Identification and cloning of genes induced and / or repressed upon treatments of wheat plants (avocet S) with BTH, BABA and Trichoderma harzianum Raifi KRL-AG2
BTH, BABA veya trichoderma harzianum Raifi KRL-AG2 uygulamasıyla artan ve/veya azalan buğday bitki (avocet S) genlerinin tanımlanması ve klonlanması
- Tez No: 180840
- Danışmanlar: PROF.DR. MAHİNUR AKKAYA, Y.DOÇ.DR. CANDAN GÜRAKAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: farklılık gösterim tekniği, buğday, uyarılmış hastalıkdirençliliği genleri.vii, farklılık gösterim tekniği, buğday, uyarılmış hastalıkdirençliliği genleri.vii
- Yıl: 2006
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 141
Özet
ÖZBTH, BABA VEYA Trichoderma harzıanum Raifi KRL-AG2UYGULAMASIYLAARTAN VE/VEYA AZALAN BUĞDAY BİTKİ (AVOCET S) GENLERİNİNTANIMLANMASI VE KLONLANMASIAL-Asbahi, AdnanDoktora, Biyoteknoloji BölümüTez yöneticisi: Prof.Dr.Mahinur S. AkkayaOrtak Yöneticisi: Doç.Dr. Candan GürakanEkim, 122 sayfaTahılların üretimindeki en önemli sorun, bitki hastalıklarını kontrol ederkenyüksek kalite ve verim düzeyinin sürdürülmesidir. Buğday üretime en büyük zararıveren etmenler hastalığa neden olan parasitik bakteri, fungus ve virüslerdir. Bunedenle, modern tarımda buğdaydan başarılı bir şekilde yararlanmak için ön koşul,herhangi bir dirençlilik mekanizmasının anlaşılmış olmasıdır. Fungus, bakteri,mikrobiyal elisitör ve kimyasalların dirençliliği uyarması olgusu yaygın biçimdearaştırılmaktadır. Bu keşifler bitkilerdeki doğal bağışıklığa neden olan hastalığadirençlik yollarının bazı ortak öğelerinin olduğunu, ancak bunların çok azınınmoleküler düzeyde tanımlandığını göstermiştir. Bu sebeple, çalışmamızda buğdaybitkilerinin biyolojik bir elisitör olan Trichoderma harzianum küfüne ve benzo(1,2,3) tiyadiazol-7-karbotiyoik asit S-metil ester (BTH), Ã-aminobütiric asit(BABA) kimyasal indükleyicilerine maruz bırakılması ile aktive olan veyabaskılanan genlerin ortaya çıkarılması hedeflenmektedir.viİki hücre tipinde farklı ifade olmuş genlerin tanımlanmasında kuvvetli biraraç olan mRNA ?farklılık gösterim? teknolojisi, bu tezde kapsamlı bir şekildekullanılmıştır. Biyolojik elisitör Trichoderma harzianum küfü, kimyasal uyarıcılarBTH ve BABA ile muamele edilen `Avocet' çeşidine ait buğday bitkileri, muameleedilmemiş `Avocet' bitkileriyle karşılaştırıldığında aktive olan veya baskılanangenlerin bulunmasında kullanılmıştır. Farklı olarak ifade olduğu görülen cDNAbantları klonlanmış ve sekanslanmıştır. Farklı olarak ifade olduğu tanımlanancDNA bantlarının nükleotit dizileri gen bankalarında taranmıştır. Belirli bir genitemsil eden parçalar, dizi sıralaması ve hizalama yapılarak ClustalX-1.81 bilgisayarprogramında da aranmıştır.Biyolojik veya kimyasal muamele görenler ile muamele yapılmamış bitkilerarasındaki gen ifadesi farklılıklarının savunma reaksiyonu sonucunda oluştuğunuispat etmek amacıyla, farklı ifade edilmiş olan parçaların dizileri gerçek zamanlıPCR ile doğrulanmıştır. Doğrulanan genlerin doğrudan veya dolaylı olarak uyarılmışhastalık dirençliliğinde rol aldığı bulunmuştur. Bu genler, sistemik olarak kazanılmışdirençlilik (SAR) sinyalleyen savunma mekanizmalarının anlaşılması ve transgenikbuğday üretiminde yararlı olacaktır.
