Sendromik olmayan otozomal resesif işitme kaybı ile ilgili yeni genlerin ortaya çıkarılması
Identifing novel genes for non syndromic autosomal recessive deafness
- Tez No: 233794
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MUSTAFA TEKİN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: sitme kaybı, TMHS, TRPA1, GJA7, SLC12A2, SNP, mikrosatelit, mikrodizin, Hearing loss, TMHS, TRPA1, GJA7, SLC12A2 SNP, microsatellites, microarray
- Yıl: 2008
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 94
Özet
İsitme kaybı dünya genelinde en sık görülen duyusal bozukluktur. Doğustan veya dilgelisimi öncesi ortaya çıkan isitme kaybı yaklasık her 1000 canlı doğumda 1-2görülmektedir. Genetik nedenler doğustan isitme kayıplarının yaklasık %50-60'ınıolusturmaktadır. Genetik nedenli isitme kayıplarının yaklasık %30'una baska klinikbulgular eslik etmekte olup bu olgular sendromik isitme kaybı olarak adlandırılır.Sendromik olmayan olguların yaklasık %80'inde otozomal resesif kalıtımbulunmaktadır. Sendromik olmayan isitme kaybı yapan 27 tane gen bulunmaktadır.Bu çalısmada insanda isitme kaybı nedeni olabilecek dört aday genin (TMHS,TRPA1, GJA7, SLC12A2) isitme engelli aileler taranarak, isitme kaybı geni olupolmadıklarının ortaya konulması amaçlanmıstır.Bu çalısmaya anne baba arasında akrabalık olan ve etkilenmis bireyde sendromikolmayan doğustan veya dil gelisimi öncesi ortaya çıkan ileri ve çok ileri sensorinöralisitme kaybı bulunan toplam 97 aile dahil edilmistir. Ailelerde GJB2 genimutasyonları daha önce taranmıs ve negatif bulunmustur. Ailelerden 66 tanesimikrosatellit belirteçleriyle ve 51 tanesi mikrodizin analiz yöntemiyle taranmıstır.TMHS geninde mikrodizin analizini takiben SSCP yapılmıs ve herhangi bir değisimsaptanamamıstır.TRPA1 geninde p.Arg3Cys (c.7C>T) değisimi bulunmustur. Bu değisimin daha öncebildirilmis bir polimorfizm olduğu görülmüstür.GJA7 geninde aralarında akrabalık olmayan iki ailede heterozigot p.Asp297Asndeğisimi saptanmıstır. Bu değisim daha önce bildirilmemis olmasına rağmen farklıtürlerde korunmamıs olması ve proteinin fonksiyonunu değistirmemesi nedeniylepolimorfizm olduğu düsünülmüstür.SLC12A2 geninde hiçbir DNA değisikliği saptanmamıstır.Sonuç olarak TMHS, TRPA, GJA7ve SLC12A2 genleri sensorinöral otozomal resesifisitme kaybının yaygın nedenleri arasında sayılamaz.
Özet (Çeviri)
Hearing loss is the most common sensoineural disorder. Congenital or prelingualhearing loss occurs approximately in one case per 1000 live births. Genetic causesaccount for 50%of cases. Additional findings are present in 30%of cases, which arereferred to as having syndromic deafness. Autosomal recessive transmission occursin 80%of hereditary deafness. To date, 27 genes, in which mutations are responsiblefor autosomal recessive deafness have been identified.We aimed to identify novel genes for non-syndromic autosomal recessive deafnessby searching four candidate genes (TMHS, TRPA1, GJA7, SLC12A2) in deaffamilies.Ninety-seven families with parental consanguinity segregating autosomal recessiveprofound prelingual deafness were included in this study. Mutations in GJB2 werescreened and found to be negative in all families. Homozygous run flanking the fourstudied genes were evaluated with microsatellite and single nucleoted polymorphism(SNP) genotyping in 66 and 51 families respectively.Microstellite followed by SSCP and no change was found in TMHS gene.Ahomozygous p.Arg3Cys (c.7C>T) change was found in TRPA1 gene. However it wasassensed to be a polymorphism based on previously reported studies.Heterozygous p.Asp297Asn (c.889G>A) was detected in GJA7 gene in two unrelatedfamilies. Although this change has not been reported earlier, it was considered to be apolymorphism because this position is not conserved in different species and theamino acid change was not assensed to be not significant for the alteration of proteinfunction.No DNA sequence change was found in the SLC12A2 gene.In conclusion TMHS, TRPA1, GJA7 and SLC12A2 genes are not a common cause ofautosomal recessive sensorineural hearing loss.
Benzer Tezler
- Nonsendromik otozomal resesif işitme kayıpları
Başlık çevirisi yok
ALİ FUAT ŞAŞOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2004
Kulak Burun ve BoğazEge ÜniversitesiKulak Burun Boğaz Hastalıkları Ana Bilim Dalı
- Kliniğimizde 2000-2016yılları arasında takip ettiğimiz sanfilipposendromlu hastaların tanı, biyokimyasal parametreler, tedavi ve klinikizlemlerinin değerlendirilmesi ve genetik danışma verilmesi
Genetical counsulting and clinical, biochemical, radiologic findings of sanfilippo syndromepatients who were diagnosed and followed up between 20002016.
BİLGE NOYAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıMarmara ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HURİYE NURSEL ELÇİOĞLU
- Analysis of total ada activity in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) of DADA2 patients
DADA2 hastalarının periferik kan mononükleer hücrelerinde total ada aktivitesinin analizi
TURNA DEMİRCİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EDA TAHİR TURANLI
- Otozomal resesif işitme kayıplı ailelerde otozigozite taraması ile MYO7A mutasyonlarının gösterilmesi
Screening of MYO7A by autozygosity mapping in families with autosomal recessive hearing loss
DUYGU DUMAN
Doktora
Türkçe
2011
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiTemel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEJAT AKAR
- Sendromik olmayan otozomal resesif işitme kayıplı ve MYO15A genine bağlantı bulunan ailelerde mutasyon analizi
Mutation analysis of families with autosomal recessive nonsyndromic hearing loss linked to the MYO15A gene
FİLİZ BAŞAK CENGİZ
Doktora
Türkçe
2010
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiTemel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEJAT AKAR