Geri Dön

Kalıtımsal ve non-sendromik işitme kaybı olgularının aday lokuslardaki mutasyonel analizi

Mutational analyses of the hereditary and non-syndromic hearing loss cases in candidate loci

PDF İndir

  1. Tez No: 195522
  2. Yazar: SAİT TÜMER
  3. Danışmanlar: Y.DOÇ.DR. OĞUZ ALTUNGÖZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Kulak Burun ve Boğaz, Tıbbi Biyoloji, Otorhinolaryngology (Ear-Nose-Throat), Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2007
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 133

Özet

Populasyonlarda görülme sıklığı 1/1000'den daha fazla olan non-sendromik sensörinöral işitme kayıplarından sorumlu birincil gen, connexon gap junction proteini alt birimini kodlayan Cx-26 genidir. Özellikle bu geninin ikinci ekzonunda 35delG mutasyonunun Avrupa toplumlarında görülme sıklığı işitme kayıplı olgular için %70'in üzerindedir. Bunun yanısıra mitokondriyal genomdaki mutasyonlar, çeşitli aminoglikozidlerin çocukluk çağında uzun süre kullanılmasına bağlı olarak işitme kayıplarına neden olmaktadır. Bu çalışmada, odyolojik ölçümler kriter alınarak doğuştan duyu yitimi olan 88 proband ve aileleri seçildi. Her bir hastanın öyküleri alınarak soyağaçları çizildi. Tüm probandların Cx-26 ikinci ekzon bölgesi PCR ile çoğaltılarak DNA dizi analizi yapıldı. Mutant probandların ailelerinde de mutasyonlar aynı yolla saptandı. 35delG için BseLI enzimi kullanılarak doğrulandı. Mitokondriyal DNA'da ise A1555G ve A7445G noktalarını içeren bölgeler PCR ile çoğaltılarak sırasıyla, Alw26I ve XbaI enzimleri ile kesim analizi yapıldı. Ayrıca işitme kaybı olmayan populasyondan seçilen 171 bireyde Cx-26 ikinci ekzon polimorfizmleri DNA dizi analizi ile incelendi. Olgu grubunun %26.6'sında mutasyon, %7.96'sında polimorfizm belirlendi. Saptanan mutasyonlar; 35delG (%18.18), G380A (%2.28), A88G (%1.14), 247delTTC (%1.14), T269C (%1.14), 299delAT (%1.14), 358delGAG (%1.14), polimorfizmler; G79A (%5.68), G457A (%1.14), C570T (%1.14) şeklinde saptandı. Mitokondri genomunda yapılan çalışmada herhangi bir mutasyon saptanmadı. Kontrol grubunda dokuz SNP %15.78 sıklıkta belirlendi. En sık gözlenen polimorfizmler G79A (%5.26) ve G457A (%4.68) olarak belirlendi. Sonuç olarak; Ege bölgesi ve çevresinin işitme kaybı olgularında ilk kez Cx-26 ikinci ekzonu incelendi. Olgu grubunda bir olguda 247delTTC aday mutasyon, kontrol grubunda ise G647C ve C292T değişimleri aday SNP olarak saptandı.

Özet (Çeviri)

Mutations of Cx-26 gene, which is coding the subunit of conexon gap junction protein, is primarily responsible for non-syndromic, sensorineural hearing loss. The incidence of it has been reported to be more than 1/1000 in various populations. Especially, 35delG mutation in the second exon of this gene frequency is over 70% among individuals with hearing loss in Europe. In addition to this mutation, mitochondrial genome has several targets for genetic defects associated with hearing loss in people with a long period aminoglycoside exposure during childhood. Eighty-eight probands and their kindred with hereditary and congenitally hearing loss diagnosed by audiological measurement were included in the study. The pedigrees of each kindred were prepared according to their family history. PCR amplifications followed by DNA sequence analyses of this gene were carried out in genomic DNA samples from each proband. The detected mutations were also searched in family members of probands similarly. 35delG change was confirmed by using BseLI restriction enzyme. The positions of 1555 and 7445 in mitochondrial DNA were tested by restriction enzyme analysis, using Alw26I and XbaI enzymes respectively. Furthermore, the control group consisted of 171 people without hearing loss was investigated by DNA sequence analyses on this gene for genetic variations and polymorphisms. Among the cases with hearing loss, 26.6% displayed mutations while 7.96% had polymorphisms. The detected mutations were as fallows: 35delG (%18.18), G380A (2.28%), A88G (1.14%), 247delTTC (1.14%), T269C (1.14%), 299delAT (1.14%), 358delGAG (1.14%). Besides, G79A (5.68%), G457A (1.14%), C570T (1.14%) polymorphisms have also been detected. No mutation has been found in mitochondrial genome for the corresponding positions. The frequency of 9 different SNPs was 15.78% in the control group. The most frequent SNPs were G79A (5.26%) and G457A (4.68%). In conclusion, this is the first study of this gene by DNA sequence analysis approach in cases with hearing loss in the Aegean region of Turkey. A novel mutation, 247delTTC in one proband and two novel SNPs (G647C, C292T) in the control group were detected.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    306043

    Sivas'ta yaşayan kalıtsal non-sendromik işitme kayıplı hastalarda cx26, cx30, cx31 gen mutasyonlarının analizi

    Analyzing Cx26, Cx30, Cx31 genes in patients with hereditary non-syndromic hearing impairment in Sivas

    HANDE KÜÇÜK KURTULGAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    GenetikCumhuriyet Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLHAN SEZGİN

  2. Tez No

    194673

    Türkiye'de işitme kaybı segregasyonu gösteren ailelerde moleküler genetik çalışmalar

    Molecular genetic studies in Turkish families segregating hearing loss

    NEVRAH NAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Tıbbi BiyolojiAkdeniz Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. GÜVEN LÜLECİ

  3. Tez No

    118839

    Non-sendromik otozomal resesif işitme kaybının görüldüğü Türk ailelerinde Myo7A, Myo15, SLC26A4 ve TMPRSS3 genlerine bağlantının araştırılması

    In non-syndromic autosomal recessive hearing impaired Turkish families search linkage to Myo7A, Myo15, SLC26A4 and TMPRSS3 genes

    NİLÜFER ŞAHİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    Tıbbi BiyolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. AHMET KARAGÜZEL

  4. Tez No

    156393

    Prelingual başlangıçlı sendromik olmayan işitme kayıplı çocuklarda connexin 26 geni 35deIG mutasyonu sıklığı

    Frequency of the 35delG mutation in the connexin 26 gene in children with pelingual non syndromic hearing loss

    ELİF ÇOMAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSüleyman Demirel Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. İNCİ ERGÜRHAN İLHAN

  5. Tez No

    225718

    Sendromik olmayan Türk işitme kayıplı olgularda otoferlin ((OTOF) gen mutasyonlarının belirlenmesi dd

    Detection of OTOF gene mutations in Turkish patients with nonsyndromic hearing loss

    ÇAĞLAR DOĞUER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    GenetikGazi Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ADNAN MENEVŞE

Geri Dön