Geri Dön

Fasciola hepatica cathepsin l2 geninin klonlanması ve DNA dizilemesinin belirlenmesi

Cloning and sequencing of Fasciola hepatica cathepsin l2 DNA

  1. Tez No: 194549
  2. Yazar: SERPİL BAŞPINAR
  3. Danışmanlar: DOÇ.DR. MUSTAFA KAPLAN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Parazitoloji, Parasitology
  6. Anahtar Kelimeler: F. hepatica, cathepsin L2, klonlama, nükleotid dizilemi, soyağacı, F. hepatica, cathepsin L2, cloning, nucleotide sequencing, phylogenetic tree
  7. Yıl: 2007
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Fırat Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Parazitoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 66

Özet

Fasciolosis Fasciola hepatica'nın insan ve hayvanlarda neden olduğu paraziter birhastalık olup tüm dünyada ve Türkiye'de sık görülmektedir. Elazığ ve çevresinde isesporadik olgular şeklinde görülmekte olup sağlıklı bireylerde fasciolosis seroprevalansının%2.78 olduğu bildirilmektedir.Fasciolosisin kesin tanısı dışkıda yumurtaların saptanması ile yapılmaktadır. Ancakhastalığın akut döneminde, ektopik yerleşimlerde ve yalancı parazitlik durumlarında bumümkün olmamakta ve serolojik testler kullanılmaktadır.Fasciola hepatica'nın ekskretuvar-sekretuvar antijenlerinin büyük bir bölümünüoluşturan proteazlar F. hepatica'ya özgül olmaları ve antijenik yapıları nedeniyle tanıyöntemlerinde ve korunma amcıyla immünizasyon çalışmalarında kullanılabilecekpotansiyel bir moleküldür. Bu çalışmada F. hepatica cathepsin L2 geninin klonlanması vegen dizilmesinin belirlenmesi amaçlanmıştır.Bu çalışmada doğal olarak infekte sığır karaciğerinden elde edilen F. hepatica'dantoplam RNA elde edildi ve RNA'dan cathepsin L2 cDNA oluşturuldu. PZR ile çoğaltılancathepsin L2 cDNA pGEM-T Easy vektörüne yerleştirildi. Oluşturulan ve pGEM-T CL2olarak adlandırılan rekombinant vektör kompetan JM109 E. coli hücrelerine transfekteedilerek cathepsin L2 klonlandı. JM109 E. coli kolonilerinden PZR tarama ile elde edilencathepsin L2 cDNA %1.1'lik agaroz jelde yürütülerek gösterildi. Cathepsin L2 cDNA'nınnükleotid dizilemi ve soy ağacı belirlendi.Fasciola hepatica cathepsin L2 Türkiye'de ilk kez klonlanmış olup belirlenennükleotid dizilemi literatürde bildirilen ikinci F. hepatica cathepsin L2 nükleotiddizilemidir. Daha önce Dowd ve ark. tarafından bildirilen F. hepatica cathepsin L2 (genbank no: U62289) ile %99 benzerlik gösterdiği belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

Fasciolosis is a common parasite disease, caused by Fasciola hepatica thatbeing found throughout all regions of the world including Turkey, affecting bothhuman and animals. Sporadic cases of Fasciolosis have seen in Elazığ and itsseroprevalance in healthy individuals is reported to be 2.78%.Definitive diagnosis of fasciolosis is made by detection of eggs in the hostfaeces. But, detection of eggs is impossible in early infections, ectopic infections andfalse parasitosis, and serologic tests shouls be used to diagnose these conditions.Proteases represents the major parts of the excretory-secretory antigens of theFasciola hepatica and due to their specific antigenic nature they are potential candidatemolecules to be used for diagnosis and immunization methods. The aim of this studywas to clone and determine the sequence of cathepsin L2 gene.In the present study, we composed cathepsin L2 cDNA from RNA that obtainedF. hepatica from liver of naturally infected cattle by reverse transcription polymerasechain reaction (RT-PCR). After PCR amplification, cathepsin L2 cDNA was purifiedand was cloned into the pGEM-T Easy vector. The presence of cathepsin L2 gene wasconfirmed by PCR screening. This recombinant vector that named pGEM-T CL2 wastranfected into JM109 E. coli cells. So, pGEM-T CL2 was obtained from JM109 E. colicells by QIAGEN QIA Prep Kit and the presence of cathepsin L2 gene was confirmedby PCR screening. Cathepsin L2 cDNA was showed by agarose gel electrophoresis. Wedetermined DNA sequencing and performed phylogenetic analysisFor the first time, the cathepsin L2 of F. hepatica cloning was performed andsequencing from a Turkey isolate and nucleotide sequence showed 99% identity withpreviously published sequence of F. hepatica cathepsin L2 (GenBank accession no.U62289) by Dowd et al.

Benzer Tezler

  1. Fasciola hepatica cathepsin L1 geninin ökaryotik hücrelerde açıklatılması

    Başlık çevirisi yok

    SALİH KUK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    ParazitolojiFırat Üniversitesi

    Parazitoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA KAPLAN

  2. Omurgalıların Karaciğerlerinde endoparanit olarak yaşayan Fascila hepatica'nın (L.1758) ışık mikroskobu düzeyinde morfolojik ve histolojik incelenmesi

    Morphological and Hystological Observation by Light Mycroscopy on Fasciola hepatica (L.1758) Living as Endoparasite in the Liver of Vertebrata

    OSMAN ATEŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    BiyolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEZGİNER TUNCER

  3. Fasciola hepatica ile doğal enfekte sığırlarda koagulasyon profilleri

    Coagulation profiles in naturally infective cattle with fasciola hepatica

    ERHAN YALÇINKAYA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Veteriner HekimliğiSivas Cumhuriyet Üniversitesi

    İç Hastalıkları (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ONUR BAŞBUĞ

  4. Aydın mezbahalarında kesilen ruminantlarda karaciğer trematodlarının yaygınlığı

    Prevalence of liver trematodes in slaughtered ruminants in Aydin province

    MEHMET DURAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    ParazitolojiAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    Parazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HASAN EREN

  5. Fasciola hepatica ile doğal enfekte sığırlarda antioksidan seviyesinin belirlenmesi

    Determination of antioxidant level in naturally infective cattle with fasciola hepatica

    SİNAN KUZUCU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Veteriner HekimliğiSivas Cumhuriyet Üniversitesi

    İç Hastalıkları (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZAHİD TEVFİK AĞAOĞLU