Geri Dön

Hastalık gen ilişki çalışmalarında kullanılan bayesçi yöntemlerin incelenmesi

Analysis of bayesian models used for case-control studies

PDF İndir

  1. Tez No: 194449
  2. Yazar: AYSUN ÇETİNYÜREK
  3. Danışmanlar: Y.DOÇ.DR. ATİLLA HALİL ELHAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoistatistik, Biostatistics
  6. Anahtar Kelimeler: Bayesçi, genetik epidemiyoloji, HW dengesi, İlişkianalizi, MZMC, Bayesian, genetic epidemiology, HW equilibrium, asociationanalysis, MCMC
  7. Yıl: 2006
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoistatistik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 87

Özet

Genetik epidemiyoloji, hastalık ve genetik yapı arasındaki ilişkininincelendiği süreçtir. Bu süreçte hastalığın kalıtsal olup olmadığından başlanarak,kalıtsal olduğu düşünülen hastalıklar için çeşitli analizlerle hastalığa neden olangen(ler) bulunmaya çalışılır. Tek gen hastalıkları basit analizlerle bulunabilirkensöz konusu hastalıklar kompleks hastalıklar olduğunda analizler karmaşıklaşır.Hastalık gen ilişki çalışmaları, bağlantı analizini tamamlayıcı olarakyapılan analizlerdir. Bu analizler sayesinde hastalıkla genotipik ve alelik bazdailişki olup olmadığı test edilir. Lojistik regresyon analizi kullanılarak genotiplerinhastalığa olan etkisi araştırılır.Çalışmamızda, Bayesçi yöntemlerin hastalık gen ilişki çalışmalarındakullanımı, Bayesçi modelleri uygulayabilmek için Markov Zinciri Monte Carlo(MZMC) yöntemleri kullanılacaktır. Ayrıca, popülasyon genetiğinin temelprensiplerinden Hardy Weinberg dengesinin analize etkisi araştırılmıştır.Sonuç olarak önsel bilgi ve Hardy Weinberg dengesinin bulunupbulunmamasına göre lojistik regresyon, geriye dönük modeller, bayesçi lojistikregresyon sonuçları iki lokus için karşılaştırılmıştır. Değişik durumlarda geriyedönük modeller ve bayesçi lojistik regresyon arasında seçim yapılmasıönerilmiştir.

Özet (Çeviri)

Genetic epidemiology is the process of analysing the association betweena disease and genetic components. In this process, first of all, it is determinedthat whether the disease is genetically inherited, then if the disease has geneticcomponent, disease predisposing/causing gene(s) are searched. The analysisof monogenic diseases are easier than that of complex diseases.Disease-gene association studies are complementary to linkage studies.By doing these studies, the association between the disease and the gene isanalyzed at both allelic and genotypic levels. Logistic regression analysis isused to determine the effect of genotype to the disease.In this study, the usage of bayesian methods in disease-gene associationstudies and the usage of MCMC techniques which makes possible to apply thebayesian models are shown. In addition, the effect of Hardy WeinbergEquilibrium, the basic principle of population genetics, is also included.As a result, depending on usage of prior knowledge and Hardy Weinbergequilibrium, logistic regression, retrospective models and bayesian logisticregression results are compared for two loci. Under different situations,retrospecive model or bayesian logistic regression should be preferred.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    541876

    Rupture status investigation of patient specific cerebral aneurysms by analysing hemodynamic factors using computational fluid dynamics

    Hesaplamalı akışkanlar dinamiği kullanarak hemodinamik faktörlerin analizi ile hastaya özgü beyin anevrizmalarının yırtılma durumu incelemesi

    GÜLBAHAR MERVE NARİNSES

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik Üniversitesi

    Hesaplamalı Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA SERDAR ÇELEBİ

  2. Tez No

    150702

    Önemli zeytin (Olea europaea L.) çeşitlerinin izoenzim polimorfizmleri ve genetik özellikleri

    Isoenzyme polymorphisms and genetic characteristics of important olive (Olea europaea L.) cultivars and types

    SEVDA DÜLGER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MURAT ŞEKER

  3. Tez No

    829470

    Behavioral and genetic evaluation of the effect of prenatal stress on functional cerebral asymmetries in rats

    Ratlarda prenatal stresin fonksiyonel serebral asimetri üzerindeki etkisinin davranişsal ve genetik açidan değerlendirilmesi

    SEVİM ISPARTA

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Veteriner HekimliğiAnkara Üniversitesi

    Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BENGİ ÇINAR KUL

    PROF. DR. ONUR GÜNTÜRKÜN

  4. Tez No

    877548

    Inherited myopathies and congenital myasthenic syndromes in a cohort from different regions of Turkey

    Türkiye'nin farklı bölgelerinden bir kohort çalışması: kalıtsal miyopatiler ve konjenital miyastenik sendrom'un moleküler analizi

    ESMER ZEYNEP DURU BADAKAL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyolojiKoç Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE NAZLI BAŞAK

  5. Tez No

    828662

    Dikkat eksikliği hiperaktivite bozukluğu tanılı çocuk ve ergenlerde ADRA 2A-rs1800544, slc6a4-5HTTLPR ve SLC6A2-rs28386840 gen polimorfizmlerinin tedavi yanıtı ve yan etki profili ile ilişkisinin araştırılması

    Profile of ADRA 2A-rs1800544, SLC6A4-5HTTLPR and slc6a2-rs28386840 gene polymorphisms in children and adolescents diagnosed with attention deficit hyperactivity disorder

    FATMA HUZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    PsikiyatriTrakya Üniversitesi

    Çocuk Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ HASAN CEM AYKUTLU

Geri Dön