Bazı portakal çeşitlerinde genetik farklılıkların sscp markırları ile belirlenmesi
Identification of genetic variability in some sweet orange genotypes by using sscp markers
- Tez No: 307781
- Danışmanlar: DOÇ. DR. YILDIZ AKA KAÇAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bölümü
- Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 95
Özet
Bazı portakal çeşitlerinde genetik farklılıkların belirlenmesi amacıyla yapılan bu tez çalışmasında SSCP analizleri gerçekleştirilmiştir. Çalışmada Ç.Ü. Tuzcu turunçgil koleksiyonundan seçilen bazı portakal çeşitleri ile diğer turunçgil gruplarınıtemsil eden Satsuma mandarin (Citrus unshiu), şadok (Citrus maxima c.v reinking) ve Marsh seedless altıntop (Citrus paradisi) genotipleri kullanılmıştır. SSCP analizlerini gerçekleştirmek amacıyla 19 çift SSCP primeri ve DNA materyalleri kullanılarak PCR reaksiyonları gerçekleştirilmiştir. PCR ürünleri Origins electrophoreses (Elchrom Scientific USA) cihazı kullanılarak, hazır olarak temin ettiğimiz GMA (Genetic Mutation Analysis) jelinde koşturulmuştur. Elde edilen DNA bant profillerinin cluster analizleri DARWİN 5.0.158 (Dissimilarity Analysis and Representation for Windows) bilgisayar paket programı ile Neighbor-Joining metoduna göre yapılarak dendrogramlar oluşturulmuştur. Yapılan PCR reaksiyonularısonucunda sadece 14 SSCP primerin amplifikasyonu sağlanmıştır. Dendrogramsonuçları incelendiğinde; portakallar ile diğer turunçgil gruplarını temsil eden çeşitler arasında yüksek oranda polimorfizm gözlenirken, portakalların kendi içerisindeki polimorfizm oranı düşük çıkmıştır. Ayrıca, portakal çeşitleri içerisinde Sanguinello B 2/10 16-7 ve Kozan yerlisi 17-10 genotipleri 0.1 benzerlik düzeyi oranıyla birbirine çok yakın çıkarken, tüm portakal çeşitleri ile en farklı çeşitliliği göstermişlerdir.
Özet (Çeviri)
SSCP (Single Strand Confirmation) analyses were performed in order to determind genetic relationship among 40 sweet orange genotypes and 3 other Citrus cultivars (Satsuma (Citrus unshiu), Pummelo (Citrus maxima reiking) and Marsh seedless (Citrus paradise)) selected from Ç.U, Tuzcu Citrus Collection. Totally 19 SSCP primer pairs and DNA of plant materials were used for PCR amplification. Fourteen SSCP primers successfully amplified in PCR reactions. PCR products were seperated using GMA (Genetic Mutation Analysis) gels. Data obtained from the gel results were scored as 1 presence of DNA bands, as 0 absence of DNA bands. cluster analysis were performed by using DARWİN 5.0.158 (Dissimilarity Analysis and Representation for Windows) program. Dendrogram was constructed based on Neighbor-Joining method. According to the dendrogram high genetic polymorphism was detected between sweet orange and the other cultures used in this thesis. On the other hand low polymorphism level was detected among sweet orange genotypes.However Sanguinello B 2/10 16-7 and Kozan yerlisi 17-10 genotypes seperated from the other sweet orange genotypes in the dendrogram
Benzer Tezler
- Önemli zeytin (Olea europaea L.) çeşitlerinin izoenzim polimorfizmleri ve genetik özellikleri
Isoenzyme polymorphisms and genetic characteristics of important olive (Olea europaea L.) cultivars and types
SEVDA DÜLGER
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MURAT ŞEKER
- Bazı portakal çeşitlerinin Antalya ekolojik koşullarında morfolojik ve pomolojik karakterizasyonu
Morphological and pomological characterization of some orange varieties in Antalya ecological condition
GÜLAY DEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
ZiraatSüleyman Demirel ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA KOYUNCU
- Bazı portakal (Citrus sinensis L.) çeşitlerinin kalitesi üzerine farklı hasat sonrası uygulamaların etkisi.
Effects of different post harvest treatments on quality of certain orange (Citrus sinensis L.) cultivars
ESMA HATİCE ERÇİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
ZiraatBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ İHSAN CANAN
- Yerli portakal çeşitlerinin meyve suyu teknolojisi bakımından önemli bazı özelliklerinin belirlenmesi
Determination of some important properties in terms of fruit juice technology of native oranges
HÜSEYİN DURAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
Gıda MühendisliğiSakarya ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. OSMAN KOLA
- Turunçgil anaç ve çeşitlerinin turunçgillerde zamklanma hastalığına (Phytophthora citrophthora) karşı reaksiyonlarının ve bazı fungisitlerin infeksiyon oluşumu üzerine etkilerinin belirlenmesi
Reactions of some citrus rootstock and varieties to citrus gummosis (Phytophthora citrophthora) and effects of some fungicides on infection
BİRGÜL DERYAOĞLU