Hepatosellüler karsinoma mikrodizin ekspresyon verilerinin in silico modellenmesi
In silico modelling of the hepatocellular carcinoma microarray expression data
- Tez No: 242223
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ŞERİFE ESRA ERDAL, PROF. DR. OĞUZ DİCLE
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıp Bilişimi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 56
Özet
Bu çalışmada, HCC hücrelerinde Lityum etkisi ile meydana gelen proliferasyon inhibisyonunda, ekspresyonu transkript düzeyinde değişen genler ve bu genlerin yer aldığı sinyal yolaklarının tanımlanması için, Huh7 hücre hattı kullanılarak elde edilen ekspresyon mikrodizini veri setleri çözümlendi. İlk olarak, 48 saat, 20 mM LiCl uygulanmış ve uygulanmamış Huh7 hücrelerinden elde edilen, genom düzeyinde ekspresyon profilleri, Mikrodizin Anlamlılık Analizi yöntemi kullanılarak analiz edildi. İstatistiksel anlamlılık testi sonrası, Huh7 hücre hattında kontrole kıyasla anlamlı olarak artma ve azalma gösteren 1807 genin var olduğunu tespit edildi. (FDR
Özet (Çeviri)
In this study, the expression microarray data sets were obtained by using Huh7 cell line were analyzed to identify the genes, expressions of those changed at transcript-level during proliferation inhibition by the action of Lithium in HCC cells, and the pathways involving those genes. Firstly, the genome-wide expression profiles obtained from Huh7 cells treated with 20 mM LiCl for 48 hours and untreated, were analyzed using Significance Analysis of Microarray method. After statistical significance testing, it was determined that there were significantly up and down regulated 1807 genes in Huh7 cell line in comparison to control condition (FDR
Benzer Tezler
- Hepatit C virüs-ilişkili hepatoselüler karsinomda moleküler patogenezin ve yeni biyobelirteçlerin biyoinformatik analiz ile araştırılması
Investigation of molecular pathogenesis and novel biomarkers in hepatitis C virus-associated hepatocellular carcinoma by bioinformatics analysis
YAĞMUR KURT DEMİRTAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyokimyaEge ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SEVCAN ATAY
- Hepatoselüler karsinom gelişiminde Tiyoredoksin Etkileşimli Protein(TXNIP)'in rolü
The role of Thioredoxin Interacting Protein in hepatocellular carcinoma development.
AYŞİM GÖZÜKIZIL
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
Tıbbi BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEŞE ATABEY
- Hepatoselüler karsinoma hücrelerinin epitelyal-mezenkimal dönüşüm sürecinde mikro-RNA'ların rolünün belirlenmesi
The role of micro-RNAs in epithelial-mesenchymal transition of hepatocellular carcinoma cells
PEYDA KORHAN
Doktora
Türkçe
2014
Tıbbi BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiTemel Tıp Bilimleri Bölümü
PROF. DR. SAFİYE NEŞE ATABEY
- In silico analysis of mutant p53(R249S) oncogenicity in Hepatocellular carcinoma
Hepatosellüler karsinomadaki mutant p53(R249S) onkojenisitenin in silico analizi
GUVANCHMURAD OVEZMURADOV
Yüksek Lisans
İngilizce
2007
Biyoistatistikİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. RENGÜL ÇETİN ATALAY
- Roles of senescence escape and epigenetic modifications in liver cancer
Karaciğer kanserinde senesanstan kaçış ve epigenetik modifikasyonların rolleri
GÖKHAN YILDIZ
Doktora
İngilizce
2013
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK