Çok çekirdekli işlemciler için moleküler dinamik simülasyonu
Parallel edmd simulation for multi-core architecture
- Tez No: 300305
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. FATİH ERDOĞAN SEVİLGEN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Computer Engineering and Computer Science and Control
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 60
Özet
Olay Temelli Moleküler Dinamik simülasyonunun paralelleştirilmesi problemi son yıllarda gelişen çok çekirdekli işlemcilerin sağladığı avantajları kullanma adına önemli bir problem haline gelmiştir. Önerilen çok az sayıdaki algoritmanın yetersiz kaldığı görülmüş ve bu konudaki eksiğin giderilmesi adına asenkronize, kilit mekanizmalarından mümkün olduğu kadar arındırılmış yeni bir algoritma tasarlanmıştır.Tasarlanan algoritma, yönetici-işçi (Master-Worker) modeli ile üretici-tüketici (Producer-Consumer) modelinden yola çıkılarak asenkronize ve kilitsiz (lock-free) veri yapıları yardımıyla gerçeklenmiştir. Yapılan çalışmalar neticesinde deneylerde şuana kadar literatürdeki en iyi performans elde edilmiş, gelecek çalışmalar adına umut verici sonuçlar ortaya çıkmıştır.
Özet (Çeviri)
In recent years, in the behalf of using the advantages of the improved multi-core processors collimate the Event-Based Molecular Dynamics simulation problem has become an important problem.A few algorithms have been proposed. The algorithms are examined and it shown that all algorithms are insufficient in many cases. Therefore a new asynchronies lock-free parallel algorithm is proposed and the simulation performance has been improved as much as possible.The designed algorithm is implemented on the basis of Master-Worker model and Producer-Consumer model with the aid of asynchronous and lock-free data structures. As a result of the studies, the best performance of the literature is obtained in the experiments and the obtained results are promising for the future studies.
Benzer Tezler
- Rupture status investigation of patient specific cerebral aneurysms by analysing hemodynamic factors using computational fluid dynamics
Hesaplamalı akışkanlar dinamiği kullanarak hemodinamik faktörlerin analizi ile hastaya özgü beyin anevrizmalarının yırtılma durumu incelemesi
GÜLBAHAR MERVE NARİNSES
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik ÜniversitesiHesaplamalı Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA SERDAR ÇELEBİ
- Hypergraph models for parallel sparse matrix-matrix multiplication
Paralel seyrek matris-matris çarpımı için hiperçizge modelleri
KADİR AKBUDAK
Doktora
İngilizce
2015
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiBilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CEVDET AYKANAT
- Zeytin çekirdek atıklarının aktif karbona dönüşümü amaçlı sistem tasarımı
System design for the conversion of olive seed wastes into activated carbon
DERYA AKBULUT
Doktora
Türkçe
2024
Metalurji MühendisliğiSakarya ÜniversitesiMetalurji ve Malzeme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ OSMAN KURT
PROF. DR. DİLEK ANGIN
- Targeting and activation of antigen specific CD8+ T cells with peptide-major histocompatibility complex I tetramers
Peptit-majör histokompatibilite kompleks I tetramerleri ile antijen spesifik CD8+ T hücrelerin hedeflenmesi ve aktivasyonu
ŞAFAK CEREN USLU ŞIVGIN
Doktora
İngilizce
2025
BiyoteknolojiHacettepe ÜniversitesiTemel Onkoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HANDE CANPINAR
- Bazı çok çekirdekli metal komplekslerinin x-ışınları kristal yapı analizleri
Crystal structure analysis of some polynuclear metal complexes by x-ray diffraction method
BÜRKE MELTEM ATEŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2003
Fizik ve Fizik MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiFizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FİLİZ ERCAN