Tüberküloz Hastalarında Sitokin Gen Polimorfizmi ve Genetik Yatkınlık
Cytokine Gene Polymorphism in Tuberculosis Patients and Genetic Susceptibility
- Tez No: 314344
- Danışmanlar: PROF. DR. GÜROL EMEKDAŞ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Mikrobiyoloji, Genetics, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Mersin Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 127
Özet
Tüberküloz (TB) biyolojik, sosyoekonomik ve çevresel faktörlerin birlikte rol oynadığı karmaşık bir hastalıktır. Mycobacterium tuberculosis ile enfekte kişilerin sadece %10'unda aktif hastalık geliştiği için, konak genetiğinin TB için risk faktörlerini etkileyebileceği öne sürülmüştür. Bu çalışmada, hastalığa karşı duyarlılık veya direnç ile ilişkili olduğu belirtilen, sitokin üretiminden sorumlu gen bölgelerindeki tek nükleotid polimorfizm varlığının ?Amplification Refractory Mutational System (ARMS) Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ve PZR-Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) yöntemleri ile araştırılması amaçlanmıştır. Tek nükleotid polimorfizm varlığı tümör nekrozis faktör alfa (TNF-?) geni promoter -308 G/A bölgesinde, interferon gama (IFN-?) geni +874 T/A bölgesinde, interlökin (IL)-12B p40 geni 1188 A/C bölgesinde, IL-10 geni promoter -1082 G/A bölgesinde ve IL-4 geni promoter -590 C/T bölgesinde araştırılmıştır.Klinik materyalinde M. tuberculosis kompleks izole edilen 84 hastanın 71 (%84.52)'i erkek, 13 (%15.48)'ü kadındı (yaş ortalamaları 32.57±15.94). Sağlıklı kontrol grubunu oluşturan 110 kişinin 93 (%84.55)'ü erkek, 17 (%15.45)'si kadındı (yaş ortalamaları 29.40±11.56). Hastaların 76 (%90.48)'sı akciğer TB'u iken 8 (%9.52)'i akciğer dışı TB olarak tespit edildi. Hastaların 79 (%94.05)'u yeni tanı konmuş TB hastası iken, 5 (%5.95)'inde daha önceden geçirilmiş TB öyküsü (nüks TB) olduğu belirlendi. Hastaların 58 (%69.05)'inde asido rezistan basil pozitifliği belirlendi.Tek nükleotid polimorfizmi sonuçlarına göre TNF-? geni -308 G/A bölgesi polimorfizmi için sağlıklı kontrol grubumuz dengedeyken, hasta grubumuz dengede olmadığından bu iki grubun gen frekansları bakımından karşılaştırılması yapılamamıştır. IFN-? geni +874 T/A bölgesi, IL-12B p40 geni 1188 A/C bölgesi, IL-10 geni -1082 G/A bölgesi ve IL-4 geni -590 C/T bölgesi polimorfizmleri sonucu allel ve genotip dağılımlarında hasta ve sağlıklı kontrol grubu arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunamamıştır.Sonuç olarak, çalışılan bu grupta sitokin salınımından sorumlu gen bölgelerindeki tek nükleotid polimorfizm varlığı ile TB'a direnç ya da duyarlılık arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunamamıştır. Bu çalışmada sadece sitokin salınımından sorumlu gen bölgelerindeki bazı tek nükleotid polimorfizmlerinin varlığı araştırılmıştır. Bu konunun daha iyi aydınlatılması için hasta ve kontrol grubunun genişletilerek insan lökosit antijeni (HLA) tiplerinin ve sitokin salınımından sorumlu gen bölgelerindeki diğer polimorfizmlerin de çalışılması gerekmektedir.
