Determination of genetic diversity in cucumber (Cucumis sativus L.) germplasms
Hıyar (Cucumis sativus L.) germplazmlarında genetik çeşitliliğin belirlenmesi
- Tez No: 252247
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SAMİ DOĞANLAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2009
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 40
Özet
Bu çalışmada 96 hıyar (Cucumis sativus L. var. sativus) hattı, PCR tabanlı moleküler işaretleyici sistemlerden biri olan SRAP (Sequence Related Amplified Polymorphism) kullanılarak karakterize edilmiştir.Toplamda 45 SRAP kombinasyonu kullanılmış, bunlardan 31 kombinasyon iyi amplifiye olmuş ve polimorfizm göstermiştir. 153 SRAP fragmenti elde edilmiş ve 138 fragment polimorfik bulunmuştur. Bu veriler Türk hıyar hatlarının genetik uzaklığını belirlemekte ve genetik uzaklık ağacını çizmekte kullanılmıştır. Genetik ağaçlar, UPGMA (Unweighted Pair Group Method) ve Unweighted Neighbour-Joining metodları kullanılarak çizilmiştir. UPGMA methodu ile çizilen genetik ağaca göre hıyar hatları 4 gruba ayrılmıştır. Grup B genetik olarak birbirine en benzer hatlardan oluşmuş ve en küçük benzerlik değeri 0,82 dir. Grup D ise birbirine genetik olarak birbirinden en farklı hatlardan oluşmuştur. Genetik ağacın genetik aralığı 0,16 ile 0,99 arasında değişiklik göstermiştir. Neighbour-joining metodu ile çizilen ağaçtada hıyar hatları benzer gruplanma göstermiştir. Bu sonuçlar Türk hıyarının genetik olarak oldukça çeşitli olduğunu ve hıyar genetik çeşitliliğini arttırmak için bir potansiyele sahip olduğunu göstermiştir.
Özet (Çeviri)
In this study, 92 Turkish cucumber (Cucumis sativus L. var. sativus) accessions were characterized by using SRAP (Sequence Related Amplified Polymorphism) which is a PCR-based moleculer marker system.A total of 45 SRAP combinations were used and 31 of these combinations amplified well and also showed polymorphism. Thus, 153 SRAP fragments were obtained and 138 fragments were polymorphic. These data were used to determine genetic distance and draw genetic distance dendrograms of Turkish cucumber accessions. Dendrograms were drawn using both UPGMA (Unweighted Pair Group Method) arithmetical averages and Unweighted Neighbour-Joining methods. According to the UPGMA dendrogram, the cucumber accessions clustered into four groups. Group B was composed of the genetically most related accessions with a minimum similarity of 0,82. Group D was composed of genetically most distinct accessions. The genetic distances of the dendrogram varied between 0,16 and 0,99. The neighbour-joining dendrogram showed similar clustering of the cucumber accessions. The results showed that Turkish cucumber is genetically quite diverse and has the potential for broadening the genetic base of cucumber.
Benzer Tezler
- Bazı hıyar (Cucumis sativus L.) genotiplerinin morfolojik ve moleküler karakterizasyonu
Morphological and molecular characterization of some cucumber (Cucumis sativus L.) genotypes
ALAA SAYED IBRAHIM
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
ZiraatIsparta Uygulamalı Bilimler ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YAŞAR KARAKURT
- Türkiye'deki bazı deniz hıyarı (Aspidochirotida: Holothuroidea) türlerinin genetik yapısının MtDNA COI ve 16S rRNA gen bölgelerinin dizi analizi ile belirlenmesi
Determination of genetic structure of some sea cucumber species (Aspidochirotida: Holothuroidea) in Turkey by sequence analysis of MtDNA COI and 16S rRNA gene regions
OZAN ŞEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Balıkçılık TeknolojisiOrdu ÜniversitesiBalıkçılık Teknolojisi Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YILMAZ ÇİFTCİ
- Domates tohumlarında genetik çeşitliliğin moleküler yöntemlerle belirlenmesi
Determination of genetic diversity in tomato seeds by molecular methods
GÜLHAN KAYGUSUZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BotanikEge ÜniversitesiTohumluk Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İSMAİL CAN PAYLAN
- Determination of genetic diversity in watermelon (Citrullus lanatus (Thunb.) Matsum & Nakai) germplasms
Karpuz (Citrullus lanatus (Thunb.) Matsum & Nakai) germplazmlarında genetik çeşitliliğin belirlenmesi
ZEHRA İPEK ULUTÜRK
Yüksek Lisans
İngilizce
2009
Biyolojiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ANNE FRARY
- İran'da yetiştirilen önemli buğday (Triticum spp.) çeşitlerinde genetik farklılığın gliadin elektroforegramı yöntemi ile belirlenmesi
Determination of genetic diversity in important Iranian wheat (Triticum spp.), cultivars by gliadin electrophoregram method
MAHSA POURALI KAHRİZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
BiyolojiAnkara ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. A. MURAT ÖZGEN