X-ışınları kırınımı ile o-vanilin türevi azo ve azometin bileşiklerin yapı analizleri
X-ray structure determination of o-vanillin derivatives, azo and azomethyn compounds
- Tez No: 185714
- Danışmanlar: PROF. DR. ORHAN BÜYÜKGÜNGÖR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Schiff bazları, keto-fenol tautomerisi, azo bileşikleri, Schiff bases, keto-fenol tautomeric form, azo complexes
- Yıl: 2006
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 149
Özet
iÖZETBu çalışmada, Schiff bazı olan (C14H13NO3) ?(Z)-3-hidroksi-6-[(2-metoksifenilamino)metilen]siklohekza-2,4-dienon?, (C15H12F3NO2) ?(E)-2-Metoksi-6-[(2-triflorometilfenilimino)metil]fenol?, (C14H13NO3) ?2-Hidroksi-6-[(2-metoksifenil)aminometilen]siklohekza-2,4-dienon? kristallerinin, azo ve azometin gruplarına sahip(C20H25N3O5) ?(E)-2-[1,3-Dihidroksi-2-(hidroksimetil)propan-2-iliminometilen]-4-[(4-etilfenil)diazenil]-6-metoksisiklohekzanon? kristalinin ve azo boyarmadde olan(C14H11BrN2O3) ?(E)-5-[(3-bromofenil)diazenil]-2-hidroksi-3-metoksibenzaldehit?,(C14H11FN2O3) ?(E)-5-[(2-florofenil)diazenil]-2-hidroksi-3-metoksibenzaldehit?kristallerinin yapıları, tek kristal x-ışınları kırınımı yöntemiyle tayin edilmiştir.Kristallerin verileri, STOE IPDS II difraktometresi ile toplanmıştır. Yapılar, SHELXS-97 (Sheldrick, 1997) programı yardımı ile direkt yöntemler kullanılarak çözülmüş veSHELXL-97 (Sheldrick, 1997) programı yardımı ile en küçük kareler yöntemi ilearıtılmıştır.C14H13NO3, (I), Ortorombik, P212121, a=8.3391(7)Ǻ, b=11.1748(15)Ǻ,3 -3c=13.8056(19)Ǻ, V=1286.5(3)Ǻ , Z=4, Dx=1.256Mgm , λ(MoKα)=0.71073Ǻ,μ=0.089mm-1, T=296K, R=0.0593, wR=0.1919, S=0.973.C14H13NO3 kapalı formülüne sahip Schiff bazının {(Z)-3-hidroksi-6-[(2-metoksifenilamino)metilen]siklohekza-2,4-dienon} keto-amin tautomerik yapıda olduğugörülmüştür. Aromatik halkaların düzlemleri arasındaki dihedral açı 14.3(2)° dir.Yapıda molekül içi N-Hâ¦O ve moleküller arası O-H...O hidrojen bağları vardır. Ayrıcayapıda moleküller arası Ï-halka etkileşimi de bulunmaktadır.C15H12F3NO2, (II), Ortorombik, P212121, a=5.2070(5)Ǻ, b=14.0918(18)Ǻ,V=1333.5(3)Ǻ3, Dx=1.471Mgm-3,c=18.1737(18)Ǻ, Z=4, λ(MoKα)=0.71073Ǻ,μ=0.13mm-1, T=296K, R=0.054, wR=0.123, S=0.89.C15H12F3NO2 kapalı formülüne sahip Schiff bazının {(E)-2-Metoksi-6-[(2triflorometilfenilimino)metil]fenol} fenol-imin tautomerik yapıda olduğugörülmüştür. Aromatik halkaların düzlemleri arasındaki dihedral açı 17.83(19)° dir.Yapı molekül içi O-Hâ¦N ve O-Hâ¦F hidrojen bağlarına