Ülseratif kolitte Wnt sinyal yolağında rol oynayan bazı genlerin metilasyonu ve gen ekspresyonu
The expression and metylation of some Wnt signaling pathway genes which plays a role in ulcerative colitis
- Tez No: 314343
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET EMİN ERDAL
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Ekspresyon, metilasyon, neoplazi, ülseratif kolit, Wnt Yolağı, Expression, methylation, neoplasia, ulcerative colitis, WNT pathway
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Mersin Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 86
Özet
Ülseratif kolit; gastrointestinal yolağın kronik inflamatuvar hastalığı olup, kolorektal kanser için artmış riske sahiptir. Ülseratif kolitle ilişkili neoplazide Wnt sinyal yolağının rolü son yayınlarda bildirilmiştir. Bu çalışmada ülseratif kolitle ilişkili neoplazide Wnt sinyal yolağı genlerinin metilasyon ve ekspresyon durumlarının incelemesi amaçlandı.Hasta grubu distal tip ülseratif kolit tanısı almış ve sürveyans kolonoskopisi yapılan 20 bireyden; kontrol grubu kolon kanseri taraması yapılan herhangi bir yakınması ve endoskopik patolojisi olmayan 15 bireyden oluşturuldu. Hasta ve kontrollerin kolonik biyopsilerinden DNA ve RNA elde edildi. SFRP2, SFRP4, SFRP5, APC1, APC2 ve ACTB gen ekspresyonları Real-Time PCR ve ?Comparative CT (??Ct)? analizi ile belirlendi. Metilasyon spesifik PCR ile bu genlerin metilasyon durumlarına bakıldı.APC2 geninin metilasyonu için hasta grubunda 8 kişi metile (%40) ve 12 kişi unmetile (%60) iken kontrollerin 1'i metile (%6,7), 14'ü unmetile (%93,3) idi (p=0,018). Hasta grubunda SFRP5 geni için metilasyon durumu ve ekpresyonları arasında anlamlı bir ilişki bulundu (p=0,015). Hasta ve kontroller arasında diğer genler için metilasyon, ekspresyon ve inflamasyon durumu arasında istatistiksel olarak anlamlı ilişki bulunmadı.Ülseratif kolitte APC2'nin metilasyonunun arttığı, SFRP5 metilasyon artışının ekspresyonu azalttığı bulgusunun inflamasyonla ilişkisi olduğu ileri sürülebilir. Ülseratif kolit ilişkili neoplazi ile ilişkisini söyleyebilmek için daha fazla çalışmaya ihtiyaç vardır.
Özet (Çeviri)
ABSTRACTUlcerative colitis, being chronically inflammatory disease of gastrointestinal pathway, has increased risk of colorectal cancer. The role of WNT signaling pathway in neoplasia related with ulcerative colitis has been indicated in recent publications. In this study, it is aimed to investigate the methylation and expression status of WNT signaling pathway genes in neoplasia related with ulcerative colitis.Patient group composed of 20 people diagnosed with distal type ulcerative colitis and having surveillance colonoscopy, control group composed of 15 people having colon cancer screening, not having any complaints or endoscopic pathology. DNA and RNA are obtained from the biopsies of the patient and control groups. SFRP2, SFRP4, SFRP5, APC1, APC2 and ACTB gene expressions are determined by Real-Time PCR and ?Comparative CT (??Ct)? analysis. The methylation status of the genes are studied by using methylation specific PCR.For APC2 gene methylation; in patient group 8 people are methylated (%40) and 12 are unmethylated (%60) whereas in the control group 1 is methylated (%6.7), 14 are unmethylated (93.3%) (p=0.018). In patient group, for SFRP5 gene, a significant relationship is observed between the methylation status and expressions (p=0.015). Regarding the other genes, no significant statistical relationship is observed among the methylation, expression and inflamation status between the patient and control groups.In ulcerative colitis, it is suggested that the findings of the increase in the methylation of APC2, and the decrease in the expression due to the incease of SFRP5 methylation both have a relationship with inflamation. However, further studies are needed in order to suggest its relationship with ulcerative colitis related neoplasia.
Benzer Tezler
- Development of mirna biomarkers for the differentiation between gingivitis and periodontitis: A pilot study
Gingivitis ve periodontitis ayrımı için mirna biyobelirteçlerinin geliştirilmesi: Pilot çalışma
DHAFIR LATIEF FAYADH FAYADH
Doktora
İngilizce
2023
BiyokimyaSüleyman Demirel ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA CALAPOĞLU
- Ülseratif kolitte yeni inflamatuar biyobelirteçlerin subkutan infliksimab tedavisinde remisyonu öngörme gücü : Tek merkezli retrospektif bir çalışma
Başlık çevirisi yok
DOĞUŞ BERK KUZUCU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
GastroenterolojiEge Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NALAN GÜLŞEN ÖZÇELİK ÜNAL
- Ülseratif kolitte endoskopik remisyonun prognoz üzerine etkisi
The effect of endoscopic remission on the prognosis in ulcerative colitis
ŞEYMA ŞENOCAK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
GastroenterolojiSakarya Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUKADDES TOZLU
- Ülseratif kolitte subklinik akciğer tutuluşu: Solunum fonksiyon testi, HRCT, BAL, transbronşiyal biyopsi bulguları
Başlık çevirisi yok
FİSUN KARADAĞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1996
GastroenterolojiEge ÜniversitesiGöğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZHAN MUSTAFA HİKMET
- Ülseratif kolitte yeni aktivasyon göstergesi serum eozinofil katyonik protein
A New activation marker in ulcerative colitis: Serum eosinophilic cationic protein (ECP)
YAKUP ÜLGER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2002
Gastroenterolojiİstanbul Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF.DR. HÜLYA UZUNİSMAİL