Geri Dön

Kolon kanseri tanılı olgularda PCR-RFLP metodu ile p53 gen mutasyonlarının saptanması

Detection of p53 gene mutations by using PCR-RFLP method in cases of colon cancer

PDF İndir

  1. Tez No: 181416
  2. Yazar: EMİNE DURHAN
  3. Danışmanlar: Y.DOÇ.DR. SERAP TUTGUN ONRAT
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Kolon kanseri, p53 geni, Ar72Pro, G13964C, PCR, RFLP, mutasyon, polimorfizm.II, Colon Cancer, p53 gene, Ar72Pro, G13964C, PCR, RFLP, mutation, polymorphism.II
  7. Yıl: 2006
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Afyon Kocatepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 139

Özet

Kolon kanseri sporadik veya kal-tsal olabilen yayg-n bir hastal-kt-r. Kanserolu.umunda etkili olan en önemli tümör süpressör gen p53'dür. Normal p53replikasyon s-ras-nda DNA tamirini kolayla.t-rarak hücre siklusunu G1'de durmas-naveya apoptosise (programlanm-. hücre ölümü) neden olmas-nda rol oynar. Arg72Propolimorfizm kolorektal kanserin erken evrelerinde ve belki cinsiyete ve bölgeye ba=l-olarak invasiv hastal-=a ilerlemede rol oynayabilir. p53 intron 6'daki nükleotitde=i.imleri tümör geli.iminde ve p53 fonksiyonun düzensizli=iyle ili.kili oldu=urapor edilmi.tir. G13964C baz de=i.imi missense, nonsense ve splice bölgemutasyonu benzer dominant mutasyon olarak görev yapar.Çal-.mam-zda 35 (20 kad-n ve 15 erkek) kolon kanser te.hisi konmu. kolon kanserdoku örneklerinden DNA izole edildi. Dokular- ya.lar- 40-90 aras-nda kad-n (ya.ortalamas- 65.95±2.76) ve ya.lar- 40-79 aras-ndaki erkek olmak üzere (61.67±3.07)Ikolon kanserli 35 olgudan topland-. Parafine gömülü dokudan, EZNA Doku DNAKiti kullanarak, genomik DNA elde edildi. G13964C (intron 6) varyant-n- belirlemekiçin PCR-RFLP metodunu kullan-ld-. p53 4. eksonu PCR metodu ile amplifiye ettikve BstFNI restriksiyon enzimi kullanarak 4. ekson için p53 mutasyon analizibelirlendi. p53 6. varyant-n- PCR metoduyla amplifiye ettik ve BstHHI enziminikullanarak 6. intron için p53 mutasyonunu saptand-. Arg72Pro polimorfizmi için 2(%7.4) olguda Pro/Pro, 14 (%51.9) olguda Arg/Arg ve 11 (% 40.7) olguda Arg/Progenotiplerini bulundu. G13964C polimorfizmi için 7 (%23.3) olguda GG, 21(%70.0) GC ve 2 (%6.7) olguda CC bulundu.2006, 126 sayfa

Özet (Çeviri)

Colon cancer is a common disease that can be sporadic or inherited. p53 is the mostimportant tumor suppressor gene that is effective in cancer formation. Normal p53acts by causing G1 cell-cycle arrest to facilitate DNA repair during replication or toinduce apoptosis (programmed cell death). Arg72Pro may play a role in the earlystages of colorectal neoplasia and possibly in progression to invasive disease,depending on site and sex. Nucleotide alterations in p53 intron 6 have been reportedto be associated with the dysregulation of p53 function and tumor development.G13964C base change functioned as dominant mutation similar to the more commonmissense, nonsense and splice-site mutations.IIn this study, DNA was isolated from colon cancer tissue samples of (20 females and15 males) 35 cases diagnosed to be colon carcinoma. Tissues were collected from 35cases with colon cancer ages of female 40-90 (mean age 65.95±2.76) and ages ofmale 40-79 (mean age 61.67±3.07). Genomic DNA was extracted from paraffinembedded tissues using EZNA Tissue DNA Kit (Omega) following the protocol. Todetect the Arg72Pro region (exon 4) and G13964C variant (intron 6) PCR-RFLPassay was used. After then 4th exon of p53 were amplified by PCR method and p53mutation analyses was performed by using BstFNI restriction enzyme determined for4th exon. After then 6th variant of p53 were amplified by PCR method and p53mutation analyses was performed by using BstHHI restriction enzyme determined for6th intron. In 2 (%7.4) cases Pro/Pro, in 14 (%51.9) cases Arg/Arg and in 11 (% 40.7)Arg/Pro were found for Arg72Pro polymorphism. In 7 (%23.3) cases G/G, in 21(%70.0) cases G/C and in 2 (%6.7) C/C were found for G13964C polymorphism2006, 126 page

Benzer Tezler

  1. Tez No

    171361

    Lösemili çocuklarda mannoz bağlayıcı lektin gen polimorfizmleri ve nötropenik ateş ataklarına etkisi

    Başlık çevirisi yok

    NAZAN ÇETİNGÜL

    Tıpta Yan Dal Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıEge Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KAAN KAVAKLI

  2. Tez No

    452572

    KOAH'lı hastalarda MBL (mannoz binding lektin) gen polimorfizmi

    MBL(mannose binding lectin) gene polymorphism in copd patients

    ÇİĞDEM TURAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Göğüs HastalıklarıEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Göğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET SİNAN ERGİNEL

  3. Tez No

    171669

    Mesane kanseri tanılı olgularda p53 geni mutasyon analizi

    p53 gene mutation analysis in cases with bladder cancer

    ASUMAN ÖZGÖZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Tıbbi BiyolojiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MUSTAFA SOLAK

  4. Tez No

    334206

    Neoplazi şüphesi nedeniyle uygulanan endometrium biyopsilerinde ve neoplazi tanısı ile histerektomi uygulanan olgularda mikrosatellit instabilitesinin araştırılması

    Investigation of microsatellite instability in endometrium biopsies performed for neoplasia suspicion and in neoplasia patients underwent histerectomy

    CEMAL EKİCİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Tıbbi BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. TİMUR TUNCALI

  5. Tez No

    437980

    Muğla bölgesindeki kolorektal kanser hastalarında PIK3CA genindeki bazı bölgelerin mutasyon analizi

    Mutation analysis of some regions of PIK3CA gene of colorectal cancer patients in Mugla region

    TANER KAYNAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    GenetikMuğla Sıtkı Koçman Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. BEKİR ÇÖL

Geri Dön