sahiptir. Molekülün aynızamanda üç boyutta kristal örgüyü şekillendiren üç tane C-H...F ve iki tane C-Hâ¦Oiimoleküller arası hidrojen bağı vardır. Ayrıca yapıda moleküller arası Ï-halka etkileşimibulunmaktadır.C14H13NO3, (III), Monoklinik, P21/n, a=7.5517(7)Ǻ, b=11.3022(12)Ǻ,V=1144.5(2)Ǻ3, Dx=1.412Mgm-3,c=13.4646(13)Ǻ, β=95.186(8)°, Z=4,λ(MoKα)=0.71073Ǻ, μ=0.10mm-1, T=296K, R=0.038, wR=0.096, S=0.85.?2-Hidroksi-6-[(2-metoksifenil)aminometilen]siklohekza-2,4-dienon? molekülününneredeyse düzlemsel olduğu görülmüştür. Ayrıca C14H13NO3 kapalı formüllü Schiffbazının keto-amin tautomerik form da olduğu tespit edilmiştir. Yapıda molekül içi N-Hâ¦O ile moleküller arası O-Hâ¦O ve C-Hâ¦O hidrojen bağı gözlenmiştir. Ayrıcayapıda moleküller arası Ï-halka etkileşimi bulunmaktadır.C20H25N3O5, (IV), Monoklinik, P21/c, a=17.0925(16)Ǻ, b=10.6353(6)Ǻ,3Dx=1.345Mgm-3,c=10.6634(9)Ǻ, β=99.263(7)°, V=1913.2(3)Ǻ , Z=4,λ(MoKα)=0.71073Ǻ, μ=0.10mm-1, T=150K, R=0.058, wR=0.174, S=1.05.Kapalı formülü C20H25N3O5 olan azo-azometin bileşiğinin {(E)-2-[1,3-Dihidroksi-2-(hidroksimetil)propan-2-iliminometilen]-4-[(4-etilfenil)diazenil]-6-metoksisiklohekzanon} keto-amin tautomerik yapıda olduğu görülmüştür. N=N çift bağ uzunluğu 1.232(3)Ǻ olarak bulunmuş olup bu değerin literatürle uyumlu olduğu görülmüştür. Kristalyapıda moleküller, molekül içi N-Hâ¦O ve O-Hâ¦O, moleküller arasında ise O-H...Ohidrojen bağlarına sahiptir.C14H11BrN2O3, (V), Ortorombik, Pbcn, a=12.5131(6)Ǻ, b=13.2636(6)Ǻ,V=2748.3(2)Ǻ3, Dx=1.620Mgm-3,c=16.5594(7)Ǻ, Z=8, λ(MoKα)=0.71073Ǻ,-1μ=3.00mm , T=296K, R=0.037, wR= 0.091, S=1.03.?(E)-5-[(3-bromofenil)diazenil]-2-hidroksi-3-metoksibenzaldehit? bileşiği transkonfigürasyona sahiptir ve iki fenil halkası arasındaki dihedral açı 8.71(12)° olarakbulunmuştur. N=N çift bağ uzunluğu 1.257(3) Ǻ olarak bulunmuş olup bu değerinliteratürdeki değerlerden yüksek olduğu görülmüştür. Yapıda molekül içi O-Hâ¦Ohidrojen bağı gözlenmiştir. Ayrıca yapıda moleküller arası Ï-halka ve Ï-Ï etkileşimleribulunmaktadır.iiiC14H11FN2O3, (VI), Monoklinik, Cc, a=10.7956(8)Ǻ, b=13.7521(13)Ǻ,3 -3c=8.3078(6)Ǻ, V=1232.42(17)Ǻ , Z=4, Dx=1.478Mgm , λ(MoKα)=0.71073Ǻ,-1μ=0.12mm , T=296K, R=0.030, wR=0.083, S=1.06.?(E)-5-[(2-florofenil)diazenil]-2-hidroksi-3-metoksibenzaldehit? bileşiği transkonfigürasyona sahiptir ve iki fenil halkası arasındaki dihedral açı 10.13(8)° olarakbulunmuştur. Yapıda molekül içi O-Hâ¦O hidrojen bağı gözlenmiştir. Ayrıca yapıdamoleküller arası Ï-Ï etkileşimi bulunmaktadır.
