Erzincan tulum peynirinden izole edilen staphylococcus aureus izolatlarında antibiyotik direncinin ve biyofilm oluşturma özelliğinin fenotipik ve genotipik olarak belirlenmesi
The determination of antibiotic resistance and biofilm creating properties of staphylococcus aureus isolates from erzincan tulum cheese as phenotypic and genotypic
- Tez No: 311360
- Danışmanlar: DOÇ. DR. K. SEMİH GÜMÜŞSOY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Antibiyotik direnci, biyofilm, Staphylococcus aureus, Polimeraz Zincir Reaksiyonu, tulum peyniri, Antibiotic resistance, biofilm, Staphylococcus aureus, Polymerase Chain Reaction, Tulum cheese
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 75
Özet
Bu çalışmada Erzincan'da tüketime sunulan Erzincan tulum peynirinden izole edilen Staphylococcus aureus'ların biyofilm oluşturabilme yetenekleri ve antibiyotik dirençlilikleri fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırıldı.Araştırmada 100 adet Erzincan tulum peyniri numunesi toplandı. Aseptik koşullarda alınan peynir örneklerinden Staphylococcus aureus izolasyonu için Baird-Parker Agar'a ekim yapıldı. Buradan ayrılan izolatlar gram boyama, hemoliz ve koagülaz testleriyle Staphylococcus aureus olarak identifiye edildi. İzolatlar Polimeraz Zincir Reaksiyonu kullanılarak nuc, mecA, vanA ve vanB geni yönünden incelendi. Staphylococcus aureus izolatlarının biyofilm oluşturma yeteneği için Kongo Red Agar ve antibiyotik dirençlilikleri içinde oksasilin (1µg), sefoksitin (30µg), vankomisin (30µg), amoksisilin-klavulonik asit (20µg) ve penisilin(10 unit) antibiyotik diskleri kullanıldı.Test edilen örneklerin 72 (% 72)'si Staphylococcus spp. pozitif bulundu. Bunlardan 61 (% 84,7) örnek fenotipik ve genotipik olarak Staphylococcus aureus olarak identifiye edildi. İzolatların 37 (% 60,6)'sinin biyofilm oluşturduğu saptandı. Disk difüzyon yönteminde 61 izolattan 9 (% 14,7)'unda oksasilin (metisilin), 8 (% 13,1)'inde sefoksitin, 4 (% 6,5)'ünde amoksisilin-klavulonik asit, 28 (% 45,9)'inde ise penisilin dirençliliği tespit edilirken vankomisin dirençli izolata rastlanmadı. Polimeraz Zincir Reaksiyonu sonucunda 61 örnekten 10 (% 16,3)'unda mecA geni saptanırken vanA ve vanB genine rastlanmadı.Sonuç olarak Erzincan tulum peynirinde Staphylococcus aureus'un yüksek bir oranda bulunduğu görülmüştür. Bu durumun özellikle peynirin imalat safhasında yeterli hijyen kurallarına riayet edilmemesi ve olgunlaşma süresinin kısaltılarak satışa sunulmasından kaynaklandığı düşünülmektedir. Bu sonuçların ışığı altında bölge ile özdeşleşmiş olan Erzincan tulum peynirinin Staphylococcus aureus ile kontaminasyon oranının yüksek olması ve izolatların antibiyotik dirençliliği göz önünde bulundurulduğunda halk sağlığı açısından risk oluşturabileceği kanaatine varılmıştır.
