Türkiye'de bulunan bazı Ramalina (Ach.) türlerinin rDNA ITS bölgesi dizi analizi ile filogenetik analizi
Phylogenetic analysis of some species of Ramalina Aach.) from Turkey by sequence analysis of rDNA ITS region
- Tez No: 196325
- Danışmanlar: DOÇ.DR. SÜMER ARAS
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Lichens, polymorhphism, rDNA, ITS, sequence analysis
- Yıl: 2006
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 68
Özet
ÖZETYüksek Lisans TeziTÜRKİYE'DE BULUNAN BAZI Ramalina (ACH.) TÜRLERİNİN rDNA ITS BÖLGESİDİZİ ANALİZİ İLE FİLOGENETİK ANALİZİAylin AYRIMAnkara ÜniversitesiFen Bilimleri EnstitüsüBiyoloji Anabilim DalıDanışman: Doç. Dr. Sümer ARASBu çalışma; ülkemizde yayılış gösteren Ramalina liken cinsinden Ramalina polymorpha,Ramalina fastigiata ve Ramalina capitata türlerine ait örneklerin rDNA (ITS) bölgelerininPCR yardımıyla çoğaltılması, ilgili bölge dizi analizi ile incelenmesi, ve incelenen türlerarasındaki benzerlik ve farklılıkların ortaya çıkartılması amacıyla yapılmıştır. ITS 1F ve ITS4 primerleri yardımıyla ilgili bölge çoğaltılmış ve bunu takiben dizi analizigerçekleştirilmiştir. Çalışılan türler arasındaki genetik yakınlığı bulmak için oluşturulan dörtfarklı dendrogram sonuçlarından yaralanılarak filogenetik analiz yapılmıştır. Neighbor-Joining dendrogramının analizi sonucu, Ramalina fastigiata (ABD) dışındaki Ramalinatürleri üç ana kolda uzanmaktadır. Türkiye- Karabük' ten alınarak çalışılan Ramalinafastigiata türü ile Amerika- Kuzey Carolina' dan elde edilen R. fastigiata dendrogramdabirbirlerinden uzak görülmektedir.2006, 60 sayfaAnahtar Kelimeler : Liken, polimorfizm, rDNA, ITS, dizi analizi
Özet (Çeviri)
ABSTRACTMaster ThesisPHYLOGENETIC ANALYSIS OF SOME SPECIES OF Ramalina (ACH.) FROMTURKEY BY SEQUENCE ANALYSIS OFrDNA ITS REGIONAylin AYRIMAnkara UniversityGraduate School of Natural and Applied SciencesDepartment of BiologySupervisor: Assoc. Prof. Dr. Sümer ARASThis study has been made to show the similarities and the differences among Ramalinapolymorpha, Ramalina fastigiata and Ramalina capitata from Ramalina Lichen genus foundin our country. rDNA (ITS) regions of the samples from these species were amplified withPCR and analysed by sequencing. ITS regions were amplified with the aid of ITS 1F andITS 4 primers and followed by sequencing. The phylogenetic analysis has been performedusing the results of the 4 different dendograms generated to find the genetic closenessbetween these species. Accoring to Neighbor-Joining dendrogram analysis result, Ramalinafastigiata (USA) barring, Ramalina species split into three main branch. Studying speciesRamalina fastigiata which is from Turkey- Karabük and getting from America-NorthCarolina R. fastigiata show the distance from each other at the dendrogram.2006, 60 pages
Benzer Tezler
- Morphological, anatomical and molecular studies on some lichens from Salda Lake (Burdur, Turkey)
Salda Gölü (Burdur, Türkiye) 'nde yayılış gösteren bazı likenlerin morfolojik, anatomik ve moleküler incelenmesi
RUQAYAH ABBOOD
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
BiyolojiErciyes ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET GÖKHAN HALICI
- Türkiye'de bulunan bazı ekonomik kabuklu su canlıları üzerinde araştırmalar
A research about some economical shellfish in Turkey
HATİCE TEKOĞUL
Doktora
Türkçe
1999
Su ÜrünleriEge ÜniversitesiSu Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ATİLLA ALPBAZ
- Türkiye'de bulunan bazı yerli sığır ırklarının genetik yapılarının karakterizasyonu
Genetic characterization of some Turkish cattle breeds
YUSUF ÖZŞENSOY
Doktora
Türkçe
2011
GenetikSelçuk ÜniversitesiZootekni (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ERCAN KURAR
- Türkiye'de bulunan bazı sığır ırklarının DGAT1 ve PRNP gen polimorfizminin araştırılması
Investigation of DGAT1 and PRNP Genes Polymorphism of Various Cattle Breeds in Turkey
İCLAL ŞAHİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
BiyokimyaSelçuk ÜniversitesiBiyokimya (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET NİZAMLIOĞLU
- Türkiye'de bulunan bazı kedi ırklarının D-Loop polimorfizminin araştırılması
Investigation of genetic structure of various cat breds by using D-Loop polimorphism in Turkey
ELİF YILMAZ ŞAHİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
BiyokimyaSelçuk ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VAHDETTİN ALTUNOK