Özet (Çeviri)
ivABSTRACTIn this study, the Schiff base crystals of (C14H13NO3) ?(Z)-3-hydroxy-6-((2-methoxyphenylamino)methylene)cyclohexa-2,4-dienone?, (C15H12F3NO2) ?(E)-2-methoxy-6-((2-(trifluoromethyl)phenylimino)methyl)phenol?, (C14H13NO3) ?2-Hydroxy-6-[(2-methoxy-phenylamino)-methylene]-cyclohexa-2,4-dienone?, the azo andazometin containing crystal of (C20H25N3O5) ?(E)-2-{[1,3-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)propan-2-ylimino]methyl}-4-[(4-ethylphenyl)diazenyl]-6-methoxycyclohexanone? and crystals of (C14H11BrN2O3) ?(E)-5-[(3-bromophenyl)diazenyl]-2-hydroxy-3-methoxybenzaldehyde?, (C14H11FN2O3) ?(E)-5-[(2-fluorophenyl)diazenyl]-2-hydroxy-3-methoxybenzaldehyde? which contain only azo group have beendetermined by single crystal x-ray diffraction technique. The structure determination ofall crystals have been carried out using the method of single crystal x-ray diffraction.The data of crystals were collected with a STOE IPDS II diffractometer. The structureshave been solved by direct methods with the program SHELXS-97 (Sheldrick, 1997)and refined using least squares refinement with the program SHELXL-97 (Sheldrick,1997).C14H13NO3, (I), Orthorhombic, P212121, a=8.3391(7)Ǻ, b=11.1748(15)Ǻ,3 -3c=13.8056(19)Ǻ, V=1286.5(3)Ǻ , Z=4, Dx=1.256Mgm , λ(MoKα)=0.71073Ǻ,μ=0.089mm-1, T=296K, R=0.0593, wR=0.1919, S=0.973.Schiff base crystal of (C14H13NO3) ?(Z)-3-hydroxy-6-((2-methoxyphenylamino)methylene)cyclohexa-2,4-dienone? has keto-amine tautomeric structure with the angleof 14.3(2)° between the planes of the aromatic rings. In the structure, intramolecular N-Hâ¦O and intermolecular O-Hâ¦O hydrogen bonding were observed. There is alsointermolecular Ï-ring interaction in the structure.C15H12F3NO2, (II), Orthorhombic, P212121, a=5.2070(5)Ǻ, b=14.0918(18)Ǻ,V=1333.5(3)Ǻ3, Dx=1.471Mgm-3,c=18.1737(18)Ǻ, Z=4, λ(MoKα)=0.71073Ǻ,μ=0.13mm-1, T=296K, R=0.054, wR=0.123, S=0.89.Schiff base crystal of (C15H12F3NO2) ?(E)-2-methoxy-6-[(2-(trifluoromethyl)phenylimino)methyl]phenol? has fenol-imine tautomeric structure with the angle ofv17.83(19)° between the planes of the aromatic rings. In the structure, intramolecular O-Hâ¦N and O-Hâ¦F hydrogen bonding were observed. The structure has also three C-Hâ¦F and two C-Hâ¦O intermolecular hydrogen bonds and intermolecular Ï-ringinteraction.C14H13NO3, (III), Monoclinic, P21/n, a=7.5517(7)Ǻ, b=11.3022(12)Ǻ,V=1144.5(2)Ǻ3, Dx=1.412Mgm-3,c=13.4646(13)Ǻ, β=95.186(8)°, Z=4,λ(MoKα)=0.71073Ǻ, μ=0.10mm-1, T=296K, R=0.038, wR=0.096, S=0.85.?2-Hydroxy-6-[(2-methoxy-phenylamino)-methylene]-cyclohexa-2,4-dienone?complex has an almost planar structure. In addition to this feature it was determined tobe in keto-amin tautomeric form. In the structure, intramolecular N-Hâ¦O andintermolecular O-Hâ¦O and C-Hâ¦O hydrogen bonding were observed. It has also seenthat there is intermolecular Ï-ring interaction in the structure.C20H25N3O5, (IV), Monoclinic, P21/c, a=17.0925(16)Ǻ, b=10.6353(6)Ǻ,V=1913.2(3)Ǻ3, Dx=1.345Mgm-3,c=10.6634(9)Ǻ, β=99.263(7)°, Z=4,λ(MoKα)=0.71073Ǻ, μ=0.10mm-1, T=150K, R=0.058, wR=0.174, S=1.05.Azo and azometin containing crystal of (C20H25N3O5) ?