Gökçeada keçilerinin mikrosatellit belirteçler yardımıyla genetik yapılarının incelenmesi
Genetic research on the Gökceada goat breed using microsatellite markers
- Tez No: 302717
- Danışmanlar: DOÇ. DR. HARUN CERİT
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Marker, goat, locus, microsatellite, PCR, Gökçeada goat
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Zootekni (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 65
Özet
Gökçeada keçileri Türkiye'de Çanakkale ilinde sınırlı bir alanda yetişen bir keçi populasyonudur. Doğal seleksiyon yoluyla varlığını sürdürmüş olan bu keçi ırkı üzerinde bir genetik çalışma yapılmıştır. OARCP34, ILSTS008, BM4621, ILSTS005, ILSTS011 ve BM1818 mikrosatellit lokusları çalışma için belirlenerek analizler bu lokuslar üzerinden yapılmıştır. Bu çalışmada Gökçeada'da yaşayan keçilerden toplamda 55 hayvan olmak üzere kan örnekleri toplanmış, Chelex ve Fenol- Kloroform İzoamil alkol yöntemleri ile DNA ekstraksiyonu ve izolasyonu yapılmıştır. Genomik DNA %2'lik agaroz jel elektroforezi ile UV kaynağı altında görüntülenmesi ardından DNA'ların saflıkları spektrofotometre ile belirlenmiştir. Polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) çalışması için fenol kloroform izoamilalkol yöntemi ile elde edilen DNA'ların kullanımı tercih edilmiştir. Mikrosatellit lokusların allel dağılımları %4'lük poliakrilamid jel üzerinde gümüş boyama yöntemi ile görünürleştirilmiştir. Üzerinde çalışılan lokusların allel frekansları, gözlenen ve beklenen heterozigotluk değerleri ve Hardy-Weinberg dengesine uyumları tespit edilmiştir. Bunların yanı sıra bu mikrosatellit lokuslar için uyum olasılığı, ayrımlama gücü, dışlama gücü, polimorfik bilgi içeriği, kombine ayrımlama gücü, kombine dışlama gücü değerleri de hesaplanmıştır. Araştırma sonunda ILSTS008 ve BM4621 lokusları haricinde Hardy-Weinberg dengesine uyumsuzluk gözlenmemiştir. 6 lokus için elde edilen kombine ayrımlama gücü 0,9999 ve kombine dışlama gücü 0,9862 ve polimorfik bilgi içeriği ortalaması da 0,7985 olarak hesaplanmıştır. Elde edilen veriler doğrultusunda OARCP34, ILSTS011 ve BM1818 mikrosatellit lokuslarının daha ileriki çalışmalarda kullanılmasının uygun olduğu söylenebilir.Anahtar Kelimeler : Belirteç, keçi, lokus, mikrosatellit, PZR, Gökçeada Keçisi
Özet (Çeviri)
Gökçeada goats are a local goat population which lives in a confined space in Çanakkale province of Turkey. This study was carried on Gökçeada goat population which existed through natural selection. OARCP34, ILSTS008, BM4621, ILSTS005, ILSTS011 and BM1818 are the microsatellite markers attended and all the analyses carried on these loci. In this study there were 55 Gökçeada goats used for collecting blood samples. Chelex and Fenol-Chloroform Isoamylalcohol methods were used to exctract and to isolate the DNA. Genomic DNA was visualised by gel electrophoresis under UV source and DNA purification was tested by spectrophotometer. DNA extraction by the phenol choloroform isoamylalcohol method was chosen to use in polymerase chain reaction (PCR). The allelic distribution of microsatellite markers were visualised by silver staining method on 4% polyacrylamide gel. Allelic frequencies, observed and expected heterozygosity values and Hardy-Weinberg equilibrium compliance was tested on the loci were studied. Also matching probability, power of discrimination, power of exclusion, polymorphic information content, combined power of exclusion and combined power of discrimination values were calculated. The results showed that there were no other loci than ILSTS008 and BM4621 not matching with Hardy-Weinberg equilibrium. The combined power of exclusion value calculated for all the loci was 0,9999 and the combined power of discrimination value was 0,9862 and the average polymorphic information content value was 0,7985. By the guidance of the data gained with this study the microsatellite loci of OARCP34, ILSTS011 and BM1818 can be considered to use in the further studies.
Benzer Tezler
- Gökçeada ve Çanakkale civarında yaşayan Ophisops elegans Mènètriès 1832 (Sauria: Lacertidae) populasyonlarında yaş tayini
Age estimation of the populations of Ophisops elegans Mènèttriès 1832 (Sauria: Lacertidae) in the vicinity of Çanakkale and Gökçeada
SULTAN PARLAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
BiyolojiÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiZooloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. C. VAROL TOK
- Surveillance of prion protein (PrP) gene polymorphisms in Turkish native sheep breeds
Türkiye yerli koyun ırklarında prion protein (PrP) geni polimorfizmlerinin taranması
BEGÜM UZUN
Yüksek Lisans
İngilizce
2012
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İNCİ TOGAN
- Farklı keçi genotiplerinde davranış, sağlık ve performans özellikleri üzerine araştırmalar
Studies on behaviour, health and performance traits of different goat genotypes
CEMİL TÖLÜ
Doktora
Türkçe
2009
ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TÜRKER SAVAŞ
- Türkiye'deki Cittaslow kentleri yerel yönetimlerinin destinasyon pazarlaması uygulamaları: Vize ilçesi örneği
Destination marketing applications of Cittaslow local governments in Turkey: Sample of Vi̇ze county
AYKUT PAJO
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
TurizmKırklareli Üniversitesiİşletme Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. KAPLAN UĞURLU
- Gökçeada'nın neritik bölgesindeki Mnemiopsis leidyi (Agassiz, 1865)'nın bolluğu ve dağılımı
Abundance and distribution of Mnemiopsis leidyi (Agassiz,1865) in the neritic region of Gökçeada (northern Aegean sea)
MELEK İŞİNİBİLİR
Yüksek Lisans
Türkçe
1999
Su Ürünleriİstanbul ÜniversitesiSu Ürünleri Temel Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AHMET NURİ TARKAN