RNAi mediated cholinesterase co-regulation in the embryonic rat retinal cell line R28 and interactions with the ERK signaling pathway
Kolinesterazların embriyonik sıçan retina hücre dizisi R28'de ortak düzenlenmelerinin RNAi ile incelenmesi ve ERK sinyal iletim yolu ile etkileşimleri
- Tez No: 194070
- Danışmanlar: PROF.DR. A. NEŞE ÇOKUĞRAŞ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biyoteknoloji, Moleküler Tıp, Biochemistry, Biotechnology, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: asetilkolinesteraz, butirilkolinesteraz, RNAi, ERK sinyal yolu, retina kültürü, Acetylcholinesterase, Butyrylcholinesterase, RNAi, ERK signaling, retinal cell culture
- Yıl: 2005
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 149
Özet
Sinir gelişimi süresince kolinesterazlar (ChE) sıralı bir ekspresyon izlerler.Hücre çoğalmasında butirilkolinesteraz (BChE) ekspresyonu gözlenirken; farklılaşmada asetilkolinesteraz(AChE) ekspresyonu başlar. Bu sıralı ekspresyon kolinesterazlar arasında ortak birdüzenlenme olduğunu düşündürmektedir. Embriyonik sıçan retinası kökenli R28hücre dizisi kullanarak ChE ortak düzenlenmesi ve sinyal iletim yolları ile ilişkileriincelemiştir. BChE ekspresyonu, RNA girişimi (RNAi) ile BChE'ye özgü siRNAtasarlanıp kullanılarak susturulmuş ve sistemdeki değişim RT-PCR, Western Blot,enzim aktivite tayini ve immunohistokimyasal yöntemler kullanılarak molekülerdüzeyde incelenmiştir. BChE susturumu ile hem mRNA hem de proteinseviyelerinde AChE artışı gözlenmiş ve ChE'ler arası ortak düzenlenmede BChEmRNA'sı miktarının rol oynadığı bulunmuştur. Ortak düzenlenim ile ilişkili sinyaliletim yolları çalışmasında hücre çoğalması ve farklılaşmasında görev alan ProteinKinaz C (PKC) ve ERK yolları incelenmiştir. BChE susturumu α-PKC'de iki katartışa yol açarken fosfo-ERK1 ve ERK2'de değişken etkinliğe neden olmuştur.Transfeksiyon sonrası 24. saatte her iki ERK proteinin aktif formları dörtte birseviyelerine düşerken 48. saatte fosfo-ERK2'de iki kat artış gözlenmiştir. ERK2substratları fosfo-P90rsk1 ve c-fos'ta artış gözlenirken Elk-1'de bir etkigörülmemiştir. Bulgular, R28 hücre dizisinde ChE'lerin ERK, PKC yolları ile ilişkiliolup P90rsk1 ve ERK sinyal düzenlenmesinde rol aldıklarına işaret etmektedir.
Özet (Çeviri)
During neuronal development cholinesterases display sequential expressions; butyrylcholinesterase(BChE) is associated with cell proliferation and acetylcholinesterase (AChE) with differentiationdemonstrating the existence of a co-regulation. RNA interference was employed in the rat embryonicretinal cell line R28 to analyze the molecular basis for cholinesterase co-regulationand their interactions with signaling pathways. Expression studies were done by RT-PCR, Western Blot, enzymatic analysis and immunohistochemistry. Short interferingRNAs (SiRNAs) against rat BChE were designed to successfully knock down BChEexpression. This resulted in a higher expression of AChE at both mRNA and proteinlevels, showing that the amount of available BChE mRNA was involved in ChE co-regulation. To resolve cell-internal proliferation and/or differentiation relatedpathways associated with ChE co-regulation, the Protein Kinase C (PKC) and ERKsignaling pathways were investigated. BChE knockdown caused a two-fold increasein α-PKC. During knockdown, 4-fold decreases in phospho-ERK1 and ERK2 werefound at 24 hrs after transfection followed by a two-fold increase in phospho-ERK2at 48 hrs post transfection. As downstream targets of ERK2 after BChE knockdown,Western blot analyses displayed an activation of phospho-P90RSK1 and an increasein c-fos expression, but no Elk-1 involvement. These findings indicate that duringdevelopment cholinesterases are participating in an intricate cross-talk betweenERK- and PKC-dependent pathways, and that the ChE modulate transcriptionalactivator P90RSK1 and ERK signaling in the R28 cell line.
Benzer Tezler
- Nesprin-1 is required to maintain genomic stability and preventtumorigenesis
Başlık çevirisi yok
İLKNUR SUR
- Marul mozaik virüsü, marul nekrotik bodurluk virüsü ve marul nekrotik sarılık virüsü'nü hedefleyen miRNA'ların in siliko yaklaşımlarla belirlenmesi
Determination of miRNAs targeting lettuce mosaic virus, lettuce necrotic stunt virus and lettuce necrotic yellows virus using in silico approaches
EDA ÖZKESER
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Bilim ve TeknolojiYıldız Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEVGİ MARAKLI
- Investigating the role of CYP2W1 in cancer progression
CYP2W1'in kanser ilerlemesindeki rolünün incelenmesi
MERVE AKKULAK
Doktora
İngilizce
2023
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ORHAN ADALI
DR. EMRE EVİN
- Cellular role of a protocadherin family member in mammalian cells
Protocadherin aile üyesinin memeli hücrelerindeki hücresel rolü
SELDA BÜLBÜL
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
GenetikKoç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NURHAN ÖZLÜ