Geri Dön

Acınetobacter baumannıı'nin klinik izolatlarının çoklu ilaç direncinde AdeABC aktif pompasının rolü

The role of AdeABC efflux pump in multi-drug resistance acinobacter baumannsi clinical isolates

PDF İndir

  1. Tez No: 247659
  2. Yazar: TUBA DAL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MÜNEVVER UFUK HASDEMİR
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Acinetobacter baumannii, çoklu ilaç direnci, aktif pompa, AdeABC, NMP, PAßN, Acinetobacter baumannii, çoklu ilaç direnci, aktif pompa, AdeABC, NMP, PAßN
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Marmara Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 60

Özet

Acinetobacter baumanii, özellikle yoğun bakım ünitelerinde yatan hastalarda, ciddi, hayatı tehdit eden enfeksiyonlara neden olan fırsatçı bir patojendir. Çoklu ilaç direnci gösteren A. baumanii izolatlarının sayısının giderek artışı böyle dirençli izolatların neden olduğu enfeksiyonların tedavisine yaklaşımda ciddi sorunlar yaratmaktadır. Son yıllarda yapılan çalışmalar bu mikroorganizmanın çoklu ilaç direncinde, `resistance-nodulation-division' RND tipi bir aktif ilaç pompa sisteminin, AdeABC'nin, etkin rol oynadığına dikkat çekmektedir. Bu çalışmada biz 2008 yılı boyunca hastanemizde izole edilen 14 A. baumanii izolatının çoklu ilaç direncinde bu pompa sisteminin etkinliğini araştırmayı hedefledik. Bu amaçla, izolatlarda 6 antibiyotiğin (siprofloksasin, gentamisin, eritromisin, kloramfenikol, tetrasiklin, trimetoprim) minimum inhibitör konsantrasyonları (MİK), RND tipi pompa inhibitörleri `phenylalanyl-arginyl-ß-naphtylamide' (PAßN) ve `1-(1-naphythylmethyl)-piperazine' (NMP) varlığında ve yokluğunda sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle araştırılmış ve pompa inhibitörleri varlığında antibiyotik MİK'lerindeki değişimler kaydedilmiştir. Öte yandan, AdeABC çoklu ilaç direnç pompasının esas transport proteini olan AdeB'yi kodlayan adeB geninin transkripsiyon düzeyleri de izolatlarda RT-PCR'la araştırılmıştır. İzolatların 8'inde %57,1'inde ortamda aktif pompa inhibitörleri varlığında test edilen antibiyotiklerin MİK'lerinde 2-8 kat düşüş gözlenmiştir. Grup I olarak adlandırılan bu izolatlarda test edilen antibiyotiklerin MİK'lerinde NMP ortalama 3,74 katlık; PAßN ise ortalama 1,4 katlık düşüşe neden olmuştur. Bu bulgular izolatlarımızın önemli bir bölümünün çoklu ilaç direncinde, RND tipi bir aktif ilaç pompasının etkin rol oynadığını göstermektedir. Test ortamında NMP varlığı grup I izolatlardan 7 no.lu izolatta trimetoprim ve tetrasiklin MİK'lerinin duyarlılık sınır değerlerinin altına düşmesine neden olmuştur. Benzer şekilde 5 no.lu izolat için de sıvı mikrodilüsyon testinde ortamda NMP varlığı, siprofloksasin MİK'iniiiiorta hassas sınırına kadar çekmiştir. Bu saptamalar söz konusu izolatların adı geçen antibiyotiklere direncinden, esas olarak RND tipi bir aktif ilaç pompasının sorumlu olduğunu kuvvetle düşündürmektedir. Antibiyotik MİK'lerinde NMP'nin PAßN'e kıyasla daha belirgin düşüşlere yol açması, bu pompa inhibitörünün A.baumanii'de RND tipi aktif ilaç pompasının inhibisyonunda daha etkin olduğunu göstermektedir. Çalışmamızda kloramfenikol ve siprofloksasin, NMP ve PAßN'in MİK'lerinde en fazla düşüşe yol açtığı antibiyotikler olarak saptanmışlardır.İzolatlarımızın adeB transkripsiyon düzeylerinin saptandığı RT-PCR çalışması sonuçları, pompa inhibitörleri (özellikle NMP) varlığında yapılan sıvı mikrodilüsyon testlerinde antibiyotik MİK'lerinde belirgin düşüşlerin saptandığı grup I izolatların adeB transkripsiyon düzeylerinin (0,75-1,5); pompa inhibitörlerine duyarlı fenotip göstermeyen grup II izolatlarınkine (0,04-0,66) kıyasla belirgin olarak yüksek olduğunu ortaya koymuştur. RT-PCR çalışması ayrıca grup I izolatların önemli bir kısmının (5,7,9,13,14) adeB transkripsiyon düzeylerinin, AdeB proteinini yüksek düzeyde eksprese ettiği bilinen standart SBMox2 izolatından daha yüsek düzeyde transkribe ettiklerini göstermiştir.Tüm bu sonuçlar ışığında, A.baumannii izolatlarımızın çoklu ilaç direncine, RND tipi bir aktif pompanın, büyük olasılıkla da AdeABC pompasının, önemli katkıda bulunduğu kanısındayız.

