Geri Dön

Expressions of some miRNAs in Alzheimer patients and investigation of polymorphisms in genes involved in the miRNA formation pathway

Alzheimer hastalarında bazı mikroRNA'ların ifadeleri ve oluşum yolağında rol oynayan genlerin polimorfizmlerinin araştırılması

  1. Tez No: 339461
  2. Yazar: ŞENAY GÖRÜCÜ YILMAZ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. M. EMİN ERDAL
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Mersin Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 130

Özet

Alzheimer hastalığı çevresel ve genetik faktörlerin birlikte rol aldığı karmaşık kalıtsal bir nöropsikiyatrik hastalıktır. Protein kodlamayan transkriptlerden işlenerek oluşturulan ve küçük RNA molekülleri ailesinde yer alan miRNA'lar, nöropsikiyatrik hastalıklarda gen ekspresyonunun düzenlenmesinden sorumlu tutulan faktörlerden biri olarak kabul edilir. Bu tezde, miRNA oluşum yolağında yer alan genlere ait polimorfizmlerin ve Alzheimer hastalığının genetik temelinden sorumlu APP, BACE1, PSEN1 ve PSEN2 genlerini hedef alan miRNA?ların ekspresyon düzeylerindeki değişimlerin, hastalık riski ile ilişkisi araştırıldı. Çalışmaya Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi Nöroloji Anabilim Dalı?nda DSM-IV-TR tanı ölçütlerine göre Alzheimer tanısı konmuş 172 hasta ile kendisinde ve ailesinde Alzheimer ya da herhangi bir psikiyatrik hastalık tanısı konmamış, 109 yaşlı ve sağlıklı birey dahil edildi. Hasta ve kontrol grubuna ait kan örneklerinden RNA ve DNA izolasyonu yapılarak her bireyin; hsa-miR-9-5p, hsa-miR-29a-3p, hsa-miR-106a-5p, hsa-miR-106b-5p, hsa-miR-107, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-125b-5p genlerine ait ekspresyonları; RNASEN, DGCR8, XPO5, RAN, DICER1, GEMIN3, GEMIN4, TARBP2, AGO1 ve AGO2 genlerine ait sırasıyla rs10719, rs1640299, rs11077, rs14035, rs3742330 ve rs13078, rs197388, rs910924, rs784567, rs595961, rs4961280 polimorfizmlerinin moleküler analizi Real-Time PCR yöntemi ile gerçekleştirildi. Ekspresyon ve genotiplendirme sonucu elde edilen veriler, SPSS (v.11.5) paket programı ile istatistiksel olarak değerlendirildi. hsa-miR-29a-3p, hsa-miR-125a-3p ve hsa-miR-125b-5p ekspresyon düzeyleri ile hasta ve kontrol grupları arasında anlamlı bir farklılık olmadığı saptandı (p>0,05). hsa-miR-9-5p, hsa-miR-106a-5p, hsa-miR-106b-5p ve hsa-miR-107 genlerine ait ekspresyon düzeyleri ile Alzheimer hastalığı olma riski arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki bulundu (p0,05). TARBP2 geni rs784567 polimorfizmi için genotip dağılımı ve Alzheimer hastalığı olma riski arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki bulundu (p

Özet (Çeviri)

Alzheimer disease, on which the environmental and genetic factors play a role in together, is a complex and inherited neuropsychiatric disorder. miRNA, a member of small RNA molecules family and derived from non-protein-coding transcripts, is one of the factors responsible for regulation of gene expression to neuropsychiatric disorders. In that thesis, the relationship of polymorphisms in the miRNA biogenesis pathway genes and the changes in the levels of expression of miRNAs targeting APP, BACE1, PSEN1, and PSEN2 genes responsible for the genetic basis of Alzheimer's disease with the risk of the disease are investigated. The study group consisted of 172 patients with probable Alzheimer disease diagnosed according to DSM-IV-TR criteria in Neurology Department at Medical Faculty of Mersin University and 109 elderly healthy control subjects. Molecular analyses of expressions that belong to hsa-miR-9-5p, hsa-miR-29a-3p, hsa-miR-106a-5p, hsa-miR-106b-5p, hsa-miR-107, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-125b-5p genes, and rs10719, rs1640299, rs11077, rs14035, rs3742330 and rs13078, rs910924, rs784567, rs595961, rs4961280, rs197388 polymorphisms that respectively belong to RNASEN, DGCR8, XPO5, RAN, DICER1, GEMIN3, GEMIN4, TARBP2, AGO1 and AGO2 genes are performed for each subject using the method of Real-Time PCR, whereafter both RNA and DNA are isolated from blood samples of the patients and control subjects. The data obtained as a result of the expression and genotyping statistically evaluated by using the SPSS (version 11.5) statistics software package. Expression levels of hsa-miR-29a-3p, hsa-miR-125a-3p and hsa-miR-125b-5p were not significantly different between patient and control groups (p>0.05). A statistically significant relationship between the expression levels of hsa-miR-9-5p, hsa-miR-106a-5p, hsa-miR-106b-5p and hsa-miR-107 genes and the risk of Alzheimer's disease was found (p0,05). A statistically significant relationship between genotype distribution of rs784567 polymorphism in TARBP2 gene and the risk of Alzheimer's disease was found (p

Benzer Tezler

  1. Alzheimer hastalığında long non-coding RNA (LNCRNA) profillerinin araştırılması

    Investigation of long non-coding rna (LNCRNA) profiles in alzheimer's disease

    SERAP KURT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Tıbbi BiyolojiPamukkale Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYŞE GAYE TOMATIR

  2. Amiloid β (1-42) ile indüklenen alzheimer hastalığı deney modelinde hidroksipropil-β-siklodekstrin (HP- β -CD) ve HP-CD içeren polimerik nazal mikrokürelerin bazı pro-inflamatuar mRNA ve CAV-1 mRNA ekspresyonu üzerindeki etkilerinin araştırılması

    Effect of hydroxypropyl-β-cyclodextrin (HP- β -CD) and HP-CD loaded polymeric nasal microspheres on the expressions of some pro-inflammatory and CAV-1 mRNAS in experimental model of alzheimer's disease induced by amyloid-β (1-42)

    BATUHAN ELİBOL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Eczacılık ve FarmakolojiEge Üniversitesi

    Sinir Bilimi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYFER YALÇIN

  3. Alzheimer hastalığı tanısında APP ilişkili gen ve miRNA seviyelerinin biyolojik belirteç olarak kullanılmasının SH-SY5Y insan nöroblastoma hücrelerinde incelenmesi

    Analysis of the use of APP related gene and miRNA levels as biomarkers in SH-SY5Y neuroblastoma cells in the diagnosis of Alzheimer's disease

    EZGİ KESKE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    GenetikHaliç Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZLEM SAĞLAM UÇAR

  4. Dikkat eksikliği hiperaktivite bozukluğu olan ve olmayan çocuklarda mikroRNA düzeylerinin karşılaştırılması

    Comparison of micro RNA levels between children with and without attention deficit and hyperactivity disorder

    ŞEYMA COŞKUN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    GenetikGaziantep Üniversitesi

    Çocuk ve Ergen Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CEM GÖKÇEN

  5. HK-2 hücre hattında anti-HLA antikorlarının mirna ekspresyonu üzerine etkisinin araştırılması

    Investigation of the effect of anti-HLA antibodies on mirna expression in HK-2 cell line

    ASLI ELDEM

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Tıbbi Biyolojiİzmir Katip Çelebi Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TÜLAY KILIÇASLAN AYNA