity and nucleotide differences calculated for three species varied from 0.167 % - 0.378 % and 1.89 - 4.2 respectively. Genetic distances were calculated (1.258 - 5.288 %). Each species were separated between by phylogenetic reconstruction with high bootstrap value (100%). We determined A. baerii/like individual in A. gueldenstaedtii samples from the Black Sea. We found that all our A. gueldenstaedtii samples replaced in the Black Sea Linage and were separated 2 clades (A and B). Similarly A. stellatus samples were separated into 2 clades but H. huso samples were not separated. In each species heteroplasmic individuals (2. 17 - 45.45 %) and repeat units ranging from 2 to 6 with 82 bp length copies were observed. The most observed repeat units rate was 41.5% in 3 repeats morph. Length variation GIP were found between 0.656 -0.9871.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    100752

    Türkiye'de bitki örtüsü değerlerinin değişimi ve meteorolojik parametrelerle ilişkilendirilmesi

    The Variations of normalized difference vegetation index in Turkey and relationship between meteorological parameters

    DENİZ OKÇU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    Meteorolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    PROF.DR. ZAFER ASLAN

  2. Tez No

    606250

    Türkiye kıyılarında dağılım gösteren Pomatoschistus marmoratus (Risso,1810) popülasyonlarının genetik yapı analizi

    Genetic structure analysis of Pomatoschistus marmoratus (Risso, 1810) populations distributed in Turkish coasts

    DİLRUBA SEYHAN ÖZTÜRK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Su Ürünleriİzmir Katip Çelebi Üniversitesi

    Su Ürünleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMİH ENGİN

  3. Tez No

    696852

    Türkiye kıyılarında dağılım gösteren Nephtyidae, Glyceridae ve Goniadidae (Annelida: Polychaeta) türlerinin taksonomik ve ekolojik özellikleri

    Taxonomical and ecological features of Nephtyidae, Glyceridae and Goniadidae (Annelida: Polychaeta) distributed along the coast of Turkey

    SEVGİ KUŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Deniz BilimleriSinop Üniversitesi

    Su Ürünleri Temel Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÜLEY KURT COŞKUN

  4. Tez No

    492539

    Türkiye kıyılarında dağılım gösteren Syngnathus (Syngnathidae) cinsine ait türlerin filogenetik ilişkilerinin belirlenmesi

    Determination of the phylogenetic relationships of Syngnathus (Syngnathidae) species in Turkish seas

    ADNAN ÇAĞLAR ORUÇ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Su Ürünleriİzmir Katip Çelebi Üniversitesi

    Su Ürünleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMİH ENGİN

  5. Tez No

    894749

    Türkiye kıyılarında dağılım gösteren terebellidae (Annelida: Polychaeta) türlerinin taksonomik ve ekolojik özellikleri

    Taxonomic and ecological features of terebellidae (Annelida: Polychaeta) distributed along the coast of Turkey

    DENİZ ERDOĞAN DERELİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Deniz BilimleriEge Üniversitesi

    Su Ürünleri Temel Bilimleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MELİH ERTAN ÇINAR

Geri Dön