Molecular genetic analysis of lafora disease and dravet's syndrome
Lafora hastalığı ve dravet sendromunun moleküler genetik analizi
- Tez No: 232497
- Danışmanlar: PROF. DR. S. HANDE ÇAĞLAYAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Nöroloji, Genetics, Neurology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2008
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 86
Özet
Lafora Disease (LD), a type of Progressive Myoclonus Epilepsy (PME) and Dravet's Syndrome (DS), the most severe form in Generalized Epilepsy with Febrile Seizure Plus (GEFS+) spectrum, are debilitating examples of epilepsy syndromes. Early diagnosis is critical for distinguishing these diseases from other epilepsy syndromes and for developing effective treatment strategies. Molecular genetic analysis of genes involved in development of such epilepsy types is essential for early diagnosis. LD is associated with EPM2A and EPM2B genes, while DS is frequently associated with SCN1A gene. Analysis of the genes were carried out by PCR amplifications of all coding regions followed by DNA sequence analysis. Mutational analysis of EPM2A and EPM2B genes on 4 patients suspected to have LD revealed a novel nonsense mutation in the EPM2B gene of two sisters and a recurrent nonsense mutation in the EPM2A gene in the third patient. The fourth having no changes in both EPM2A and EPM2B genes was analyzed for point mutations in the EPM1A gene since LD and Unverricht-Lundborg disease (ULD) can not be easily distinguished clinically and ULD diagnosis was also excluded in this patient. Mutational analysis of SCN1A gene on 4 patients, one suspected to have GEFS+ and 3 suspected to have DS revealed two novel mutations, a missense mutation and a dinucleotide deletion in two patients. The non-polymorphic nature and evolutinary conservation of the missense mutation indicated that the mutation may have a effect on the phenotype and cause DS. Other two patients did not have any changes in the SCN1A gene. Mutational analysis of EMP1A, EPM2A, EPM2B and SCN1A genes were successfully implemented through direct DNA sequencing of the coding regions as an initial study to aid the clinical diagnosis and to reveal the prevalence and molecular pathology of LD and DS in Turkey.
Özet (Çeviri)
Bir progresif miyoklonik epilepsi tipi olan Lafora Hastalığı (LH) ve ateşli nöbetli generalize epilepsiler (GEFS+) spektrumunun en ağır formu olan Dravet Sendromu (DS) ağır seyreden epilepsi sendromlarına örnektir. Bu hastalıkları diğer epilepsi sendromlarından ayırmada ve etkili tedavi stratejileri geliştirmede, erken tanı kritiktir. Bu epilepsi tiplerinin gelişiminde yer alan genlerin moleküler genetik analizi erken tanı için önemlidir. LH, EPM2A ve EPM2B genleri, DS ise sıklıkla SCN1A geni ile ilişkilidir. Genlerin analizleri, tüm kodlayıcı bölgelerin PCR ile çoğaltılmaları, takibinde DNA dizileme analizi ile yapılmıştır. LH olduğu şüphelenilen 4 hastada, EPM2A ve EPM2B genlerinin mutasyon analizi, iki kızkardeşte EPM2B geninde yeni anlamsız bir mutasyon ve üçüncü hastada, başka hastalarda gösterilmiş anlamsız bir EPM2A mutasyonu ortaya çıkarmıştır. EPM2A ve EPM2B genlerinde herhangi bir değişiklik olmayan 4. hasta, LH ve Unverricht-Lundborg Hastalığı (ULH) erken dönemde klinik olarak ayrılamadıklarından, EPM1A genindeki nokta mutasyonu için de incelenmiştir ve ULH tanısı da dışlanmıştır. Birinin GEFS+ ve üçünün DS olduğu şüphelenilen 4 hastada, SCN1A geninin mutasyon analizi, 2 hastada, bir yanlış anlamlı ve bir dinükleotit delesyonu olmak üzere 2 yeni mutasyon ortaya çıkarmıştır. Yanlış anlamlı mutasyonun polimorfik olmayışı ve evrimsel olarak korunuşu, fenotipte etkisinin olduğunu, DS?e sebebiyet verebileceğini göstermiştir. Diğer iki hastada herhangi bir değişikliğe rastlanmamıştır. Klinik tanıya yardımcı olacak ve ileride Türkiye?de LH ve DS?nin prevalansı ve moleküler patolojisini ortaya çıkarmaya yönelik ön çalışma olarak EPM1A, EPM2A, EPM2B ve SCN1A genlerinin mutasyon analizi, kodlayıcı bölgelerin doğrudan DNA dizilemesi ile başarıyla tamamlanmıştır.
Benzer Tezler
- Progresif miyoklonik epilepsilerde tüm ekzom dizileme yöntemi ile ilişkili genlerinin araştırılması
Investigation of genes in progressive myoclonic epilepsies with all whole exome sequencing
GAREN HARYANYAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Genetikİstanbul ÜniversitesiGenetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SİBEL AYLİN UĞUR İŞERİ
- Gençlikte ortaya çıkan erişkin tip diyabet (MODY) tanısı ile izlenen çocuklarda yeni nesil dizi analizi yöntemi ile tanımlanmış tüm genlerin araştırılması
Molecular genetic analysis of maturity onset diabetes of the young (MODY) genes in children by using targeted next-generation sequencing
AHMET ANIK
Tıpta Yan Dal Uzmanlık
Türkçe
2014
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıDokuz Eylül ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ECE BÖBER
- Karacadağ bölgesi zom koyunlarının mitokondiriyal ND4( NADH dehidrogenaz altunite 4) geninin moleküler genetik analizi
Molecular genetic analysis of mitochondirial ND4( NADH dehydrogenase subuni̇te 4) gene of zom sheep in karacadag regi̇on
EMİNE ESER
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
ZoolojiHarran ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SELAHADDİN KİRAZ
- Mukopolisakkaridoz tip IVA mutasyonlarının moleküler genetik analizi
Molecular genetic analysis of mucopolysaccaridosis type IVA mutations
MÜGEN TERZİOĞLU
Doktora
Türkçe
2002
Tıbbi BiyolojiHacettepe ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. SERAP EMRE
- Mikroarray tabanlı yeniden dizileme sistemi ile Wilson hastalarında ATP7B geninde moleküler genetik analizler
Molecular genetic analysis of ATP7B gene in Wilson disease by microarray based resequencing system
AYHAN YILMAZ
Doktora
Türkçe
2010
BiyolojiHacettepe ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. R. KÖKSAL ÖZGÜL
PROF. DR. EROL AKSÖZ