Geri Dön

Investigation of tRNA-derived small RNAs in Drosophila melenogaster

Drosophila melanogaster' de tRNA kaynaklı küçük RNA'ların araştırılması

  1. Tez No: 299165
  2. Yazar: ÇAĞDAŞ GÖKTAŞ
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. BÜNYAMİN AKGÜL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 49

Özet

Gen ifadesinin düzenlenmesinde hayati oyuncular olarak düsünülenküçük RNA çesitleri giderek sayıca artmaktadır. Klonlama ve sekanslama strateji veteknolojilerindeki gelismeler, mikro RNA, endojen küçük susturucu RNA ve Piwietkilesimli RNA'lar gibi diger küçük RNA'lara benzer olarak hücre içinde yüksekoranda ifade edilen tRNA kaynaklı küçük RNA'ların tanımlanması ile sonuçlanmıstır.Stres ve degisen fizyolojik sartlara baglı olarak, tRF'lerin farklı tRNA lardanfarklı pozisyonlarda farklı sıklıkta orjinlendikleri deneysel olarak gösterilmistir. Bunaragmen fonksiyonları ve etkilestikleri kompleksler büyük oranda bilinmemektedir.Bu tez çalısmasında hedeflerden biri, Drosophila melanogaster' de embriyonikgelisim sırasında ifade edilen tRNA kaynaklı küçük RNA'ların in-vitro ve in-vivodeneylerle karakterize edilmesidir. Ayrıca bu çalısmada, embryonic tRF'ler ile stressartlarında üretilen tRNA kaynaklı küçük RNA'lar arasındaki farklılıgın ortaya konmasıhedeflenmistir. Son olarak, tRF'lerin biyogenezlerine, mekanizmalarına vefonksiyonlarına iliskin ipuçlarının elde edilmesi amaçlanmıstır.Sonuç olarak 1 ve 8 saatlik embryolarda ifade edilen tRNA kaynaklı küçükRNA'ların stres kosullarında üretilen küçük RNA'lardan pozisyon ve uzunlukbakımından farklı oldukları ortaya çıkarılmıstır. Diger önemli sonuç ise tRNA kaynaklıküçük RNA'ların olusturdukları komplekslerin translasyonun mRNP ve 60Sfraksiyonlarında yogunlastıkları ve Drosophila embriyonik gelisiminde geçici ve seçiciolarak ifade edildikleridir.

Özet (Çeviri)

Types of small RNAs considered as crucial players of regulation of geneexpression increase gradually in number. Improvements in cloning and sequencingstrategies and technologies resulted in identification of tRNA derived small RNAswhich are highly expressed in the cell just like other small RNAs such as microRNAs,endo-siRNA, and Piwi interacting RNAs.Depending on stress and changing physiological conditions, tRFs are originatedfrom different positions, in different frequency and different tRNAs. However, theirfunctions and the complexes they interact with remain largely unknown.In this thesis study, one of the aims is to characterize tRNA derived small RNAsexpressed during embryonic development in Drosophila melanogaster by in-vitro andin-vivo experiments. This study also aimed to demonstrate the differences betweenembryonic tRFs and stress induced tRNA derived small RNAs. Lastly, it was aimed toobtain some clues about their biogenesis, mechanism and functions.It was shown that the tRFs expressed in 1-hour and 8-h Drosophila embryos aredifferent from stress induced tRNA derived small RNAs in terms of both position andlength. The other important result is that embryonic tRFs are associated with complexesin mRNP and 60S fractions and they are expressed temporally and selectively duringDrosophila embryogenesis.

Benzer Tezler

  1. Investigation of antimicrobial resistance in wild-type and stress-resistant Saccharomyces cerevisiae strains

    Yaban-tip ve strese dirençli Saccharomyces cerevisiae suşlarında antimikrobiyal dirençliliğinin incelenmesi

    RIZIQ NAHIDH ISMAEEL ALSAMAWI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR

  2. Phylogeography of the Savi's pipistrelle (Vespertilionidae, chiroptera) complex based on whole mitochondrial genome analysis

    Savi'nin cüce yarasası kompleksinin (Vespetilionidae, chiroptera) filocoğrafyasının tüm mitokondriyal genom ile analizi

    YELİZ ERGÖL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    İklim ve Deniz Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ EMRAH ÇORAMAN

  3. Bazı apocrita (Hymenoptera:Insecta) familyalarında mitokondri genomunun araştırılması

    Investigation of the mitochondrial genomes in some apocritan (Hymenoptera:Insecta) families

    BURCU TEMEL ALTUN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    BiyolojiCumhuriyet Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HASAN HÜSEYİN BAŞIBÜYÜK

  4. Aktin modelinde protein-ligand etkileşimlerinin yeni yaklaşımlar çerçevesinde incelenmesi

    Investigation of protein-ligand interactions using new approaches on actin model

    KEMAL ALPER ÖNSÜ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Biyofizikİstanbul Üniversitesi

    Biyofizik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUHAMMET BEKTAŞ

  5. DNA metiltransferaz-2 (DNMT2) geninin deri yaşlanmasındaki rolünün araştırılması

    Investigation of the role of the DNA methyl transferase-2 (DNMT2) gene in skin aging

    BEYZA NUR ONAT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    DermatolojiErciyes Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERPİL TAHERİ