Geri Dön

Yoğun bakım ünitelerinde yatmakta olan hastalardan izole edilen gram negatif basillerde sınıf I integronların saptanması ve genişlemiş spektrumlu beta-laktamazların moleküler analizi

Identification of class I integrons and molecular analysis of extended spectrum beta-lactamases in gram negative bacilli isolated from patients hospitalized in intensive care units

  1. Tez No: 157925
  2. Yazar: ÖZGEN KÖSEOĞLU ESER
  3. Danışmanlar: PROF.DR. ŞEMSETTİN USTAÇELEBİ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: integron, genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz, Enterobacteriaceae, antibiyotik direnci, gen kasetleri, Integron, extended spectrum beta-lactamase, Enterobacteriaceae, antibiotic resistance, gene cassettes
  7. Yıl: 2004
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 75

Özet

ÖZET ESER KÖSEOĞLU, Ö., Yoğun bakım ünitelerinde yatmakta olan hastalardan izole edilen gram negatif basillerde sınıf 1 integronların saptanması ve genişlemiş spektrumlu beta-laktamazların moleküler analizi, Hacettepe Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Mikrobiyoloji Programı Doktora Tezi, Ankara, 2004. İntegronlar bölgeye özgül rekombinasyon yeteneğine sahip genetik elemanlardır. Bu çalışmanın amacı, Hacettepe Üniversitesi Hastanesi yoğun bakım ünitelerinde yatmakta olan hastalardan izole edilen Enterobacteriaceae klinik izolatlarında integron ve genişlemiş spektrumlu beta-laktamazların (GSBL) saptanmasıdır. Bu amaçla, bu izolatlar antibiyotik duyarlılığı, integron varlığı ve GSBL'larm moleküler analizi yönünden araştırılmıştır. Hacettepe Üniversitesi Hastanesi yoğun bakım ünitelerinde 2000 ve 2003 yıllarında yatmakta olan hastalardan izole edilen gram negatif bakteriler arasından rastgele seçilen 117 izolatın %69.9'unda değişik büyüklüklerde gen kaseti içeren integronlar saptanmıştır. İstatistiksel olarak kıyaslandığında integron pozitif izolatlar gentamisin, kinolon ve üçüncü kuşak sefalosporinlere, integron negatif izolatlara göre daha dirençli bulunmuştur. GSBL üretimi ile ilgili olarak National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS) tarafından önerilen tarama ve doğrulama testleri yapılmıştır. Çalışılan 1 17 enterik bakteri izolatı içinden 41'nin (%35.0) GSBL pozitif olduğu belirlenmiştir. Bunların hepsinin imipeneme duyarlı olduğu bulunmuştur. Beta-laktamaz varlığı Mûtem, blasnv ve Muctx-m için özgül primerlerle polimeraz zincir tepkimesi ile incelenmiştir. GSBL üreten 41 izolatm 20 'sinde CTX-M tipi GSBL (%48.8) saptanmıştır. Enterobacteriaceae izolatlarında olası bir plazmid aracılığıyla integron ve GSBL taşıyıcılığı arasında bir ilişki olduğunu düşündüren bir bulgu olarak, bu 20 izolatm hepsinde integron pozitif bulunmuştur. Bu çalışmanın sonuçları, hastanemiz yoğun bakım ünitelerinde izole edilen gram negatif basillerde sınıf 1 integronların sık olduğunu ortaya çıkarmıştır.

Özet (Çeviri)

VI ABSTRACT ESER KÖSEO?LU, Ö., Identification of class 1 integrons and molecular analysis of extended spectrum beta-lactamases in gram negative bacilli isolated from patients hospitalized in intensive care units, Hacettepe University Health Sciences Institute PhD Thesis in Microbiology, Ankara, 2004. Integrons are genetic elements containing the determinants of a site-specific recombination system. The aim of this study is to identify integrons and extended spectrum beta-lactamases (ESBL) in clinical isolates of Enterobacteriaceae isolated from patients hospitalized in intensive care units of Hacettepe Hospital. For this purpose, antibiotic susceptibility, presence of integrons and molecular analysis of ESBLs were investigated in the 117 gram negative isolates, randomly selected from the isolates of patients hospitalized in the intensive care units of Hacettepe Hospital in 2000 and 2003. Of the isolates 69.9% were shown to be integron-positive with inserted gene cassettes of various sizes. Integron-positive isolates were statistically more likely to be resistant to gentamicin, quinolone and third generation cephalosporins than integron negative isolates. Screening and Confirmatory Tests for ESBL production were performed, according to the guidelines of the National Committee for Clinical Laboratory Standard' (NCCLS) From a total of 117 enterobacterial isolates, 41 (35.0%) were ESBL positive. All isolates were susceptible to imipenem. Beta- lactamases were characterized by polymerase chain reaction amplification using specific primers for Mcitem, blasHV and Muctx-m- Of 41 ESBL positive isolates, 20 were found to produce CTX-M type ESBL (%48.8) and all these isolates were also found to be positive for the presence of an integron, suggesting an association between integrons and ESBL carriage among Enterobacteriaceae, perhaps via a common plasmid. The results of this study reveal that class 1 integrons are prevalent among gram negative bacilli isolated from intensive care units of our hospital.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    861390

    Atatürk Üniversitesi Tıp Fakültesi araştırma hastanesi erişkin yoğun bakım ünitelerinde yatmakta olan hastaların kan kültürlerinden izole edilen gram negatif bakteriler ve antimikrobiyal direnç profilleri

    Gram-negative bacteria and antimicrobial resistance profiles isolated from blood cultures of patients hospitalized in adult intensive care units of Atatürk University Faculty of Medicine research hospital

    ŞEYMA DEMİRELLİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HALİL YAZGI

  2. Tez No

    563701

    Çeşitli klinik örneklerden izole edilen acınetobacter spp. suşlarında antibiyotik direnç, ESBL ve biyofilm özelliklerinin araştırılması

    Investigation of antibiotic resistance, ESBL, biofilm properties of acinetobacter spp. strains isolated from various clinical specimens

    AHMET DEMİRDELEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiSelçuk Üniversitesi

    Tıbbi Laboratuvar Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSTAFA ONUR ALADAĞ

  3. Tez No

    579692

    Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas spp. suşlarında antibiyotik direnç, ESBL ve biyofilm özelliklerinin araştırılması

    Investigation of antibiotic resistance, ESBL, biofilm properties of Pseudomonas spp. strains isolated from various clinical specimens

    OSMAN PEKGÜL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Sağlık EğitimiSelçuk Üniversitesi

    Tıbbi Laboratuvar Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSTAFA ONUR ALADAĞ

  4. Tez No

    632450

    Atatürk Üniversitesi Tıp Fakültesi Araştırma Hastanesinin yoğun bakım ünitelerinde yatmakta olan hastalarda gelişen hastane enfeksiyonları, etkenleri, antimikrobiyal duyarlılıkları ve mortalite üzerine etkileri

    Hospital-acquired infections, factors, antimicrobial sensitivity and impacts on mortality in patients admitted to intensive care units of Atatürk University, Faculty of Medicine, Research Hospital

    BİLGEN BORULU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAtatürk Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET PARLAK

  5. Tez No

    785217

    Çocuk ve yenidoğan yoğun bakım ünitelerinden izole edilen karbapenem dirençli klebsiella suşlarının moleküler epidemiyolojisi

    Molecular epidemiology of carbapenem resistant klebsiella species isolated from pediatric and neonatal intensive care units

    AYŞE HANDE TÜRK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DEVRAN GERÇEKER

Geri Dön