Theileria annulata'nın laktat dehidrogenaz enzimini kodlayan genin ilaç tasarım çalışmalarında kullanılmak üzere izolasyonu, klonlanması ve analizi
Isolation, cloning and analysis of the enyzme encoding lactate dehydrogenase gene from Theileria annulata for drug design studies
- Tez No: 295761
- Danışmanlar: DOÇ. DR. DİLEK TURGUT-BALIK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2010
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yıldız Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 86
Özet
Theileriosis keneler aracılığı ile bulaşan ciddi bir hayvan hastalığı olup Theileria cinsine ait zorunlu hücre içi parazit türleri aracılığı ile bulaşır. Theileria parazitine ait türlerinin enfeksiyonu hayvanlarda ürün kaybı ve yüksek ölüm oranı ile sonuçlanır. Şu anda var olan antitheilerial ilaçların kullanımda olmasına rağmen, önemli antitheilerial ilaçlardan birisine karşı direnç oluştuğu ilk defa bu yıl rapor edilmiştir.Bu çalışmada hayvanlarda daha geniş etkiye sahip olabilecek yeni bir antiparazitik ilaç tasarımı amacıyla laktat dehidrogenaz enziminin tropikal theileriosis etkeni olan Theileria annulata'dan izolasyonu, klonlanması ve analizinin yapılması hedeflenmiştir.Hedef gen dizisi ilk defa bir Theileria türünün genomik DNA'sından PCR aracılığı ile izole edilmiş ve pGEM-T easy vektör sistemine klonlanmıştır.Tüm gen dizisinin iki yönlü dizileme analizleri sonucunda Theileria annulata laktat dehidrogenaz enziminin 1588 baz çifti içerdiği ve açık okuma çerçevesinin iki intron ile bölündüğü görülmüştür. İntron dizilerinin restriksiyon haritalama analizi sonuçları değerlendirildiğinde bu bölgelerden soy tanısında yararlanılabileceği önerilmiştir.Açık okuma çerçevesi 322 amino asit kodlamaktadır. Bu dizi konaktaki eşdeğeri ile karşılaştırıldığında iki delesyon ve iki insersiyonun bulunduğu tespit edilmiştir. Aktif bölge halkasındaki beş rezidü insersiyonu en önemli insersiyondur. Bu tezde gerçekleştirilen modelleme çalışmaları ile ilgili bölgenin enzim inhibitörleri için cazip bir hedef olabileceği önerilmiştir.
Özet (Çeviri)
Theileriosis is a serious animal disease that transmitted by ticks. It is caused by obligate intracellular parasitic protozoa of the genus Theileria. Infection by Theileria spp. parasites results in production losses and high mortality in susceptible animals. Although currently available antiparasitic drugs are still in use to threat the disease, resistance to one of the important antitheilerial drug has been reported for the first time in this year. Isolation, cloning and analysis of lactate dehydrogenase from Theileria annulata, which causes tropical theileriosis, has been targetted in the present study with the ultimate aim of designing new antiparasitic drugs that will hopefully have wider mode of action in animals.The target sequence was isolated from the genomic DNA by PCR and cloned into the pGEM-T easy vector system from a Theileria species for the first time in the literature.Sequencing of the whole gene from both directions indicated that Theileria annulata lactate dehydrogenase gene contains 1588 base pairs and open reading frame was interrupted by two introns. Restriction mapping analysis of the intron sequences suggested that these regions could be exploited in the identification of the strains.The open reading frame encodes 322 amino acids. This sequence has two deletions and insertions compared to its equivalent in the host. Most remarkable is a five residue insertion in the active site loop region. Modelling studies performed in this thesis suggested this site beign an atractive target for inhibitors of the enzyme.
Benzer Tezler
- Theılerıa annulata'nın laktat dehidrogenaz enzimini kodlayan genin analizi
Analysis of gene from theileria annulata coding lactate dehydrogenase enzyme
BELMA NURAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLEK BALIK
- Theileria annulata laktat dehidrogenazının in vitro ve in silicoanalizler ile inhibisyonunun sağlanması
Evaluation of bacterial enzymes for drug design
SELCAN AKAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLEK BALIK
- Theileria annulata'nın TA15705 proteininin karakterizasyonu ve AP-1 aktivasyonundaki rolünün belirlenmesi
Characterisation of the TA15705 protein of Theileria annulata and determination of its role in AP-1 activation
AHMET HAKAN ÜNLÜ
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
Veteriner HekimliğiAdnan Menderes ÜniversitesiParazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN EREN
- Theileria annulata'nın enolaz enzimini kodlayan genin intronsuz olarak klonlanması, enzimin ifade edilmesi, saflaştırılması ve kinetik karakterizasyonu
Cloning of enolase gene without intron, expression, purification and kinetic characterization of the enzyme from Theileria annulata
EBRU ÇAYIR
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
BiyokimyaYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLEK BALIK
- Theileria annulata'nın kenelere aktarımını engelleyebilecek antijen adaylarının in vivo incelenmesi
In vivo examination of antigen candidates that may block the transfer of Theileria annulata to ticks
HAKAN KANLIOĞLU
Doktora
Türkçe
2024
Veteriner HekimliğiAydın Adnan Menderes ÜniversitesiParazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TÜLİN KARAGENÇ
DOÇ. DR. HÜSEYİN BİLGİN BİLGİÇ