Özet (Çeviri)

Acinetobacter baumanii, özellikle yoğun bakım ünitelerinde yatan hastalarda, ciddi, hayatı tehdit eden enfeksiyonlara neden olan fırsatçı bir patojendir. Çoklu ilaç direnci gösteren A. baumanii izolatlarının sayısının giderek artışı böyle dirençli izolatların neden olduğu enfeksiyonların tedavisine yaklaşımda ciddi sorunlar yaratmaktadır. Son yıllarda yapılan çalışmalar bu mikroorganizmanın çoklu ilaç direncinde, `resistance-nodulation-division? RND tipi bir aktif ilaç pompa sisteminin, AdeABC?nin, etkin rol oynadığına dikkat çekmektedir. Bu çalışmada biz 2008 yılı boyunca hastanemizde izole edilen 14 A. baumanii izolatının çoklu ilaç direncinde bu pompa sisteminin etkinliğini araştırmayı hedefledik. Bu amaçla, izolatlarda 6 antibiyotiğin (siprofloksasin, gentamisin, eritromisin, kloramfenikol, tetrasiklin, trimetoprim) minimum inhibitör konsantrasyonları (MİK), RND tipi pompa inhibitörleri `phenylalanyl-arginyl-ß-naphtylamide? (PAßN) ve `1-(1-naphythylmethyl)-piperazine? (NMP) varlığında ve yokluğunda sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle araştırılmış ve pompa inhibitörleri varlığında antibiyotik MİK?lerindeki değişimler kaydedilmiştir. Öte yandan, AdeABC çoklu ilaç direnç pompasının esas transport proteini olan AdeB?yi kodlayan adeB geninin transkripsiyon düzeyleri de izolatlarda RT-PCR?la araştırılmıştır. İzolatların 8?inde %57,1?inde ortamda aktif pompa inhibitörleri varlığında test edilen antibiyotiklerin MİK?lerinde 2-8 kat düşüş gözlenmiştir. Grup I olarak adlandırılan bu izolatlarda test edilen antibiyotiklerin MİK?lerinde NMP ortalama 3,74 katlık; PAßN ise ortalama 1,4 katlık düşüşe neden olmuştur. Bu bulgular izolatlarımızın önemli bir bölümünün çoklu ilaç direncinde, RND tipi bir aktif ilaç pompasının etkin rol oynadığını göstermektedir. Test ortamında NMP varlığı grup I izolatlardan 7 no.lu izolatta trimetoprim ve tetrasiklin MİK?lerinin duyarlılık sınır değerlerinin altına düşmesine neden olmuştur. Benzer şekilde 5 no.lu izolat için de sıvı mikrodilüsyon testinde ortamda NMP varlığı, siprofloksasin MİK?iniiiiorta hassas sınırına kadar çekmiştir. Bu saptamalar söz konusu izolatların adı geçen antibiyotiklere direncinden, esas olarak RND tipi bir aktif ilaç pompasının sorumlu olduğunu kuvvetle düşündürmektedir. Antibiyotik MİK?lerinde NMP?nin PAßN?e kıyasla daha belirgin düşüşlere yol açması, bu pompa inhibitörünün A.baumanii?de RND tipi aktif ilaç pompasının inhibisyonunda daha etkin olduğunu göstermektedir. Çalışmamızda kloramfenikol ve siprofloksasin, NMP ve PAßN?in MİK?lerinde en fazla düşüşe yol açtığı antibiyotikler olarak saptanmışlardır.İzolatlarımızın adeB transkripsiyon düzeylerinin saptandığı RT-PCR çalışması sonuçları, pompa inhibitörleri (özellikle NMP) varlığında yapılan sıvı mikrodilüsyon testlerinde antibiyotik MİK?lerinde belirgin düşüşlerin saptandığı grup I izolatların adeB transkripsiyon düzeylerinin (0,75-1,5); pompa inhibitörlerine duyarlı fenotip göstermeyen grup II izolatlarınkine (0,04-0,66) kıyasla belirgin olarak yüksek olduğunu ortaya koymuştur. RT-PCR çalışması ayrıca grup I izolatların önemli bir kısmının (5,7,9,13,14) adeB transkripsiyon düzeylerinin, AdeB proteinini yüksek düzeyde eksprese ettiği bilinen standart SBMox2 izolatından daha yüsek düzeyde transkribe ettiklerini göstermiştir.Tüm bu sonuçlar ışığında, A.baumannii izolatlarımızın çoklu ilaç direncine, RND tipi bir aktif pompanın, büyük olasılıkla da AdeABC pompasının, önemli katkıda bulunduğu kanısındayız.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    230476