(E)-2-[1,3-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)propan-2-yliminomethyl]-4-[(4-ethylphenyl)diazenyl]-6-methoxycyclohexanone? has keto-amine tautomeric form with the N=N bond length of 1.232(3) Ǻand this value is in a good agreement with the reported values. The crystal packing isstabilized by intramolecular [N-Hâ¦O and O-Hâ¦O] and intermolecular [O-Hâ¦O]hydrogen bonding interactions.C14H11BrN2O3, (V), Orthorhombic, Pbcn, a=12.5131(6)Ǻ, b=13.2636(6)Ǻ,V=2748.3(2)Ǻ3, Dx=1.620Mgm-3,c=16.5594(7)Ǻ, Z=8, λ(MoKα)=0.71073Ǻ,μ=3.00mm-1, T=296K, R=0.037, wR= 0.091, S=1.03.?(E)-5-[(3-bromophenyl)diazenyl]-2-hydroxy-3-methoxybenzaldehyde? complexhas a trans configuration and the dihedral angle between the two phenyl rings is8.71(12)°. The N=N bond length is 1.257(3) Ǻ and this value is longer than the reportedvalues. In the structure, intramolecular O-Hâ¦O hydrogen bonding was observed. It hasalso seen that there are intermolecular Ï-ring and Ï-Ï interactions in the structure.viC14H11FN2O3, (VI), Monoclinic, Cc, a=10.7956(8)Ǻ, b=13.7521(13)Ǻ,3 -3c=8.3078(6)Ǻ, V=1232.42(17)Ǻ , Z=4, Dx=1.478Mgm , λ(MoKα)=0.71073Ǻ,μ=0.12mm-1, T=296K, R=0.030, wR=0.083, S=1.06.?(E)-5-[(2-fluorophenyl)diazenyl]-2-hydroxy-3-methoxybenzaldehyde? complexhas a trans configuration and the dihedral angle between two phenyl rings is 10.13(8)°.In the structure, intramolecular O-Hâ¦O hydrogen bonds and intermolecular Ï-Ïinteractions were observed.
Benzer Tezler
- Bazı azo ve ftalonitril bileşiklerinin sentezi ve spektroskopik özelliklerinin incelenmesi
Synthesis and investigation of spectroscopic properties of some azo and phtalonitrile compounds
ÇİĞDEM ALBAYRAK
Doktora
Türkçe
2008
KimyaOndokuz Mayıs ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İSMAİL ERDEM GÜMRÜKÇÜOĞLU
- X-ışınları kırınımı ile C22H10N4O2, C36H42O3, C14H11N2O2Cl, C16H16N2O3 ve C22H16N4O organik moleküllerinin kristal yapılarının incelenmesi
Investigation of crystal structure of C22H10N4O2, C36H42O3, C14H11N2O2Cl, C16H16N2O3 and C22H16N4O organic molecules by X-ray diffraction
ÖZLEM DEVECİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
Fizik ve Fizik MühendisliğiOndokuz Mayıs ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ŞAMİL IŞIK
- X-ışınları kırınımı ile C14H15N3O2S, C13H22N6O2.2H2O, C14H11N2O2Cl, C14H11N2O2Br, C20H16N2O2 organik moleküllerinin yapı analizleri
Structure analyses of C14H15N3O2S, C13H22N6O2.2H2O, C14H11N2O2Cl, C14H11N2O2Br and C20H16N2O2 organic molecules with X-ray diffraction
GONCA ÖZDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
Fizik ve Fizik MühendisliğiOndokuz Mayıs ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
Y.DOÇ.DR. ŞAMİL IŞIK
- X-Işınları kırınımı ile C2H2O4.2H2O'nun kristal yapısının araştırılması ve safra taşlarının nitel analizi
Investigation of the crystal structure of the C2H2O4.2H2O with x-ray diffraction and qualitative analysis of the stones of gall
HASAN KAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
1995
Fizik ve Fizik MühendisliğiErciyes ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. MEHMET AKKURT
- X-ışınları kırınımı ile C19H23N3O5, C13H11NO3, C8H12N2O3 VE C13H29N3O5 organik moleküllerinin yapı analizleri
The structure analyses of C19H23N3O5, C13H11NO3, C8H12N2O3 VE C13H29N3O5 organic molecules by X-ray diffraction
BAŞAK KOŞAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
Fizik ve Fizik MühendisliğiOndokuz Mayıs ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ORHAN BÜYÜKGÜNGÖR