Geri Dön

Optimizations of RAPD-PZR for real-time PCR applications using melt analysis and high resolution melt analysis

Rapd-pzr yönteminin gerçek zamanlı PZR uygulamalarında kullanılabilmesi için erime analizi ve yüksek çözünürlüklü erime analizi ile optimizasyonlarının yapılması

  1. Tez No: 290265
  2. Yazar: ZEYNEP KATMER
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. İFFET İREM UZONUR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Fatih Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 115

Özet

RAPD-PZR,moleküler biyolojinin birçok alanında kullanılan, tam nicelikselolmayan, PZR temelli bir yöntemdir. Bu yöntemin polimorfizm tespiti, genotoksisitetespiti ve kanser çalışmalarında çok sayıda avantajları olmasına rağmen çalışmalarda buyöntemle elde edilen DNA verisinin değerlendirilmesi çok zorlu bir aşamadır.Bu tezde, RAPD yönteminin faydaları ile gerçek zamanlı PZR teknolojisininavantajları yeni bir RAPD açılımı olarak birleştirilmiştir. RAPD çalışmalarını gerçekzamanlı PZR'nin özellikle erime analizi ve yüksek çözünürlüklü erime analiziaçılımıları ile daha kullanılabilir duruma getirmek amaçlanmıştır. Optimizasyonçalışmaları sırasında yüksek çözünürlüklü floresans boya teknolojileri, hassas kit vecihazlarda farklı PZR koşullarında denenmiş ve optimum şartlar sonuç olarakverilmiştir.

Özet (Çeviri)

RAPD-PCR is a semi-quantitative, PCR based method used in various fields inmolecular biology. Although it has numerous advantages in polymorphism detection,genotoxicity and carcinogenesis studies, it is nearly impossible to work with RAPDbands directly to get more quantitative data. In this thesis, benefits of the conventionalRAPD assay are combined with real-time PCR?s technological advances. RAPDmethod is adapted to real-time PCR applications using melt analysis and high resolutionmelt analysis. The highly efficient fluorescence dye technologies, sensitive ready-to-usekits and instruments with different cycling conditions and parameter optimizations wereassessed for a novel real-time RAPD-PCR methodology.

Benzer Tezler

  1. RAPD-PZR analizinde, primer bağlanma derecesi ve dna konsantrasyon parametrelerinin optimizasyonu ile farklı canlı ve doku tiplerinde DNA değişiklerinin tespiti

    Annealing temperature and DNA concentration parameter optimizations in RAPD-PZR analysis to detect DNA variations in various organisms and tissue types

    SEMA ŞULEKOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    BiyolojiFatih Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. İ. İREM UZONUR

  2. Kekik (Thymus vulgaris L.) bitkisinin in vitro doku kültürü yöntemleriyle mikroçoğaltımı ve tek aşamalı dondurma yöntemleriyle kriyoprezervasyonu

    Micropropagation of thyme (Thymus vulgaris L.) and its cryopreservation by one-step freezing techniques

    ERGUN KAYA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    BiyoteknolojiGebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TAMER YAĞCI

  3. Olgun Antep fıstığı bitkisinin (Pistacia vera L. Atlı) mikroçoğaltımı, in vitro konzervasyonu ve kriyoprezervasyonu için biyoteknolojik yöntemlerin geliştirilmesi

    Development of biotechnological methods for micropropagation, in vitro conservation and cryopreservation of mature Pistachio (Pistacia vera L. Atli)

    HÜLYA AKDEMİR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiGebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YELDA ÖZDEN ÇİFTÇİ

  4. Single tree genetic linkage mapping of taxusbrevifolia nutt. Based on random applified polymorphic DNA (RAPD) markers using DNA from haploid megagametophytes

    Taxus Brevifolia' nın haploid megagametofit DNA' larını kullanarak rastgele üretilen polimorfik DNA (RAPD) belirleyiciler yardımıyla tek ağaçta yapılan genetik bağlantı haritası

    BELGİN GÖÇMEN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1994

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ZEKİ KAYA

  5. Koyunlardaki sarcocystis türlerinin RAPD-PCR fingerprinting ile teşhisi

    Diagnosis of ovine sarcocystis species by random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction (RAPD-PCR) fingerprinting

    OSMAN SELÇUK ALDEMİR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2001

    Veteriner HekimliğiSelçuk Üniversitesi

    Parazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BİLAL DİK