Özet (Çeviri)
Tuberculosis (TB) is a complex disease with biological, socioeconomic and environmental factors. Since only 10% of individuals infected with Mycobacterium tuberculosis go on to develop active disease, it has been suggested that host genetics may influence the risk for TB. In this study, we aimed to investigate the presence of single nucleotide polymorphisms in the gene regions responsible for cytokine production, indicated to be associated with susceptibility or resistance against the disease, by Amplification Refractory Mutational System (ARMS) Polymerase Chain Reaction (PCR) and PCR-Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) methods. The presence of single nucleotide polymorphisms were analyzed in tumor necrosis factor alpha (TNF-?) gene promoter -308 G/A region, interferon gamma (IFN-?) gene +874 T/A region, interleukin (IL)-12B p40 gene 1188 A/C region, IL-10 gene promoter -1082 G/A region and IL-4 gene promoter -590 C/T region.Of the 84 patients from whose clinical material M. tuberculosis complex was isolated, 71 (84.52%) were males, 13 (15.48%) were females (mean age 32.57±15.94). Of the 110 healthy controls, 93 (84.55%) were males, 17 (15.45%) were females (mean age 29.40±11.56). Of the 84 patients, 76 (90.48%) were pulmonary TB while 8 (9.52%) were extrapulmonary TB. While 79 patients (94.05%) were newly diagnosed as TB, 5 patients (5.95%) had a TB history. It was detected that acid resistant bacilli were positive in 58 (69.05%) patients.According to the single nucleotide polymorphism results, comparison of the gene frequencies could not be done in TNF-? gene -308 G/A region because healthy controls were in equilibrium while the patients were not. There were no significant differences in allele and genotype distribution between the patients and healthy controls in IFN-? gene +874 T/A region, IL-12B p40 gene 1188 A/C region, IL-10 gene -1082 G/A region and IL-4 gene -590 C/T region.In conclusion, no statistically significant differences were found between the susceptibility or resistance to TB with single nucleotide polymorphisms in the gene regions responsible for cytokine production in the studied population. In this study, the existence of the some single nucleotide polymorphisms in the gene regions those are responsible from only cytokine production were investigated. For the clarification of this subject, with enlarged patients and healthy controls, human leukocyte antigen types and other polymorphisms in gene regions, responsible for cytokine production should be studied.
Benzer Tezler
- Tüberküloz hastalarında SOCS-1 gen polimorfizmlerinin araştırılması
Investigation of SOCS-1 gene polymorphisms in tuberculosis patients
LEYLA ERSOY
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyolojiMersin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AHMET ATA ÖZÇİMEN
PROF. DR. GÖNÜL ASLAN
- Tüberküloza duyarlılıkla IL-17A, IL-17F ve IL-23R gen polimorfizmleri ile Irak-1 ve Irak-3 doğal bağışıklık regülatörlerinin ilişkisi
The relationship between tuberculosis susceptibility iIL-17A, IL-17f and IL-23R gene polymorphisms and İrak-1 and İrak-3 innate immune regulators
GÜLŞAH TOLLU
Doktora
Türkçe
2022
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH KÖKSAL
- Tüberküloz duyarlılığında konak genetiği
Host genetics in tuberculosis sensitivity
ALPER AKGÜNEŞ
Doktora
Türkçe
2009
GenetikOndokuz Mayıs ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BELMA DURUPINAR
- Toll-ınteracting protein (TOLLIP), ıl-1β ve ıl-10 gen polimorfizmleri ile insan doğal immün cevabının negatif regülatörlerinin ekspresyonunun tüberküloza duyarlılıkla ilişkisi
Association of toll-interacting protein (TOLLIP), il-1β and il-10 gene polymorphisms and expression of negative regulators of human innate immune response with susceptibility to tuberculosis
EMEL EKER
Doktora
Türkçe
2018
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ TOĞRUL NAĞIYEV
- Aktif tüberkülozlu hastalarda tedavi öncesi ve tedavi süresince IFN-Gamma ve IL-2 düzeylerinin araştırılması
Başlık çevirisi yok
HÜSEYİN GÜDÜCÜOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2000
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıYüzüncü Yıl ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. MUSTAFA BERKTAŞ