TANK proteininin sinyal iletimindeki fonksiyonel analizi
Functional analyses of the TANK protein in signal transduction
- Tez No: 229943
- Danışmanlar: PROF. DR. M. LİENHARD SCHMITZ, YRD. DOÇ. DR. BUKET KOSOVA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Genetik, Tıbbi Biyoloji, Biochemistry, Genetics, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2008
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 119
Özet
NF- ?B' ler sitokinler, enfeksiyon ajanları ve DNA çift zincir kırıkları gibi uyarıcılarla aktive olabilen ve bunların sonucunda immun cevap, inflamasyon, hücre kurtarımı ve kanserde rol oynayan birçok genin ekspresyonunu düzenleyen transkripsiyon faktörleridir.NF- ?B sinyal yolağı başlıca üç yolla aktive edilebilmektedir. Bunlar geleneksel (canonical), alternatif (non- canonical) ve DNA hasarında devreye giren yollardır. NF- ?B sinyal yolağının aktivasyonu ve inaktivasyonu, bu yolakta görev alan proteinler arasındaki etkileşimlere bağlıdır. Canonical yolakta görev alan ve IKK? ile etkileşerek NF- ?B sinyal yolağını aktive eden proteinlerden biri de TANK' tır.TANK ve IKK? proteinleri arasındaki etkileşimi saptayabilmek amacıyla, TANK proteininin amino asit dizisinde post-translasyonel modifikasyon yoluyla fosforile oldukları düşünülen 10 tane serin ve treonin amino asiti (116, 117, 122, 123, 126, 225, 228, 230, 243 ve 244. amino asitler) alanin amino asitine değiştirilerek mutasyonları oluşturulmuştur. Aynı zamanda, TANK proteininin C- terminal delesyon mutantı da klonlanmıştır (?C 358- 425). Çalışma sonucunda TANK' ın IKK? tarafından fosforile edildiği ve yabanıl tip TANK' taki fosforilasyon miktarının mutant tipe oranla daha fazla olduğu tespit edilmiştir. Ayrıca, artan IKK? konsantrasyonlarına bağlı olarak yabanıl ve mutant tipteki TANK proteinlerin fosforilasyon miktarlarında da artış saptanmıştır. Bununla birlikte, değiştirilen 10 amino asite ilave olarak C- terminali de kısaltılan ?C TANK' ın düşük de olsa fosforile edildiği gösterilebilmiştir. Elde edilen tüm bu verilere dayanarak, değiştirilen 10 tane serin ve treonin amino asitinin TANK proteini fosforilasyonunda rol oynayabilecekleri düşünülmektedir.TANK ve SUMO1 proteinleri arasındaki ilişkiyi saptamak amacıyla TANK proteininin amino asit dizisindeki 4 lizin amino asiti (146, 231, 235 ve 282. amino asitler) arjinin amino asitlerine değiştirilmiştir. Yapılan çalışmalar sonrasında , TANK' ın IKK tarafından fosforile edildikten sonra SUMO1 ile etkileştiği saptanmıştır. Özellikle 282. pozisyondaki lizinin bu etkileşimde rol oynayabileceği ileri sürülmüştür.Sonuç olarak, TANK proteininin post-translasyonel modifikasyonlarının tanımlanmasıyla, onun NF- ?B sinyal yolağındaki işlevinin daha iyi anlaşılacağı ve hastalıkların patogenezinin çözümlenmesine yardımcı olacağı kanısındayız .
Özet (Çeviri)
NF- ?Bs are transcription factors that can be activated by cytokines, infection agents and DNA double chain breaks, resulting in the regulation of several genes implicated in immune response, inflammation, survival and cancer.The NF- ?B signaling pathway can be activated in three ways: the canonical, non-canonical and the one involved after DNA damage. Activation and inactivation of the NF- ?B signaling pathway is dependent on the interaction between proteins acting in this pathway. TANK is one of these proteins with a role in the canonical pathway and capable of activating the NF- ?B signaling pathway by interacting with IKK?.In purpose to determine the interaction between the TANK and IKK? proteins 10 serine and threonine amino acids (116, 117, 122, 123, 126, 225, 228, 230, 243 ve 244. amino acids), which were thought to be phosphorylated by post-translational modifications in the TANK protein sequence, were mutated to alanine amino acid. A C-terminal deletion mutant (?C 358- 425) of TANK was also cloned. As a result of these studies, phosphorylation of TANK by IKK? was observed and the wild type TANK was found to be more phosphorylated compared to the mutant type. Depending on increasing IKK? concentrations, elevated phosphorylation levels of wild type and mutant TANK proteins were also detected. Furthermore, the protein which had the10 amino acid changes and was also C-terminally truncated again displayed a slight phosphorylation. According to our results, the 10 serine and threonine amino acids changed in our study might have a role in the phosphorylation of the TANK protein.To understand the relationship between the TANK and SUMO1 proteins, 4 lysine amino acids (146, 231, 235 ve 282. amino acids) in the TANK protein sequence were mutated to arginine amino acids. After phosphorylation by IKK?, TANK was still found to interact with SUMO1. Specifically, the lysine residue at position 282 had been considered to play a role in this interaction.As a conclusion, we think that the identification of post-translational modifications of the TANK protein will help us to further understand the role of this protein in the NF-?B signaling pathway and in the pathogenesis of diseases.
Benzer Tezler
- Dondurulmuş ve çözülmüş ovaryum dokusunda otofajik ölüm yolağında yer alan sinyal proteinlerinden mTOR ve PmTOR ekspresyonunu immunohistokimyasal olarak gösterilmesi
Immunostochemical demonstration of protein mTOR and PmTOR expression in autophagic death pathway in frozen and thawed ovarian tissue
ÜMRAY TOPRAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Histoloji ve EmbriyolojiPamukkale ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLÇİN METE
- Poliketin (Hediste divercicolors) deniz levreği (Dicentrarchus labrax) yavrusunun büyüme performansı ve vücut kompozisyonu üzerine etkisi
The effect of polychaete (Hediste divercicolor) on growth performance and body composition of sea bass (Dicentrarchus labrax) larvae
YASİR AKBAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Su ÜrünleriAkdeniz ÜniversitesiSu Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERKAN GÜMÜŞ
DR. MEHMET ALİ TURAN KOÇER
- Sericin protein recovery from silk degumming wastewater in pilot scale via membrane hybrid processes
Membran hibrit prosesler ile pilot ölçekte ipek yumuşatma atık suyundan serisin proteini geri kazanımı
MERVE GENÇTÜRK
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
Çevre MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÜLKÜ YETİŞ
DOÇ. DR. GÖKŞEN ÇAPAR
- Tilapia (Oreochromis niloticus, L. 1758) yavrularında balık unu proteini yerine fermente soya küspesi proteini kullanımının büyüme ve yem değerlendirme üzerine etkisi
The effect on growth and feed conversion ratio of using fermented soybean meal instead of fish meal at juvenile tilapia (Oreochromis niloticus, L. 1758) diet
TÜLAY DEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Su ÜrünleriSüleyman Demirel ÜniversitesiSu Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NALAN ÖZGÜR YİĞİT
- Çok doymamış yağ asitleri bakımından zengin alg ilave edilen yemlerin levrek (Dicentrarchus albrax L., 1758)'de büyüme performansı ve vücut komposizyonuna etkisi
Effects of pufa (Polyunsaturated fatty acids) enriched algae added diets on growth and body composition of sea bass (Dicentrarchus labrax L., 1758)
KAMİL MERT ERYALÇIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
Su Ürünleriİstanbul ÜniversitesiSu Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERDAL ŞENER