Geri Dön

Hastane ve toplum kaynaklı Staphylococcus aureus izolatlarında çeşitli virülans faktörlerinin real-time PZR yöntemi ile araştırılması

Investigation of various virulence factors among the hospital-acquired and community-acquired Staphylococcus aureus isolates by real-time-PCR method.

PDF İndir

  1. Tez No: 311706
  2. Yazar: SONER YILMAZ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ABDULLAH KILIÇ
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: GATA
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 85

Özet

Staphylococcus aureus, toplumda görülen deri ve yumuşak doku enfeksiyonlarının en sık nedenlerinden biri ve hastane kaynaklı enfeksiyonların en önemli nedenidir. Bu tez çalışmasında 2007 ile 2010 yılları arasında çeşitli klinik örneklerden elde edilen toplum ve hastane kaynaklı 147 S. aureus izolatında stafilokokkal enterotoksin A (SEA), stafilokokkal enterotoksin B (SEB), stafilokokkal enterotoksin C (SEC) stafilokokkal enterotoksin D (SED), toksik şok sendromu toksin-1 (TŞST-1), Panton-Valentin lökosidin (PVL) toksinlerinin varlığının ve SCCmec fenotiplerinin [Metisilin dirençli S. aureus (MRSA) izolatlarında] real-time PZR yöntemi ile tespit edilmesi amaçlandı. Buna ilave olarak 72 adet hastane-kaynaklı (%48.9) ve 75 adet toplum-kaynaklı (%51.1) izolat arasındaki genotipik ilişkiyi göstermek amacı ile multiple locus variable number of tandem repeat analysis (MLVA) yöntemi kullanıldı. Yüz kırk yedi izolatın 93'ünde (%63.2) en az bir adet (77 izolatta bir, 16 izolatta birden fazla) toksin görüldü. Toksin tespit edilen izolatların 55 tanesi (%59.1) hastane-kaynaklı 38 tanesi (%40.9) ise toplum-kaynaklı izolatlardı. SEA toksini toplam 147 izolatın 59'unda (%40.1), SEB toksini sekizinde (%5.4), SEC toksini 12'sinde (%8.1), SED toksini sekizinde (%5.4), TŞST-1 toksini 17'sinde (%11.5) ve PVL toksini altı izolatta (%4.0) tespit edildi. Çalışmamızda hastane-kaynaklı MRSA suşlarında %90.9 oranında SCCmec tip III, %2.2 oranında SCCmec tip IV bulunurken diğer yandan toplum-kaynaklı MRSA suşlarında %40 oranında SCCmec tip IV tespit edildi. Geri kalan izolatların tiplendirilmesi yapılamamıştır. SEA toksini tespit edilen izolatların çoğu hastane kaynaklı olup metisiline dirençli bulunmuştur (40/47, %85.1). MLVA yöntemine göre hastane ve toplum-kaynaklı grupların kümeleşme oranları, klon sayıları, özgün profil sayıları sırasıyla %73.6 ve %57.3, 34 ve 47, 19 ve 32 olarak bulunmuştur. Hastane-kaynaklı MRSA izolatlarında yüksek oranda SEA toksini tespit edilmesi bu toksinle direnç gelişimi arasında bir ilişki olabileceğini göstermektedir.

Özet (Çeviri)

Staphylococcus aureus is the most common cause of skin and soft tissue infection in the community and the most important cause of nosocomial infection. In this research, it was aimed to explore the presence of staphylococcal enterotoxin A (SEA), staphylococcal enterotoxin B (SEB), staphylococcal enterotoxin C (SEC), staphylococcal enterotoxin D (SED), toxic shock syndrome toxin-1 (TSST-1), Panton Valentine leukocidin (PVL) and SCCmec phenotype by real-time PCR in 147 strains of S. aureus isolated from various clinical samples from Gulhane Military Medical Academy Hospital (GMMAH) between 2007 and 2010. In addition, Multiple Locus Variable number of tandem repeat Analysis (MLVA) was used to demonstrate the genotypic association between 75 hospital-acquired (51.1%) and 72 community-acquired (48.9%) isolates. Among 147 isolates, 93 (63.2%) possesed at least one toxin (77 strains carried one, and 16 strains carried more than one). The 55 (59.1%) of these 93 isolates were hospital-acquired and 38 (40.9%) were community-acquired. The SEA toxin was found in 59 isolates (40.1%), SEB in eight isolates (5.4%), SEC in 12 isolates (8.1%), SED in eight isolates (5.4%), TSST-1 in 17 isolates (11.5%), PVL toxin in six isolates (4.0%). In our study, SCCmec type III was detected in 90.9%, SCCmec type IV in 2.2% among hospital-acquired MRSA; on the other hand, SCCmec type IV was detected in 40.0% among community-acquired MRSA. The rest of the strains could not typed. Most of the strains (40/47; 85.1%) carrying SEA were hospital-acquired, and they were found as methicilline resistant. According to MLVA, hospital and community-acquired groups? clustering rates, number of clones, number of unique profile were found as; 73.6% and 57.3%; 34 and 47; 19 and 32, respectively. The high prevalence of SEA toxin in hospital-acquired MRSA isolates indicates that there would be an association between the presence of toxin and antimicrobial resistance.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    195129

    Hacettepe üniversitesi erişkin hastanesinde 2004-2005 yıllarında hastane kaynaklı infeksiyonlardan izole edilen metisiline dirençli staphylococcus aureus (mrsa) suşlarının moleküler tiplendirmesi

    Molecular characteristics of hospital-acquired methicillin-resistant staphylococcus aureus isolated at hacettepe university adult hospital in 2004-2005

    HADİM AKOĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıHacettepe Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. PINAR ZARAKOLU

    PROF.DR. SERHAT ÜNAL

  2. Tez No

    230087

    Staphylococcus aureus klinik izolatlarında panton-valentin lökosidin varlığının araştırılması

    Investigation of panton-valentine leukocidine presence in the clinical strains of Staphylococcus aureus

    OSMAN SEZER CİRİT

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    MikrobiyolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AHMET YILMAZ ÇOBAN

  3. Tez No

    518007

    Süt ürünlerinden izole edilen staphylococcus aureus suşlarında icaA ve icaD genlerinin ve biyofilm üretiminin tespiti

    Detection of icaA and icaD genes and biofilm production in Staphylococcus aureus strains isolated from milk products

    BURCU ESKİCİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    GenetikNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EMRAH TORLAK

  4. Tez No

    411944

    Deri ve yumuşak doku enfeksiyonu etkeni olan toplum ve hastane kaynaklı staphylococcus aureus izolatlarının antimikrobiyal duyarlılık durumlarının ve panton valentıne leukocıdın toksini sıklığının araştırılması

    Investigation of panton valentine leukocidin toxin frequency and antimicrobial susceptibilities of community and hospital acquired staphylococcus aureus isolates related with skin and soft tissue infections

    TÜLİN DEMİR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    MikrobiyolojiSağlık Bakanlığı

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. NİLAY ÇÖPLÜ

  5. Tez No

    386476

    Klinik örneklerden izole edilen stafilokoklarda makrolid, linkozamid ve streptogramin B direncinin fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması

    Investigation of the macrolide, lincosamide and streptogramin B resistance by phenotypic and genotypic methods in staphylococci isolated from clinical samples

    FUNDA KOÇAL CAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Mikrobiyolojiİzmir Katip Çelebi Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA DEMİRCİ

Geri Dön