Molecular analysis of beta lactamases in clinical Acinetobacter baumannii isolates from intensive care units
Yoğun bakım ünitelerinden izole edilen klinik Acinetobacter baumannii izolatlarında beta-laktamazların moleküler analizi
- Tez No: 286266
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AYŞE GÜL GÖZEN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları, Mikrobiyoloji, Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2011
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Bölümü
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 88
Özet
Acinetobacter baumannii izolatlarında karbapenem direnci artmakta olan birhalk sağlığı problemidir ve enfeksiyonların tedavisinde önemli bir sorunoluşturmaktadır. Bugüne kadar A. baumannii izolatlarında çeşitli karbapenem hidrolizeden ß-laktamazlar tanımlanmıştır. Bu çalışmada Gülhane Askeri Tıp Akademisiyoğun bakım ünitelerinden izole edilen A. baumannii izolatlarında karbapenemdirenci multipleks PCR ve paralel fenotipik testlerle araştırılmıştır. Mayıs 2006 Ocak2010 yılları arasında 138 A. baumannii izolatı toplanmıştır. İzolatlar tür düzeyindetanımlanmış ve antimikrobiyal duyarlılık testleri yapılmıştır. İmipenem vemeropenemin MİK değerleri E-test metodu ile saptanmıştır. Karbapenemdirençli izolatlar takibeden çalişma için seçilmiştir. Öncelikle izolatlarda karbapenemazvarlığı gösterilmiştir. Metallo-beta-laktamazların (MBL) varlığı da araştırılmıştır.OXA carbapenemazların dört grubu (OXA-23, OXA-24, OXA-51 ve OXA-58)multiplex PCR yöntemiyle çalışılmıştır. Nükleotid dizi analizi yapılmıştır. Testlerdensonra saptanan 61 klinik izolatın hepsinin imipenem ve meropenem direnci gösterdiğibulundu. İmipenem ve meropenem için sırasıyla MİK50 16 and >32; MİK90 ise 192and >32 bulunmuştur. Modifiye Hodge Testi (MHT) 61 A. baumannii izolatınınhepsinde pozitif olarak tespit edildi. İzolatların hiçbiri MBL aktivitesi göstermedi. 61izolatın hepsi blaOXA-51 geni; 50 izolatta blaOXA-23 geni; 11 tanesindeyse blaOXA-58geni saptandı. OXA-24 enzimlerini kodlayan alellere hiçbir izolatta rastlanmadı. Buçalışma, bölgemizdeki klinik izolatlarda blaOXA-51, blaOXA-23, ve blaOXA-58 dirençgenlerinin bulunduğunu göstermiştir. Ancak, blaOXA-24 geni ya hiç bulunmamakta yada oldukça düşük frekansda bulunmaktadır.
Özet (Çeviri)
Carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii is a growing public healthconcern and represents a serious problem for treatment of the infection. Severalcarbapenem-hydrolysing ß-lactamases have been identified from A. baumannii so far.In this study carbapenem resistance in A.baumannii strains recovered from intensivecare units of Gulhane Military Medical Academy, Turkey, were investigated viamultiplex PCR and with parallel phenotypic tests. From June 2006 to January 2010,138 clinical A. baumannii isolates were collected. Identification and antimicrobialsusceptibility tests of the isolates were performed. The MICs of imipenem andmeropenem were determined by using E-test method. Carbapenem resistant A.baumannii strains were included for further study. Firstly, the presence ofcarbapenemases were determined. The presence of Metallo-beta-lactamase (MBL)were also investigated. Detection of the four groups of OXA carbapenemases (OXA-23, OXA-24, OXA-51 and OXA-58) was carried out using a multiplex PCR assay.Sequence analyses were performed. Non-duplicate, multidrug resistant 61 clinical A.baumannii isolates were found to be resistant to imipenem and meropenem. In the 61isolates, the MIC50 of imipenem and meropenem were 16 and >32; MIC90 were 192and >32 respectively. Modified Hodge Tests (MHT) were positive for all 61 A.baumannii strains. None of these isolates showed MBL activity. As determinedthrough multiplex PCR, all of the 61 isolates had blaOXA-51 genes, 50 isolates hadblaOXA-23, and 11 isolated had blaOXA-58 genes. Alleles encoding OXA-24-likeenzymes were not detected in any isolates. This study indicated that the clinicalisolates in our region contained blaOXA-51, blaOXA-23, and blaOXA-58 resistance genes.However, blaOXA-24 gene was either absent or occur in very low frequency.
Benzer Tezler
- Hastane kaynaklı Acınetobacter suşlarında karbapenem direncinin moleküler analizi ve suşlar arası klonal ilişkinin gösterilmesi
Molecular analysis of carbapenem resistance among hospital acquired Acinetobacter strains and determination of the clonal relations among the strains
NİHAL SARICA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
MikrobiyolojiGazi ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MELTEM YALINAY ÇIRAK
- Acinetobacter baumannii suşlarında OXA-23 ve OXA-58 tipi genişlemiş spektrumlu Beta laktamaz varlığının araştırılması ve PFGE yöntemi ile klonal yakınlığının incelenmesi
Detection of extended spectrum Beta lactamase type OXA-23 ve OXA-58 from the acinetobacter baumannii species and investigation of clonal relationship by PFGE
ŞERAFETTİN KEYİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
MikrobiyolojiSelçuk ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. UĞUR ARSLAN
- Klinik örneklerden izole edilen acınetobacter baumannıı izolatlarının epidemiyolojik özelliklerinin değerlendirilmesi
Evaluation of epidemiologic features of acinetobacter baumannii isolated from clinical samples
HAKAN KESKİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. F. ALPER TEKELİ
- Yoğun bakımda karbapenem dirençli acinetobacter baumannii enfeksiyonlarının klinik sonuçları ve moleküler olarak değerlendirilmesi
Clinical outcomes of acinetobacter baumannii infections in intensive care unit and moleculer investigation
ARZU NAZLI ZEKA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
MikrobiyolojiEge ÜniversitesiKlinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BİLGİN ARDA
- Yoğun bakım ünitelerinde yatmakta olan hastalardan izole edilen gram negatif basillerde sınıf I integronların saptanması ve genişlemiş spektrumlu beta-laktamazların moleküler analizi
Identification of class I integrons and molecular analysis of extended spectrum beta-lactamases in gram negative bacilli isolated from patients hospitalized in intensive care units
ÖZGEN KÖSEOĞLU ESER
Doktora
Türkçe
2004
MikrobiyolojiHacettepe ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ŞEMSETTİN USTAÇELEBİ