Purification and characterization of hexokinase isoenzymes from Rhizopus oryzae
Rhizopus oryzae'den heksokinaz izoenzimlerinin saflaştırılması ve karakterizasyonu
- Tez No: 199232
- Danışmanlar: PROF. HALUK HAMAMCI, DR. ŞEYDA AÇAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biyoteknoloji, Biochemistry, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Rhizopus oryzae, heksokinaz, glikokinaz glikoliz, saflaştırma, Rhizopus oryzae, hexokinase, glucokinase glycolysis, purification
- Yıl: 2007
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 116
Özet
Tüm canlılar için glikoliz merkezi bir izyoludur. Glikolizin kontrolüendüstriyel ürünlerin verimi açısından önemlidir. Bu ürünlerden bir tanesi olanlaktik asit endüstride önemli bir organizma olan Rhizopus oryzae tarafındanüretilirFilamentli bir küf olan Rhizopus oryzae laktik asit ve etanol üretir.Bakterilerle karşılaştırıldığında R. oryzae'nin laktik asit verimi düşüktür. Fakatsadece L(+) laktik asit formunu ürettiği için önemlidir. Laktik asitin L formuinsanlarda metabolize edilebilir. Endüstride, belirli bir ürünün üretimininuygulanabilir olması için verim yüksek olmalıdır. Eğer glikoliz boyunca akımınarttırılması için bir yol bulunabilirse aynı zamanda laktik asit verimi de artabilir.Bu çalışmada buna dayanarak glikolizin ilk basamağı olan heksokinazaodaklanmak istedik. Heksokinaz glikozu glikoz-6-fosfat a çeviren reaksiyonukatalizler. Bu çalışmada ilk kez Rhizopus oryzae'nin heksokinazının iki izoenzimformunu saflaştırıldı ve kinetik karakterizasyonunu yapıldı.Heksokinaz iki tane izoenzime sahiptir. Saflaştırılan izoenzimler Michealis-Menten Kinetiğine uyumlu bulunmuştur. pH 7.70 de izoenzyme 1 için glikoza Kmdeğeri 0.16 mM ve izoenzim 2 için glikoza Km değeri 0.21 mM olarak tespitedildi. İzoenzim1 için fruktoza Km değeri 28.8 mM iken izoenzyme 2 nin Kmdeğeri belirlenememiştir. Her iki izoenzim de trehaloz-6-fosfatla inhibeolmamaktadır. İzoenzimlerin moleküler ağırlıkları SDS PAGE yöntemi ilebelirlendi. İzoenzim 1'in moleküler ağırlığı 62.9 ve 45.2 kDa iken izoenzim 2' ninmoleküler ağırlığı 56.2 kDa ve 41.6 kDa dır.
Özet (Çeviri)
Glycolysis is the central metabolic pathway for living organisms. Itsregulation is important for the yield of the end products which are industriallyimportant. These end products, like lactic acid produced by Rhizopus oryzae, areindustrially important.Rhizopus oryzae is a filamentous fungus producing lactic acid and ethanol.The lactic acid yield of R. oryzae is low (â¼70 %) compared to that of lactic acidbacteria (>95 %) still it is noteworthy because R. oryzae produces only the L (+)form of lactic acid which can be metabolized in the human body. The yield of anindustrial process should be high for the feasibility of the production of aparticular product. If a way can be found increase the flux through the glycolysisthe yield of lactic acid may increase as well.Keeping this in mind we wanted to focus on the first step of glycolysis,hexokinase of R. oryzae. Hexokinase catalyzes the reaction that converts glucose toglucose-6-phosphate. In this study for the first time the two isoenzymes ofhexokinase of R. oryzae were purified and characterized by biochemically andkineticallyHexokinase has two isoenzymes. The purified enzymes (isoenzymes1 &isoenzymes2) obeyed Michealis-Menten Kinetics. The Km value of purifiedisoenzyme 1 is 0.16 mM and isoenzyme 2, 0.21 mM at pH 7.70 for glucose. TheKm value of isoenzyme1 for fructose was 28.8 mM. Essentially isoenzyme 2 cannot utilize fructose. None of the isoenzymes were inhibited by trehalose-6-phophate.The monomer moleculer weight of isoenzymes were estimated SDSPAGE analysis. There were two different values for molecular weight ofisoenzmye 1; 62.9 and 42.5 kDa and two values for isoenzyme 2; 56.2 and 41.6kDa
Benzer Tezler
- Isolation and preliminary characterization of hexokinase from rhizopus oryzae
Başlık çevirisi yok
ŞEYDA AÇAR
Yüksek Lisans
İngilizce
1999
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MERAL YÜCEL
- Biochemical and genetic studies on the pyruvate branch point enzymes of Rhizopus oryzae
Rhizopus oryzae' nın piruvat ayrım noktası enzimleri üzerinde biyokimyasal ve genetik çalışmalar
ŞEYDA AÇAR
Doktora
İngilizce
2004
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALUK HAMAMCI
PROF. DR. MERAL YÜCEL
- Purification and characterization of bacterioins produced by pediococcus acidilactici and pediococcus pentosaceus
Pediococcus acidilactici ve pediococcus pentosaceus tarafından üretilen bakteriyosinlerin saflaştırılması ve karakterizasyonu
ÖZLEM OSMANAĞAOĞLU
Doktora
İngilizce
1999
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. UFUK GÜNDÜZ
- Beyin ve beyin zarından sitozolik ve nonsitozolik karbonik anhidraz enzimlerinin izolasyonu ve karakterizasyonu
Purification and characterization of cytoplasmic and noncytoplasmic carbonic anhydrases from brain and brain membrane
FATMA COŞKUN
- Purification and characterization of cytochrome b5 from sheep liver microsomes
Sitokrom b5'in koyun karaciğerinden saflaştırılması ve karakterizasyonu
DENİZ YALÇIN
Yüksek Lisans
İngilizce
1998
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMEL ARINÇ