    Çok ilaca dirençli gram negatif ve gram pozitif bakterilerin direnç inhibisyonuna efluks pompa inhibitörlerinin etkilerinin in vitro araştırılması

    In vitro investigation of the effects of the efflux pump inhibitors to the resistance inhibition of multidrug resistant gram negative and gram positive bacteria

    EBRU ÇETİNKAYA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    MikrobiyolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AHMET YILMAZ ÇOBAN

  2. Tez No

    359122

    Klinik örneklerden izole edilen çoklu ilaç dirençli Acinetobacter baumannii suşlarında bazı karbapenemazların genotipik yöntemlerle araştırılması

    Investigation of some carbapenemases by genotypic methods in multi-drug resistant Acinetobacter baumannii strains isolated from clinical specimens

    NİDA ÖZCAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiDicle Üniversitesi

    Temel Tıp Bilimleri Bölümü

    PROF. DR. KADRİ GÜL

  3. Tez No

    535883

    Klinik kaynaklı acinetobacter baumannii izolatlarında patotip- rezistotip-genotip kümelenmesi varlığının araştırılması

    Investigation of pathotype, resistotype and genotype clustering in acinetobacter baumannii isolates of clinical origin

    İNCİ DENİZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Moleküler TıpYeditepe Üniversitesi

    Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İBRAHİM ÇAĞATAY ACUNER

  4. Tez No

    782832

    Investigation of antibiotic susceptibility rateof Acinetobacter baumannii isolates identified from blood cultures

    N kültürlerinde üreyen acinetobacter baumannii izolatlarının antibiyotik duyarlılıklarının araştırılması

    ZAID FARIS HASAN KHOSHNAW

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    MikrobiyolojiTokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. UMUT SAFİYE ŞAY COŞKUN

  5. Tez No

    409496

    Acınetobacter baumannii izolatlarında çeşitli antibiyotik kombinasyonlarının sinerjistik etkisinin dama tahtası yöntemiyle araştırılması

    Investigation of the synergistic effects of various antibiotic combinations in acinetobacter baumannii isolates using the checkerboard method

    NİLGÜN ONGUN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    MikrobiyolojiAbant İzzet Baysal Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FIRAT ZAFER MENGELOĞLU

Geri Dön