Özet (Çeviri)
In this study, biofilm forming capabilities, and antibiotic resistance of Staphylococcus aureus strains which were isolated from 100 different Erzincan tulum cheese consumed in Erzincan province, were investigated as phenotypic and genotypic.In this study 100 samples of Erzincan tulum cheese were gained from Erzincan Province. Samples of cheese which were gained from aseptic conditions were inoculated into the Baird-Parker Agar for the isolation of Staphylococcus aureus. Isolates from agar separated that agar were identified as Staphylococcus aureus with gram staining, hemolysis and coagulase tests. Isolates were examined using the Polymerase Chain Reaction in terms of NUC, mecA, vanA and vanB genes. Congo Red Agar was used to determine biofilm formation capability of isolates of Staphylococcus aureus and oxacillin (1?g), cefoxitin (30?g), vancomycin (30?g), amoxicillin-clavulanic acid (20?g), and penicillin (10 units) antibiotic discs were used to remark antibiotic resistance analyzes.72 (72%) of tested samples were found as positive for Staphylococcus spp. Among these 72 (72 %) samples, 61 (84.7 %) were identified as Staphylococcus aureus both phenotypic and genotypic. It was also determined that 37 (60.6 %) of isolates had formed biofilm. In the study with disc diffusion method, it was found that from 61 isolates 9 (14.7 %) were oxacillin (methicillin), 8 (13.1 %) were cefoxitin, 4 (6.5 %) were amoxicillin-clavulanic acid and 28 (45.9 %) were resistance to penicillin. On the other hand, vancomycin-resistant strain was not detected. In the examination performed by polymerase chain reaction in all of 61 strains of Staphylococcus aureus, nuc gene and 10 (16.3 %) mecA genes were detected. vanA and vanB genes were not detected.As a result, high percentages of Staphylococcus aureus were determined in Erzincan tulum cheese. This is due to poor hygiene rules especially phase of cheese manufacturing and shortened ripening period for sale. In the light of these results it was concluded that Erzincan tulum cheese now identified with the region has a high rate of contamination with Staphylococcus aureus and considering its isolates have antibiotic resistance has risk to public health.
Benzer Tezler
- Tulum peynirinden izole ve identifiye edilen bazı laktik asit bakteri suşlarının starter kültür özellikleri ve peynirlerin bazı özelliklerinin tespiti
The Determination of starter culture properties of some isolated and identified lactic acid bacteria strains from tulum cheese and some properties of the cheeses
MUSTAFA ŞENGÜL
Doktora
Türkçe
2001
Gıda MühendisliğiAtatürk ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF.DR. SONGÜL ÇAKMAKÇI
- Erzincan tulum peynirinden laktik asit bakterilerinin (LAB) izolasyonu, moleküler metotlarla tanımlanması ve ekzopolisakkarit (EPS) üretim potansiyellerinin genetik olarak belirlenmesi
Isolation of lactic acid bacteria (LAB) from erzincan tulum cheese, determination by molecular methods and genetically determining of their exopolysacchari̇des (EPS) production potential
HÜMEYRA İSPİRLİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
BiyoteknolojiBayburt ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. AYLA ARSLANER
YRD. DOÇ. DR. ENES DERTLİ
- Erzincan tulum peynirinde Staphylococcus aures sayısının olgunlaşma süresince değişimi
The determination Staphylococcus aureus count of Erzincan tulum cheese during ripening periods
SEFA HAKİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
Gıda MühendisliğiAtatürk ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SELAHATTİN SERT
- Seçilmiş Penicillium roqueforti suşu kullanılarak üretilen Erzincan tulum peynirinde depolama süresince toksin içeriği ile olgunlaşma, mikrobiyolojik ve duyusal kalitenin tespiti
Determination of the microbiological and sensory quality, toxin content with ripening, during storage in Erzincan tulum cheese by using of selected Penicillium roqueforti strain
YUSUF ÇAKIR
Doktora
Türkçe
2018
Gıda MühendisliğiAtatürk ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SONGÜL ÇAKMAKÇI
- Geleneksel yöntem ve farklı sütlerden ısıl işlem uygulanarak üretilen ve farklı ambalaj materyallerinde olgunlaştırılan Erzincan tulum peynirinde bazı kalite niteliklerinin tespiti
Determination of some quality properties of Erzincan tulum cheese made from different milks by using traditional method and applying heat treatment and ripened assorted packaging materials
AYLA ARSLANER
Doktora
Türkçe
2008
Gıda MühendisliğiAtatürk ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İHSAN BAKIRCI