Candida albicans' a ait ALS, HWP ve staphylococcus epidermidis' e ait ICA genlerinin farklı biyomateryallerdeki ekspresyonlarının real time PCR ile kantitatif analizi
The quantitation and comparison of gene expression levels in different biomaterials for ALS and HWP in Candida albicans, for ICA in Staphylococcus epidermidis in Real Time PCR
- Tez No: 225716
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AYŞE KALKANCI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji, Mikrobiyoloji, Infectious Diseases and Clinical Microbiology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2008
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Çalışmamızda lateks-slikon, polivinil klorid, polivinilprolidon kaplı poliüretan ve poliüretan kateter yüzeyinde oluşturulan in vitro biyofilm modelinde adezyon genlerinin ekspresyonları karşılaştırılmıştır. Karşılaştırılan adezyon genleri sırasıyla Candida albicans 'a ait ALS1 ve HWP1, Staphylococcus epidermidis 'e ait ICA 'dır. Oluşan biyofilm kütlesi kateter yüzeyinden kazınmış ve mRNA 'ları izole edilmiştir. Bu mRNA 'lar cDNA 'ya çevrilmiş ve real time PCR 'da kantitatif analizleri yapılmıştır. Çalışmamızın sonunda slikonize materyalden yapılmış kateter üzerindeki ALS1 ve HWP1 genlerinin kopya sayısı sırasıyla 2,50 x 105 kopya/ml ve 1,30 x 104 kopya/ml, ICA geninin ise 1,80 x 105 kopya/ml olduğu bulunmuştur. Adezyon genleri polivinil klorid kateterde slikonize olanlardan daha çok eksprese edilmiş olarak bulunmuştur. Polivinil klorid kateter üzerindeki ALS1 ve HWP1 genlerinin kopya sayısı sırasıyla 7,56 x 106 kopya/ml ve 6,68 x 105 kopya/ml olarak, ICA geninin ise 4,20 x105 kopya/ml olarak bulunmuştur. Minimum gen ekspresyonu polivinilprolidon kaplı poliüretan ve poliüretan kateterlerdede saptanmıştır. Biyofilm ilişkili genler PVP ve PUC yüzeyinde veya planktonik hücrelerde farklı bulunmamıştır.Bu çalışmada, adezyonla ilişkili genlerin ekspresyonunun materyalin yapısından etkilendiği bulunmuştur. Bu klinik kullanımda, bir materyalin diğerine tercih edilmesiyle sonuçlanabilir.
Özet (Çeviri)
This study describes a comparison of latex-silicone coated, polyvinyl chloride, polyvinylpyrolidone coated polyurethane and polyurethane catheters for the delivery of adhesion genes in an in vitro biofilm model. ALS1, HWP1 genes of Candida albicans and ICA gene for Staphylococcus epidermidis were targeted for the comparison of four different biomaterials. Biofilm mass was separeted from the surface of the catheter and mRNA of the strains were isolated. Isolated mRNA was transcripted into cDNA and quantified in a real time PCR assay. As a result of our study, ALS1 and HWP1 gene copy numbers were found to be 2.50x105 and 1.30x104 copy/ml, respectively and ICA gene copy number was found to be 1.80x105 copy/ml on the biofilm of the catheter made from siliconized material. Adhesion genes were found as expressed in higher levels on the polyvinyl chloride catheter than those in siliconized ones. ALS1 and HWP1 gene copy numbers were found to be 7.56x106 and 6.88x105 copy/ml, respectively and ICA gene copy number was found to be 4.20x105 copy/ml on the polyvinyl chloride catheter. Minimum gene expression levels were detected in polyvinylpyrolidone coated polyurethane and polyurethane catheters. Biofilm related genes were not expressed differently between planktonic cells or on the surfaces of those catheters.In this study, the expression of the adhesion related genes were found to be affected from the structure of the materials. It may result in the preferation of one material from other in the clinical use.
Benzer Tezler
- Genito-üriner sistem enfeksiyonlarından izole edilen Candida türlerinde bazı virülans faktörlerı ile antifungal ilaç direncinin araştırılması
Genito-üriner sistem enfeksiyonlarindan izole edi̇len Candida türlerinde bazi vi̇rülans faktörleri i̇le antifungal ilaç di̇rencinin araştirilmasi
SEZİN ÇOLAK HALLUM
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
MikrobiyolojiHatay Mustafa Kemal ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİZAMİ DURAN
- Candida albicans izolatlarında azol direnci ve biyofilm oluşumu arasındaki ilişkinin araştırılması
Investigation of the relationship between azole resistance and biofilm formation in Candida albicans isolates
İLAYDA BUDAK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
MikrobiyolojiGaziosmanpaşa ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLGÜN YENİŞEHİRLİ
- Synthesis and activity studies on novel 6-methoxybenzothiazole-piperazine derivatives with propanamide chain
Propanamit zinciri taşıyan yeni 6-metoksibenzotiyazol-piperazin türevleri üzerine sentez ve aktivite çalışmaları
NESRIN A. HASAN ALHUSADI
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
KimyaYeditepe ÜniversitesiFarmasötik Kimya Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ENİSE ECE GÜRDAL HAKGÖR
- İnvazif kandidoz olgularından izole edilen Candida albicans suşlarının genotiplendirilmesi ve virülans genlerinin varlığının araştırılması
Genotyping of Candida albicans strains isolated from patients with invasive candidiasis and investigation of the presence of virulence genes
BURAK PURAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GONCA ERKÖSE GENÇ
- Klinik örneklerden izole edilen Candida albicans kökenlerinin moleküler analizi
Molecular analysis of Candida albicans isolates from clinical specimens
MELAHAT GÜRBÜZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
MikrobiyolojiPamukkale ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İLKNUR KALELİ