Geri Dön

Hepatosellüler karsinoma mikrodizin ekspresyon verilerinin in silico modellenmesi

In silico modelling of the hepatocellular carcinoma microarray expression data

  1. Tez No: 242223
  2. Yazar: GÖKHAN KARAKÜLAH
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ŞERİFE ESRA ERDAL, PROF. DR. OĞUZ DİCLE
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıp Bilişimi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 56

Özet

Bu çalışmada, HCC hücrelerinde Lityum etkisi ile meydana gelen proliferasyon inhibisyonunda, ekspresyonu transkript düzeyinde değişen genler ve bu genlerin yer aldığı sinyal yolaklarının tanımlanması için, Huh7 hücre hattı kullanılarak elde edilen ekspresyon mikrodizini veri setleri çözümlendi. İlk olarak, 48 saat, 20 mM LiCl uygulanmış ve uygulanmamış Huh7 hücrelerinden elde edilen, genom düzeyinde ekspresyon profilleri, Mikrodizin Anlamlılık Analizi yöntemi kullanılarak analiz edildi. İstatistiksel anlamlılık testi sonrası, Huh7 hücre hattında kontrole kıyasla anlamlı olarak artma ve azalma gösteren 1807 genin var olduğunu tespit edildi. (FDR

Özet (Çeviri)

In this study, the expression microarray data sets were obtained by using Huh7 cell line were analyzed to identify the genes, expressions of those changed at transcript-level during proliferation inhibition by the action of Lithium in HCC cells, and the pathways involving those genes. Firstly, the genome-wide expression profiles obtained from Huh7 cells treated with 20 mM LiCl for 48 hours and untreated, were analyzed using Significance Analysis of Microarray method. After statistical significance testing, it was determined that there were significantly up and down regulated 1807 genes in Huh7 cell line in comparison to control condition (FDR

Benzer Tezler

  1. Hepatit C virüs-ilişkili hepatoselüler karsinomda moleküler patogenezin ve yeni biyobelirteçlerin biyoinformatik analiz ile araştırılması

    Investigation of molecular pathogenesis and novel biomarkers in hepatitis C virus-associated hepatocellular carcinoma by bioinformatics analysis

    YAĞMUR KURT DEMİRTAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyokimyaEge Üniversitesi

    Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SEVCAN ATAY

  2. Hepatoselüler karsinom gelişiminde Tiyoredoksin Etkileşimli Protein(TXNIP)'in rolü

    The role of Thioredoxin Interacting Protein in hepatocellular carcinoma development.

    AYŞİM GÖZÜKIZIL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    Tıbbi BiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEŞE ATABEY

  3. Hepatoselüler karsinoma hücrelerinin epitelyal-mezenkimal dönüşüm sürecinde mikro-RNA'ların rolünün belirlenmesi

    The role of micro-RNAs in epithelial-mesenchymal transition of hepatocellular carcinoma cells

    PEYDA KORHAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Tıbbi BiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Temel Tıp Bilimleri Bölümü

    PROF. DR. SAFİYE NEŞE ATABEY

  4. In silico analysis of mutant p53(R249S) oncogenicity in Hepatocellular carcinoma

    Hepatosellüler karsinomadaki mutant p53(R249S) onkojenisitenin in silico analizi

    GUVANCHMURAD OVEZMURADOV

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2007

    Biyoistatistikİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. RENGÜL ÇETİN ATALAY

  5. Roles of senescence escape and epigenetic modifications in liver cancer

    Karaciğer kanserinde senesanstan kaçış ve epigenetik modifikasyonların rolleri

    GÖKHAN YILDIZ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK