Geri Dön

Candida parapsilosis grubu türlerinin virulans özelliklerinin araştırılması

Investigation of virulance properties of C parapsilosis complex isolates

PDF İndir

  1. Tez No: 308254
  2. Yazar: ZEYNEP AKYÜZ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. İLKNUR TOSUN
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: C. parapsilosis grubu, SADH geni, virulans faktörler, C. parapsilosis complex, SADH gene, virulance factors
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 89

Özet

Candida parapsilosis grubu genellikle invaziv işlemler ve prostetik aletlerle ilişkilendirilen enfeksiyonlara neden olan önemli bir maya türü olarak karşımıza çıkmaktadır.Bu çalışmada C. parapsilosis grubu türlerinin dağılımını belirlemek ve bu mayanın patogenezinde rolü olan esteraz üretimi, TPN'de üreme yeteneği, biyofilm üretimi ve SAPP genlerinin varlığının araştırılması amaçlanmıştır.Bu çalışmaya KTÜ Tıp Fakültesi Farabi Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji AbD Hasta Hizmetleri Laboratuvarına gönderilen farklı klinik ve poliklinik hastası örneklerinden elde edilen 42 C. parapsilosis izolatı dahil edilmiştir. İzolatların tür düzeyinde tanımlanması çimlenme borusu oluşturmamaları, cornmeal-Tween 80 agarda mikroskopik inceleme, CHROMagarda gösterdikleri koloni rengi ve API 20C AUXmaya identifikasyon sistemi ile sağlanmıştır. C. parapsilosis grubu izolatlarının ayırımı PCR-RFLP yöntemi ile yapılmıştır. Esteraz üretimi Tween 80 opasite testi ile, TPN solüsyonunda üreme yetenekleri KTÜ Farabi Hastanesi'nden sağlanan TPN solüsyonları kullanılarak değerlendirilmiştir. Biyofilm üretimi, tetrazolium tuzunun indirgenmesi esasına dayanan 96 kuyucuklu mikrotiter pleyt yöntemi ile tespit edilmiştir. Türlerin SAPP gen profilleri SAPP1, SAPP2, SAPP3 primerleri kulanılarak PCR yöntemi ile belirlenmiştir.Çalışmamız sonucunda izolatların 38'i (%90.5) C. parapsilosis sensu stricto, 3'ü (%7.1) C. metapsilosis, 1'i (%2.4) C. orthopsilosis olarak belirlenmiştir. C. parapsilosis sensu stricto izolatlarının %78.9'u, C. metapsilosis ve C. orthopsilosisizolatlarının hepsi pozitif esteraz aktivitesi göstermiştir. C. parapsilosis sensu stricto izolatları TPN solüsyonlarında genellikle üreme artışı gösterirken, C. metapsilosis ve C. orthopsilosis izolatları belirgin bir üreme artışı göstermemiştir. C. parapsilosis sensu stricto izolatlarında %28.9 oranında biyofilm üretimi belirlenmiştir. C. metapsilosis ve C. orthopsilosis izolatlarında biyofilm üretimi negatif olarak tespit edilmiştir. C. parapsilosis sensu stricto ve C. orthopsilosis izolatlarında tüm SAPP genleri tespit edilmiş, C. metapsilosis izolatlarının üçünde ise SAPP3 geni pozitif iken SAPP1 ve SAPP2 genleri belirlenmemiştir.Sonuç olarak, C. parapsilosis grubu türlerinin dağılımının diğer çalışma verileri ile uyumlu olduğu saptanmıştır . Çalışmamızda bulunan yeni türlerin sayıları az olduğundan türlerin virulans özellikleri arasındaki farklılıklar istatistiki düzeyde belirlenmemiştir. Bunun için daha fazla izolatla yapılacak ek çalışmalara gereksinim vardır. Ek olarak C. metapsilosis izolatlarında SAPP1 ve SAPP2'nin belirlenmemesi nedeniyle bu genlerin sekans analizi yapılmalıdır.

