Seftazidime dirençli Pseudomonas aeruginosa suşlarında Per-1 enziminin sınıf-1 integronlarla ilişkisinin moleküler yöntemlerle araştırılması
İnvestigation of the relationshepbetween class-1 integrons and Per-1 enzyme in ceftazidime resistance pseudomonas aeruginosa
- Tez No: 247318
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ASUMAN BİRİNCİ
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Pseudomonas aeruginosa, beta-laktamaz, PER-1, sınıf-1 integron, Pseudomonas aeruginosa, beta-lactamase, PER-1, class-1 integron
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 84
Özet
Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) çoğunlukla hastane infeksiyonları etkeni olan, yüksek mortalite ve morbiditeye yol açan önemli bir patojendir. P. aeruginosa'da beta-laktam antibiyotiklere direnç mekanizmalarından en sık görüleni beta-laktamaz üretimidir. PER-1 enzimi, sınıf A'da yer alan TEM veya SHV türevi olmayan bir genişlemiş spektrumlu beta laktamaz türevi olup özellikle seftazidim direncine yol açmaktadır. PER-1 gibi beta-laktamaz enzimlerini kodlayan direnç genleri integronlar gibi hareketli genetik elementler aracılığıyla bakteriler arasında aktarılabilmektedir.Bu çalışmada, hastane infeksiyonu etkeni P. aeruginosa suşlarında seftazidim direncine neden olan PER-1 enziminin varlığını göstermek, görülme sıklığını ortaya koymak ve sınıf-1 integronlarla ilişkisini saptayarak yeni oluşacak hastane infeksiyonu olgularını kontrol altına almak hedeflenmektedir.Seftazidime dirençli 100 adet Pseudomonas aeruginosa suşında PER-1 gen bölgesi polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile tespit edildi. Suşların RAPD-PZR yöntemiyle klonal yakınlıkları belirlendi. PER-1 enzimi taşıyan 40 suşta integronların 5' ve 3' korunmuş bölgelerine özgü primerler kullanılarak PZR ile sınıf-1 integronların varlığı araştırıldı. Farklı RAPD-PZR paternlerini temsil eden suşlarda, blaPER-1 ve sınıf-1 integronların korunmuş bölgelerine özgü primerler kombine edilerek gerçekleştirilen PZR ile PER-1 geninin sınıf-1 integronlar ile ilişkisi araştırıldı.İncelenen suşlarda %40 oranında PER-1 enzimi tespit edildi. Pseudomonas aeruginosa suşları arasında saptanan dört ana klonun yüksek prevalanstan sorumlu olduğu RAPD-PZR sonuçları ile ortaya kondu. PER-1 enzimi taşıyan suşlarda %62.5 oranında sınıf-1 integron saptandı ve 2 adet Pseudomonas aeruginosa suşunda PER-1 geninin sınıf-1 integronlarla ilişkili olduğu gösterildi. Hastanemizde PER-1 enziminin yaygın olduğu ve bu enzimi üreten birçok suşun ?klonal ilişkili? oluşunun horizontal yayılıma işaret ettiği, blaPER-1'in sınıf-1 integronlarla ilişkili olmasının bu genin yayılımını hızlandırabileceği sonucuna varıldı.
Özet (Çeviri)
Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) is an important pathogen that causes nosocomial infections and highly leads to mortality and morbidity. The most encountered resistant mechanism against beta lactam antibiotics is beta-lactamase production in P.aeruginosa. PER-1 enzyme is derived from an extended spectrum beta-lactamase that is non-TEM-, non-SHV-derived in class A and especially causes ceftazidime resistance. The resistance genes that encode beta lactamase enzymes such as PER-1 can be transferred among bacteria by mobile genetic elements such as integrons.In this study, it is aimed to determine the PER-1-type- beta lactamase enzyme that causes ceftazidime resistance by molecular methods, determine the frequency and detect the relationship between the enzyme and class-1 integrons .PER-1 gene was detected in 100 ceftazidime resistant Pseudomonas aeruginosa strains by polymerase chain reaction (PCR). The clonal relationship between strains was determined by RAPD-PCR. The existence of class 1 integron was investigated in 40 PER-1 enzyme bearing strains with using primers that are specific to 5? and 3? conserved segments of class-1 integrons by PCR. The association between PER-1 gene and class-1 integrons was investigated with combining primers that are specific for conserved segments of blaPER-1 and class-1 integrons by PCR in representative strains that possess different RAPD-PCR patterns.PER-1 gene was detected in 40% of the isolates. It is exhibited that four principal clones that were detected in Pseudomonas aeruginosa strains were responsible for high prevalence by RAPD-PCR results. Class-1 integron was detected in 62.5% of the PER-1 enzyme bearing strains and association between PER-1 gene and class-1 integrons was shown in 2 Pseudomonas aeruginosa strain. We concluded that PER-1 enzyme is common in our hospital and the existence of the clonal relationship between enzyme bearing strains indicates horizontal dissemination, the association between blaPER-1 and class-1 integrons can accelerate dissemination of this gene.
Benzer Tezler
- Hastane infeksiyonu etkeni pseudomonas aeruginosa'da PER-1 beta-laktamaz enziminin saptanması
Başlık çevirisi yok
AYNUR ATİLLA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2003
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıOndokuz Mayıs ÜniversitesiKlinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CAFER EROĞLU
- Ceftazidime dirençli pseudumonas aeruginosa izolatlarında per-1 ve oxa-10 benzeri beta-laktamazların moleküler yöntemlerle belirlenmesi
Determination of per-1 and oxa-10-like beta-lactamases in ceftazidime-resistant pseudomonas aeruginosa isolates by molecular methods
MEHTAP ÜNLÜ SÖĞÜT
Doktora
Türkçe
2008
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıOndokuz Mayıs ÜniversitesiTemel Tıp Bilimleri Bölümü
DOÇ. DR. ASUMAN BİRİNCİ
YRD. DOÇ. DR. TUBA YILDIRIM
- Kastamonu eğitim ve araştırma hastanesinden izole edilen seftazidime dirençli Pseudomonas aeruginosa izolatlarında PER-1 ve OXA-10 benzeri genişlemiş spektrumlu βeta-laktamaz varlığının araştırılması
Investigation of the presence of PER-1 and OXA-10 like extended spectrum βeta-lactamases in ceftazidime resistant Pseudomonas aeruginosa strains from Kastamonu training and research hospital
SARAH AKAR ALI AL-OGAILI
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
GenetikKastamonu ÜniversitesiGenetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YASEMİN ÇELİK ALTUNOĞLU
- Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarında PER-1, OXA-10 ve VEB-1 tip genişlemiş spektrumlu beta laktamaz enzimlerinin varlığının araştırılması
Investigation of the presence of PER-1, OXA-10 and VEB-1 type extended spectrum beta lactamase in Pseudomonas aeruginosa strains isolated from clinical specimens
OSMAN ACAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
MikrobiyolojiPamukkale ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MELEK DEMİR
- Pseudomonas aeruginosa'nın tanımlanması ve metallo-beta-laktamaz enziminin fenotipik ve genotipik yöntemlerle belirlenmesi
Identifying of Pseudomonas aeruginosa and detection of metallo-beta-lactamase enzyme by phenotypic and genotypic methods
SEZEN BİLEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
BiyoteknolojiHacettepe ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
ÖĞR. GÖR. IŞIL SEYİS BİLKAY