MEFV geninde allelik ifadenin kantitasyonu
Quantitation of the allelic expression for MEFV gene
- Tez No: 236952
- Danışmanlar: PROF. DR. ENGİN YILMAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 89
Özet
Ailevi Akdeniz Ateşi (AAA), otozomal resesif kalıtılan otoinflamatuar bir hastalıktır. AAA hastalığı MEFV (MEditerranean FeVer) genindeki mutasyonlar sonucunda görülmektedir. AAA, otozomal resssif kalıtım gösteren monogenik bir hastalık olarak tanımlanmışsa da, tek allelde mutasyon taşıyan ve AAA fenotipi gösteren hastalar bulunmaktadır. Bu tez çalışmasının amacı, bu bireylerde görülen AAA fenotipinin nedeninin araştırılmasıdırTek allelinde mutasyon taşıyan 24 AAA hastası DNA dizi analizi ile incelendiğinde 4 hastada ikinci allelerdeki mutasyonlar saptandı ve bu hastalar çalışma grubundan çıkartıldı. Geriye kalan 20 hasta, MLPA ile analiz edildiğinde hiç bir örnekte delesyon ve/veya insersiyon saptanmadı. Bu hastalarda AAA fenotipini açıklayabilmek için, M694V mutasyonu taşıyan 9 hasta bireyde ve 3 sağlıklı heterezigot bireyde allelik gen ifadesi moleküler beacon problar kullanarak kantitatif gerçek zamanlı PZR ile analiz edildi. Bu bireylerde normal allel ile mutant allel arasında allelik ifade bakımından bir farklılık gözlenmedi.Affymetrix 250K SNPs GeneChip'ler kullanılarak; tek allelinde mutasyon taşıayn ve her iki allelinde de mutasyon taşımayan AAA hastaları, aileleri ile birlikde analiz edildi. Deney sonucu, VIGENOS programı kullanılarak değerlendirildiğinde, tek allelinde mutasyon taşıyan AAA hastaları için aday bir kromozomal bölge saptanamazken, her iki allelinde de mutasyon taşımayan aileler için 7. kromozomda 10 cM luk bir aday bölge saptandı. Bu bölgedeki aday genlerde AAA fenotipi ile ilişkilendirilebilecek mutasyonları tespit etme çalışması devam etmektedir.
Özet (Çeviri)
Familial Mediterranean Fever (FMF), is an autoinflammatory disease which is transmitted in an autosomal recessive manner. FMF is caused by mutations in MEFV (MEditerranean FeVer) gene. FMF is described as an autosomal recessive monogenic disorder, although some patients, with FMF phenotype, have only one mutant allele in MEFV gene. Aim of this study is to investigate the cause of FMF phenotype in these patients.We analyzed 24 FMF patients? samples by sequencing, who have only one mutant allele and found the second mutant allele in 4 patients. These patients were excluded from our study. When samples of the remaining 20 patients were analyzed to investigate deletion or insertion by using the MLPA system, we couldn?t observe any deletion or insertion in these samples. To explain the FMF phenotype in these patients, we performed Quantative Real time-PCR by using molecular beacon probes, which are specific to the M694V mutation. 9 FMF patients? samples (M694V heterozygote) and 3 healthy M694V heterozygote individuals? samples were used in this study. We found no difference between mutant and wild-type alleles? expression levels in heterozygote FMF patients.Then we performed Affymetrix 250K SNPs Genechips Array to investigate a new chromosomal locus which may be associated with the FMF phenotype. In this study, we used patients? samples, who have only one mutant allele or no mutant allele, and their families? samples. When the chip datawere analyze by using VIGENOS software, we couldn?t find any candidate chromosomal location, in heterozygote patients. While we observe a candidate chromosomal location in chromosome 7 (10cM) in patients with no mutant allele. We will continue our study to find mutation(s) in these candidate gene(s) which may be associated with the FMF phenotype.
Benzer Tezler
- Türk populasyonunda MEFV geninde Ekson 10'daki mutasyonların incelenmesi ve ailevi akdeniz ateşi hastalığı ile bağlantılarının araştırılması
MEFV gene mutationson exon 10 in Turkish population and correlation between these mutations and FMF
AHMET ENVER ÇETİNÇELİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2001
Tıbbi Biyolojiİstanbul ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. NUR BUYRU
- Ailevi akdeniz ateşi (AAA) olan hastalarda serum amiloid A1, serum amiloid A2 ve apolipoprotein E genlerinin hastalıkla ilişkisinin incelenmesi
Investigation of the relation between serum amyloid A1, serum amyloid A2 and apolipoprotein E genes and familial mediterranean fever
BÜLENT TEKİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2003
Tıbbi Biyolojiİstanbul ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. A. NUR BUYRU
- Türk toplumunda nadir görülen FMF mutasyonları
Rare FMF (familial mediterranean fever) mutations in Turkish population
AYŞENUR ÖZTÜRK
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
BiyolojiAnkara ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF.DR. NEJAT AKAR
- MEFV geninde 'mutasyon saptanamayan veya tek mutasyon saptanan' ailesel Akdeniz ateşi olgularında, farklı gen varyantlarının araştırılması
Investigation of familial mediterranean fever cases without MEFV mutation or with single MEFV mutation for different gene variants
MEHMET KOCABEY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
GenetikDokuz Eylül ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZLEM GİRAY BOZKAYA
- MEFV genindeki 138.ve 165.kodon polimorfizmlerinin ilevi Akdeniz Ateşi hastalığına etkisinin araştırılması
Research on the impact of the (A-G) 138 and (C-A) 165 codon polymorphisms in MEFV gene over the familial mediterranean fever
MUSTAFA FERHAT ÖKSÜZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
RomatolojiUludağ Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KAMİL DİLEK