Geri Dön

Transformation of Aspergillus sojae with Vitreoscilla hemoglobin gene

Vitreoscilla hemoglobin geniyle Aspergillus sojae?nin transformasyonu

  1. Tez No: 276974
  2. Yazar: BETÜL BARDAKCI
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. CANAN TARI, YRD. DOÇ. DR. ALPER ARSLANOĞLU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2010
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 98

Özet

Koji küfü olarak bilinen Aspergillus sojae, FDA tarafından genel olarak güvenli kabul edilmiştir. Bu organizmayla ilgili sınırlı sayıda çalışma rapor edilmiş olup, bu çalışma, A. sojae'nin Vitreoscilla hemoglobin geni kullanılarak transformasyonuyla ilgili yapılan tek çalışmadır. Mikroaerofilik koşullarda oxygen transferini artıran Vitreoscilla hemoglobini bir bakteriyel hemoglobindir. Yüksek oksijen miktarına ihtiyaç duyan endüstriyel fungal fermentasyonları, enzim, antibiyotik ve organik asit gibi değerli ürünlerin üretimi sırasında oksijen sınırlamasıyla karşılaştığından, bu sistemlere oksijen sağlamak üreticiler tarafından çözülmesi gereken önemli bir sorundur. Bu problemin çözümü için Vitreoscilla'dan elde edilen vgb geni ve rekombinant DNA teknolojisi kullanılması ile ilk etapta örnek olarak, A. sojae organizması model olarak önerilmiştir. Bu çalışmada üretilen ürün, gıda, ilaç, tekstil ve kağıt endüstrisinde geniş kullanım alanına sahip ekzo-polygalakturonaz enzimidir. Transformasyon aşaması için vgb geni ilk olarak ANIp4 plasmidine klonlanmıştır. Transforme edilmiş A. sojae hücrelerinin seçimi için UV mutasyonundan sonra üridin okzotrofik mutantlar seçilmeye çalışılmış, ancak, üridin destekli büyümeye dayalı seçim metodu ile A. sojae pyrG mutantlarının seçimi sonuç vermemiştir. Transformasyonun başarılı oluşu ilk olarak PCR analizleri ve gel electroforezi yöntemiyle daha sonra ise sekans analizi yöntemleriyle doğrulanmaya çalışılmıştır. Ancak kontaminasyondan ileri gelen problemlerden dolayı transformasyon işleminin tam olark gerçekleşip geçekleşmediğinde emin olunamamıştır.

Özet (Çeviri)

Aspergillus sojae known as koji mold is a non-aflatoxigenic fungus, designated with a GRAS status by FDA. This study considers the transformation of A. sojae with Vitreoscilla hemoglobin gene. Vitreoscilla hemoglobin is the bacterial hemoglobin, which enhances the oxygen transfer under microaerophilic conditions. Since industrial fungal fermentation with the high demand for oxygen are accounted to face oxygen limitations during the production of value added products like enzymes, antibiotics and organic acids; oxygen supply becomes an enormous problem to be solved by the manufacturers. To overcome this problem, an alternative solution using the vgb gene of Vitreoscilla and recombinant DNA technology and taking the A. sojae organism as model organism was proposed. The product of interest in this study was the exo-polygalacturonase enzyme known to have wide applications in food, pharmaceutical, textile and paper industries. Here vgb gene was tried to be introduced to A .sojae via both protoplasting and electroporation methods. For transformation process vgb gene was cloned initially into plasmid ANIp4. For the selection of transformed A. sojae cells, uridine auxotrophic mutants were tried to be selected after UV mutagenesis. However, using a procedure based on selection of uridine supported growth did not result in A. sojae pyrG mutants. The success of transformation was initially observed by means of PCR analysis and agarose gel electrophoresis, later this was try to be confirmed by sequence analysis and agarose gel electrophoresis. However, due to the contamination problems accounted in the procedures the transformation with both methods could not be assured.

Benzer Tezler

  1. Increase of alpha amylase production of aspergillus oryzae by electroporation

    Aspergillus oryza'de alfa amilaz ürtetiminin elektroporasyon yöntemi ile artırılması

    VELDA ÜNAL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1996

    Bilim ve TeknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. UFUK GÜNDÜZ

  2. Çeşitli kalem mürekkeplerinin fiziksel, kimyasal ve biyolojik koşullarda moleküler dönüşümlerinin incelenmesi

    Examination of molecular transformations of various pen inks under physical, chemical and biological conditions

    FATMA ÇAVUŞ YONAR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Adli Tıpİstanbul Üniversitesi

    Fen Bilimleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SALİH CENGİZ

  3. Characterization of Aspergillus oryzae transformed with a plasmid carrying alfa-amylase gene

    (Alfa)-amilaz geni taşıyan bir plazmid ile transforme edilmiş aspergillus aryzae'nin karakterizasyonu

    GÖKHAN TOLUN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. UFUK GÜNDÜZ

  4. Timokinonun mikrobiyal biyotransformasyonu

    Microbial transformation of thymoquinone

    GAMZE ÇAYIRDERE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    BiyoteknolojiAnadolu Üniversitesi

    Farmakognozi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATİH DEMİRCİ

  5. Bulgur kepeğinin ekstrüzyon ile ön işlemi ve enzimatik yolla ksilooligosakkarit üretimi

    Pretreatment of bulgur bran by extrusion and xylooligosaccharide production by enzymatic process

    RUKİYE ÇALIŞKAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Gıda MühendisliğiKaramanoğlu Mehmetbey Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SİBEL YAĞCI

    PROF. DR. DİDEM SUTAY KOCABAŞ