Özet (Çeviri)

Candida parapsilosis complex have emerged as an important yeast species causing infections which usually occur in association with invasive procedures or prosthetic devices.The aim of this study was to determine distribution of C. parapsilosis complex isolates and analyse presence of esterase production, the capability of growth in total parenteral nutrition (TPN) solution, biofilm production and SAPP gene exspression that is involved in its pathogenesis.In this study, a total of 42 C. parapsilosis complex isolates were included that isolated from various samples of inpatients and outpatients which were sent to the Laboratory of Clinical Microbiology in Karadeniz Technical University, Faculty of Medicine. Isolates were identifiedto species level by non production of germ tube, microscopic evaluation on cornmeal-Tween 80 agar, determination of colour of colonies on CHROMagar and API 20C AUX identification kits. Seperation of C. parapsilosis complex was performed by PCR-RFLP. Esterase activity of the C. parapsilosis complex strains were determined by using Tween-80 opacity test. The capability of growth in TPN solution was assessed. Biofilm production was determined by using 96 well plate-based method that is based on reduction of a tetrazolium salt. SAPP gene profile of the isolates were determined by using PCR with primers of SAPP1, SAPP2 and SAPP3.Of the total 42 C. parapsilosis complex isolates, 38 (%90.5) were identified as C. parapsilosis sensu stricto, 3 (%7.1) C. metapsilosis and 1 (%2.4) C. orthopsilosis, respectively. %78.9 of C. parapsilosis sensu stricto and all of the C. metapsilosis and C. orthopsilosis isolates (%100) yielded with positive esteraz activity. While C. parapsilosis sensu stricto isolates generally showed increased growth, C. metapsilosis and C. orthopsilosis isolates did not show as markedly growth in TPN solution. Of C. parapsilosis sensu stricto isolates, %28.9 produced biofilm. C. orthopsilosis and C. metapsilosis isolates did not produce biofilm. C. parapsilosis sensu stricto and C .orthopsilosis were positive for all of SAPP genes. Among to the C. metapsilosis isolates, all of them hadSAPP3, but presence of SAPP1 and SAPP2 genes were not determined.In conclusion, it was found that the distribution of C. parapsilosis complex species was in paralel with other studies. Difference among virulance factors of the species can notbe determined at statistically significant level because of small number of the newly described isolates. For this reason, additional study is required which much isolates will be used. Additionally, because of SAPP1 and SAPP2 genes were not determined in 2 C. metapsilosis isolates, sequence analysis of this genes must be performed.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    131802

    Yoğun bakım hastalarından izole edilen mayalar ve antifungal ajanlara duyarlılıkları

    Yeasts isolated from intensive care unit patients and their susceptibilities against antifungal agents

    MAHMUT CEM ERGON

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MİNE YÜCESOY

    PROF. DR. NURAN YULUĞ

  2. Tez No

    579475

    Kanal tedavisi yapılan hastalarda izole edilen candidaların PCR-RFLP yöntemi ile genotiplendirilmesi ve azol direncinin belirlenmesi

    Kanal tedavi̇si̇ yapilan hastalarda i̇zole edi̇len candidalarin PCR-RFLP yöntemi̇ i̇le genoti̇plendi̇ri̇lmesi̇ ve azol di̇renci̇ni̇n beli̇rlenmesi̇

    ZAHİDE TOPAKTAŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiHatay Mustafa Kemal Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NİZAMİ DURAN

  3. Tez No

    749371

    Klinik candida ve aspergillus suşlarının antifungal duyarlılık profillerinin matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyon/iyonizasyon uçuş zamanı kütle spektrometresi ('MALDİ-TOF MS') yöntemi ile değerlendirilmesi

    Evaluation of antifungal susceptibility profiles of clinical candida and aspergillus strains by matrix assisted laser desorption/ionization time-of-FLİGHT MASS spectrometry ('MALDİ-TOF MS') method

    İLKE TOKER ÖNDER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEVTAP ARIKAN AKDAĞLI

  4. Tez No

    290413

    Candida ve Aspergillus enfeksiyonlarının real time PCR yöntemi ile hızlı tanısının kültür yöntemi ile karşılaştırılması ve antifungal direncin kolorimetrik yöntemle tayini

    Real time PCR for rapid diagnosis of Candida and Aspergillus infections with comparison of culture method and determination of antifungal resistance colorimetric method

    İSKENDER KARALTI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    BiyolojiMarmara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜNAY TÜLAY ÇOLAKOĞLU

  5. Tez No

    370125

    Nadir rastlanan enfektif endokardit etkenleriinin araştırılması: HACEK grubu mikroorganizmalar, chlamydophıla pneumonıae, coxıella türleri ve bartonella türleri

    The investigation of rarely encountered causative agents of infective endocarditis: HACEK group organisms, chlamydophyla pneumoniae, coxiella and bartonella species

    SİNEM ÖZDEMİR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Temel Tıp Bilimleri Bölümü

    PROF. DR. MÜZEYYEN MAMAL TORUN

Geri Dön