Geri Dön

Classification of clinically different subtypes of multiple sclerosis

Multipl skleroz hastalığının farklı klinik alttiplerinin sınıflandırılması

PDF İndir

  1. Tez No: 307075
  2. Yazar: DİDEM KORKMAZ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. EDA TAHIR TURANLI, YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA KAMAŞAK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Biyoloji, Nöroloji, Computer Engineering and Computer Science and Control, Biology, Neurology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İstanbul Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 97

Özet

Multipl Skleroz farklı klinik özelliklere sahip farklı altgrupları olan, merkezi sinir sisteminin bağışıklık sistemi merkezli bir hastalığıdır. Günümüzde MS teşhisi koymak için gözden geçirilmiş McDonalds Kriterleri yaygın bir biçimde kullanılmaktadır. Ancak MS diğer sinir sistemi hastalıklarıyla karıştırılabilmektedir. Ayrıca, hastalığın prognozunu tayin etmekte kullanılan geçerli bir kriter listesi yoktur.Bu çalışma TAU, GFAP, NFL ve MOG proteinlerini ve klinik verileri kullanarak MS'in farklı klinik alttiplerinin sınıflandırılmasına odaklanmaktadır. Bu çalışmada yapılması amaçlananlar aşağıdaki şekilde özetlenebilir:?MS örnekleri, CIS örnekleri ve kontrol grubu arasında farklı aday proteinlerin ve klinik veri örüntülerinin araştırılması,?MS'in farklı klinik alttiplerinin protein verileri kullanılarak sınıflandırılabileceğinin gösterilmesi,?CIS'dan kesin MS'e geçişin (prognoz) tahmin edilmesi. Bu çalışma, bu tahminle MS'in prognozunun protein verileri ve klinik veriler kullanılarak tahmin edilebileceğini göstermeyi amaçlamaktadır.Bu çalışmada 67 RRMS, 46 CIS, 22 PPMS ve 22 kontrol (MS olmayan) örneğinin protein ve klinik verileri incelenmiştir. Bu çalışma için kullanılan protein verileri, hastaların BOS örneklerinden elde edilmiştir. Hastaların BOS örnekleri bir ataktan sonraki 3 gün içinde lomber ponksiyon (LP) yöntemiyle elde edilmiştir. LP ilaç kullanımından önce gerçekleştirilmiştir. Örneklerin TAU, GFAP, NFL, MOG ve MBP protein konsantrasyonları Western Blot yöntemiyle tayin edilmiştir. Protein bantları densitometre kullanılarak taranmıştır ve taranan protein bantları, niceliksel bir ölçüm elde edilebilmesi için ImageJ programı ile analiz edilmiştir. Protein miktarları kolorimetrik birim (CU) olarak elde edilmiştir. CU protein bant konsantrasyonunun yoğunluğunu gösteren ve 0 ile 255 arasında değer alan bir sayısal değerdir. Analiz edilmiş değerler yüklenen toplam protein konsantrasyonuna göre doğrusallaştırılmış ve normalize edilmiştir. Tüm proteinler aynı prosedür kullanılarak taranmış ve analiz edilmiştir. ANOVA gibi klasik istatistiksel analizler sonucunda TAU, GFAP, NFL ve MOG protein seviyelerinin farklı alttipler ve kontrol örnekleri arasında anlamlı bir farklılık gösterdiği bulunmuştur (p

Özet (Çeviri)

Multiple sclerosis(MS) is an immune-mediated disease of the central nervous system (CNS) with heterogeneous clinical presentation and course. Today, revised McDonald?s criteria is the gold standard for MS diagnosis. MS can be confused with other neurological diseases. Moreover, there is no absolute criteria for the prediction of prognosis of the disease.This study focuses on the classification of different clinical subtypes of MS using TAU,GFAP,NFL and MOG proteins and clinical data. The aim of this study are summarized as follows:?To investigate different candidate protein and clinical data patterns among the MS subtypes, CIS samples and control samples.?To show that clinical subtypes of MS can be classified using protein data and clinical data.?To predict the transition between CIS and MS. This study aims to show that the prognosis of MS can be predicted using protein and clinical data.Protein findings and clinical data of 67 Relapsing Remitting MS (RRMS), 46 Clinically Isolated Syndrome (CIS), 22 Primary Progressive MS (PPMS) patients and 22 control subjects were analyzed in this study. CSFs of patients were collected by lumbar puncture (LP) within 3 days of an acute attack. LP was performed before the medication. TAU,GFAP,NFL, MOG and MBP protein concentrations of samples were determined by Western Blot analysis. Protein bands were scanned by using densitometer and scanned protein bands were analyzed by using ImageJ analysis software to obtain quantitative measurement [1]. Quantities of proteins were taken as colorimetric unit (CU). CU is a numerical value showing the insensitivity of protein band concentration, ranged between 0 (most) and 255 (least). Analyzed values were linearized and normalized due to loaded total protein concentration. All samples were scanned and analyzed with the same standard procedure. After classical statistical analysis such as ANOVA, TAU,GFAP, NFL and MOG protein results found to be significantly different among subtypes and control samples (p

Benzer Tezler

  1. Tez No

    876081

    Multi-omics data integration in the prediction of potential biomarkers and therapeutics in human cancers

    Kanserlerde potansiyel biyobelirteç ve terapötiklerin tahmininde çoklu omik verilerin entegrasyonu

    GİZEM GÜLFİDAN YILDIZ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyomühendislikMarmara Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KAZIM YALÇIN ARGA

    DOÇ. DR. BESTE TURANLI

  2. Tez No

    683912

    Developing a label propagation approach for cancer subtype identification problem

    Kanser alt tipi tanımlama problemi için bir etiket yayma yaklaşımı geliştirme

    PINAR GÜNER

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolAbdullah Gül Üniversitesi

    Elektrik ve Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ BURCU GÜNGÖR

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSTAFA COŞKUN

  3. Tez No

    417137

    Metaplastik meme karsinomlarında kök hücre belirteçleri (ALDH1, CD44, CD24) ve hücreler arası sıkı bağlantı proteinlerinin (CllAUDİN 3, claudin 4 ve claudin 7) ekspresyonlarının tanı, prognoz ve moleküler alt tipler ile ilişkisi

    Correlations between expressions of stem cell markers (aldh1, CD44, CD24), tight junction proteins (claudin 3, claudin 4, claudin 7) and diagnosis, prognosis and molaculary subtypes of metaplastic carcinomas

    ONUR GÖNÜLLÜ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Patolojiİstanbul Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜSEYİN RIDVAN İLHAN

  4. Tez No

    267696

    Folliküler lenfomada tümör hücresi ve mikroçevre ilişkisinin immünfenotipik değerlendirilmesi

    Evaluation immunophenotypically of relations between tumor cells and their microenvironment in follicular lymphoma

    NURTEN BAŞEL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    OnkolojiÇukurova Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BERKSOY ŞAHİN

  5. Tez No

    567424

    Akut lösemi hastalarında 'Zinc Finger Protein 384' (ZNF384) geni füzyonlarının tespiti

    Determination of 384 Zinc Finger Protein (ZNF384) gene fusions in acute leukemia patients

    TUĞÇE SUDUTAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MÜGE SAYİTOĞLU

    DR. YÜCEL ERBİLGİN

Geri Dön