Özet (Çeviri)
ÖZBTH, BABA VEYA Trichoderma harzıanum Raifi KRL-AG2UYGULAMASIYLAARTAN VE/VEYA AZALAN BUĞDAY BİTKİ (AVOCET S) GENLERİNİNTANIMLANMASI VE KLONLANMASIAL-Asbahi, AdnanDoktora, Biyoteknoloji BölümüTez yöneticisi: Prof.Dr.Mahinur S. AkkayaOrtak Yöneticisi: Doç.Dr. Candan GürakanEkim, 122 sayfaTahılların üretimindeki en önemli sorun, bitki hastalıklarını kontrol ederkenyüksek kalite ve verim düzeyinin sürdürülmesidir. Buğday üretime en büyük zararıveren etmenler hastalığa neden olan parasitik bakteri, fungus ve virüslerdir. Bunedenle, modern tarımda buğdaydan başarılı bir şekilde yararlanmak için ön koşul,herhangi bir dirençlilik mekanizmasının anlaşılmış olmasıdır. Fungus, bakteri,mikrobiyal elisitör ve kimyasalların dirençliliği uyarması olgusu yaygın biçimdearaştırılmaktadır. Bu keşifler bitkilerdeki doğal bağışıklığa neden olan hastalığadirençlik yollarının bazı ortak öğelerinin olduğunu, ancak bunların çok azınınmoleküler düzeyde tanımlandığını göstermiştir. Bu sebeple, çalışmamızda buğdaybitkilerinin biyolojik bir elisitör olan Trichoderma harzianum küfüne ve benzo(1,2,3) tiyadiazol-7-karbotiyoik asit S-metil ester (BTH), Ã-aminobütiric asit(BABA) kimyasal indükleyicilerine maruz bırakılması ile aktive olan veyabaskılanan genlerin ortaya çıkarılması hedeflenmektedir.viİki hücre tipinde farklı ifade olmuş genlerin tanımlanmasında kuvvetli biraraç olan mRNA ?farklılık gösterim? teknolojisi, bu tezde kapsamlı bir şekildekullanılmıştır. Biyolojik elisitör Trichoderma harzianum küfü, kimyasal uyarıcılarBTH ve BABA ile muamele edilen `Avocet? çeşidine ait buğday bitkileri, muameleedilmemiş `Avocet? bitkileriyle karşılaştırıldığında aktive olan veya baskılanangenlerin bulunmasında kullanılmıştır. Farklı olarak ifade olduğu görülen cDNAbantları klonlanmış ve sekanslanmıştır. Farklı olarak ifade olduğu tanımlanancDNA bantlarının nükleotit dizileri gen bankalarında taranmıştır. Belirli bir genitemsil eden parçalar, dizi sıralaması ve hizalama yapılarak ClustalX-1.81 bilgisayarprogramında da aranmıştır.Biyolojik veya kimyasal muamele görenler ile muamele yapılmamış bitkilerarasındaki gen ifadesi farklılıklarının savunma reaksiyonu sonucunda oluştuğunuispat etmek amacıyla, farklı ifade edilmiş olan parçaların dizileri gerçek zamanlıPCR ile doğrulanmıştır. Doğrulanan genlerin doğrudan veya dolaylı olarak uyarılmışhastalık dirençliliğinde rol aldığı bulunmuştur. Bu genler, sistemik olarak kazanılmışdirençlilik (SAR) sinyalleyen savunma mekanizmalarının anlaşılması ve transgenikbuğday üretiminde yararlı olacaktır.
Benzer Tezler
- Kemoterapi ajanı Doksorubisin'in Escherichia coli üzerindeki etkisi ve dirençle ilgili genlerin genom boyu kütüphane zenginleştirme ve tarama çalışmaları ile araştırılması
Investigation of the effect of the chemotherapy agent doxorubicin on escherichia coli and the genes related to resistance by genome-wide library and screening studies
ANI ALTUĞ CURNA
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Tıbbi BiyolojiAydın Adnan Menderes ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHTAP KILIÇ EREN
- Metisilin dirençli staphylococcus aureus(MRSA)'dan elde edilen fajın karakterizasyonu ve faj komponenetlerini kullanarak in vitro rekombinant faj elde edilmesi
Characterization of phage obtained from methicilline resistant staphylococcus aureus (MRSA) and development of in vitro recombinant phage using phage components
ÖZLEM ULUSAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET KIYAN
- Serebral kavernoz malformasyon oluşumunda PDCD10 geninin rolü
The role of PDCD10 in cerebral cavernous malformation
GAMZE TANRIÖVER
Doktora
Türkçe
2009
GenetikAkdeniz ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NECDET DEMİR
PROF. DR. MURAT GÜNEL
- CRISPR/Cas9 genom düzenleme aracı kullanarak TGFBI geninde R124H mutasyonu oluşturmaya yönelik gRNA ve donör DNA tasarlama ve dh5α vektörüne klonlama
Design of donor DNA sequences with gRNA for creating the R124H mutation in the TGFBI gene and creation of CRISPR/Cas9 structures
BÜŞRA KALDIRIM
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Tıbbi BiyolojiSelçuk ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HİLAL ARIKOĞLU
- Aspergillus flavus karbonik anhidraz geninin klonlanması ve E. coli'de ekspresyonu
Cloning and expression of Aspergillus flavus carbonic anhydrase gene
ZARİF ECE CEYLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
BiyolojiBalıkesir ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TÜLİN AŞKUN
YRD. DOÇ. DR. HATİCE YILDIRIM