Geri Dön

Baharatlarda Esherichia coli O157:H7'nin aranmasında klasik mikrobiyolojik yöntem ile real-time PCR yöntemiyle karşılaştırılması

Comparison of conventional microbiological methods and real-time PCR method to detect Esherichia coli O157:H7 in spices

  1. Tez No: 256653
  2. Yazar: ASLI ÖZKIZILCIK
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. MUSTAFA ATEŞ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 110

Özet

İzmir'de bir sterilizasyon firmasından alınan 66 farklı baharat örneği (15 kimyon, 10 kekik, 5 biberiye, 9 kişniş, 8 anason, 5 defne, 6 rezene, 8 adaçayı) analiz edilmiştir. Bunun yanı sıra toplam mikrobiyal yükün bilinmesi açısından aerobik mezofilik bakteri, küf-maya, koliform grubu bakteriler, fekal koliform, Bacillus sp. sayımları yapılmış ve Salmonella sp. varlığına bakılmıştır.Sonuç olarak bütün örneklerde toplamda Bacillus sp. sayısı 9,9 x101 kob/g ile 1,6 x 102 kob/g, aerobik mezofilik bakterilerin sayıları 5,1x103 kob/g ile 2,0x108 kob/g, küf-maya sayıları 1,1x102 kob/g ile 1,2 x 104 kob/g, koliform sayısı bütün örnekler için ortalama 7,8 x 102 kob/g olarak bulunmuştur. Yapılan analizlerde her iki yöntem ile 66 farklı örneğin hiçbirisinde E.coli O157:H7 ve Salmonella belirlenmemiştir.E. coli O157:H7 için uygulanan klasik yöntem 4-5 gün sürerken Real-Time PCR ile yapılan yöntemde ön zenginleştirme dahil yaklaşık 18 saat sürmüştür. Ayrıca klasik yöntemde pozitif gibi görünen sonuçlar latex aglütinasyon testi uygulandığında negatif sonuç vermiştir. Bu durumda, klasik yöntemin kesinliği şüphe uyandırmaktadır ve alternatif yöntem olarak Real-Time PCR düşünülebilir.

Özet (Çeviri)

66 different spice samples (15 cummin, 10 thyme, 5 rosemary, 9 coriander, 8 aniseed, 5 bay, 6 fennel, 8 sage), collected from a spice sterilization company in Izmir, were analysed. Besides, total aerobic mesophilic bacteria, mold, coliform, fecal coliform, Bacillus sp. in samples were counted and presence of Salmonella sp. was investigated to determine total microbial load in samples.As a result, it was found that Bacillus sp. counts were 9,9 x101-1,6 x 102 cfu/g, aerobic mesophilic bacteria counts were 5,1x103-2,0x108 cfu/g, mold count was 1,1x102-1,2 x 104 cfu/g and coliform count was approximately 7,8 x 102 cfu/g in all samples. In these analyses, E. coli O157:H7 and Salmonella sp. were not detected in any of the 66 samples by both conventional cultural method and Real-Time PCR method in samples.While the conventional cultural method applied for E. coli O157:H7 lasted in 4-5 days, the duration for the Real-Time PCR method was approximately 18 hours including the pre-enrichment step. Besides, the results which seemed positive in conventional cultural method, was found negative when latex agglutination test was applied. In this case, accuracy of conventional method causes suspicion and Real-Time PCR can be considered as an alternative method.

Benzer Tezler

  1. Mayoneze ilave edilen bazı baharatların Escherichia coli O157:H7 canlılığına etkisi

    Effect of some spices which were added to mayonnaise on survival of Escherichia coli O157:H7

    AYŞE TOK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Gıda MühendisliğiCelal Bayar Üniversitesi

    Y.DOÇ.DR. NURAL KARAGÖZLÜ

  2. Probiyotik laktik asit bakterileri ve baharatların bazı gıda patojenleri üzerine inhibisyon etkisi

    Inhibition effects against some pathogen food-borne bacteria of lactic acid bacteria and some spices

    ELÇİN TAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    BiyoteknolojiÇukurova Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ZERRİN ERGİNKAYA

  3. Bazı baharatlarda antimikrobiyal madde üreten bakterilerin belirlenmesi

    Identifying indigenous bacteria producing antimicrobial agents in some spices

    FATMA BOZANOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Gıda MühendisliğiErciyes Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HASAN YETİM

  4. Hamburger köftelerinin mikrobiyolojik özellikleri

    Microbiological properties of hamburger patties

    CEREN ÖZTÜRK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Gıda MühendisliğiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA EVREN

  5. Gama ışınları ve modifiye atmosferde ambalajlamanın bazı baharatların sterilizasyonu ve kalitesi üzerine etkileri

    The effects of gamma irradiation and modified atmosphere packaging on sterilization and quality of some spices

    CELALE KIRKIN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜRBÜZ GÜNEŞ