Regulation of human P53 tumor suppressor gene activity by thiol-dependent oxidoreductases
İnsan P53 tümör baskılama geninin tiyol bağımlı oksidoredüktazlar ile regülasyonu
- Tez No: 299176
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AHMET KOÇ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biyoloji, Genetik, Biochemistry, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2011
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 44
Özet
İnsan tümörlerinin yarısından çoğunda p53 mutasyonlarının görülmesi bu proteinin kanseri önlemede önemli bir rolünün olduğunu göstermektedir. Bununla birlikte, sistein aminoasitlerine bağlı ?SH gruplarının oksidatif koşullar altında p53 proteinini inaktif hale getirebildiği bilinmektedir. p53'ün önemli bir tümör süpresör olması ve p53 proteininin redoks regülasyonu konusundaki çalışmaların yetersizliği bizi p53 proteininin redoks regülasyonunu çalışmaya yönlendirdi. Bu çalışmada maya (Saccharomyces cerevisiae) in vivo model olarak kullanılmıştır. Mayadaki bütün tiyol-bağımlı oksidoredüktazlar, yapılarındaki spesifik karakterlerin REDOXCysSearch biyoinformatik aracıyla taranmasıyla tespit edilmiştir. İnsana ait p53 geninin mayahücrelerinde çalışılabilmesi için, p53 geni ve p53 geni ile uyarılan p53 RE Lac-Z raportör sistemi mayalara transforme edilmiştir. Antioksidan gen mutantları da LacZ raportör gen aktivitesi yönünden incelenmiştir. Yabani tip mayaya göre daha düşük p53 aktivitesi gösteren bazı maya mutantları tespit edilmiştir. Hücre döngüsü regülasyonu ve oksidatif stress tolerans mekanizmalasının mayada ve memelilerde korunmuş olması nedeniyle, maya çalışmalarındaki sonuçların memeli hücrelerindeki p53'ün redoks regülasyonunu aydınlatmada yardımcı olacağı düşünülmektedir. Bu sayede, p53'ünredoks regülasyonu konusunda yeni bir görüş ortaya çıkabilecektir.
Özet (Çeviri)
Background: Occurrence of p53 mutations in more than half of human tumors indicates the importance of p53 gene in cancer prevention. Nevertheless, oxidation of cysteine ?SH groups in p53 protein can inactivate the protein under oxidative conditions. The importance of p53 as a tumor suppressor and insufficient studies about redox regulation of p53 gene lead us to study redox regulation of p53 protein. Methods: In this study, yeast (Saccharomyces cerevisiae) was used as an in vivo model. All potential thiol-dependent antioxidant genes in yeast were identified based on specific characters in their structure, via REDOXCysSearch bioinformatics tool. To study human p53 gene activity in yeast cells, p53 gene and p53 RE Lac-Z reporter that is inducible by p53, were transformed into yeast. Antioxidant gene mutants were analyzed for LacZ reporter gene activity. Results: We identified several yeast mutants (?sac1, ?hnt3 and ?map1) with lower p53 activity with respect to wild-type yeast. Conclusion: Due to conserved mechanisms of cell cycle regulation and oxidative stress tolerance between yeast and mammals, we believe that results from yeast studies may help us to understand the redox regulation of p53 in human cells. Thus, a new perspective may appear in the redox regulation of p53 gene.
Benzer Tezler
- Redox regulation of human p53 tumor suppressor gene activity: identification of redox genes that play role in human p53 reporter gene activity
İnsan p53 tümör baskılayıcı gen aktivitesinin redox regülasyonu: insan p53 raportör gen aktivitesinde rol oynayan redoks genlerinin belirlenmesi
BEREN ATAÇ
Yüksek Lisans
İngilizce
2008
Biyokimyaİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AHMET KOÇ
- Investigating the effect of human SACM1L gene in the p53 wild type breast epithelial MCF10A and breast cancer MCF7 cells
P53 vahşi tip meme epitelyal MCF10A ve meme kanseri MCF7 hücrelerinde insan SACM1L geninin etkisinin araştırılması
EDA EFE
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
Moleküler Tıpİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZDEN YALÇIN ÖZUYSAL
- İnsan P53 tümör süpresör proteini ile insan aprataksin, SACM1L ve METAP1 proteinleri arasındaki protein-protein etkileşimlerinin ortaya çıkartılması
Elucidation of protein-protein interactions between human P53 tumor suppressor and the human aprataxin, SACM1L and METAP1 proteins
KÜBRA DURMUŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Genetikİnönü ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET KOÇ
- Akciğer kanseri patogenezinde Sirtuin'in rolü
The role of the Sirtuin in the pathogenesis of Lung Cancer
İLKE ULU
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
GenetikZonguldak Bülent Ecevit ÜniversitesiMoleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEVİM KARAKAŞ ÇELİK