Ülseratif kolitte Wnt sinyal yolağında rol oynayan bazı genlerin metilasyonu ve gen ekspresyonu
The expression and metylation of some Wnt signaling pathway genes which plays a role in ulcerative colitis
- Tez No: 314343
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET EMİN ERDAL
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Ekspresyon, metilasyon, neoplazi, ülseratif kolit, Wnt Yolağı, Expression, methylation, neoplasia, ulcerative colitis, WNT pathway
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Mersin Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 86
Özet
Ülseratif kolit; gastrointestinal yolağın kronik inflamatuvar hastalığı olup, kolorektal kanser için artmış riske sahiptir. Ülseratif kolitle ilişkili neoplazide Wnt sinyal yolağının rolü son yayınlarda bildirilmiştir. Bu çalışmada ülseratif kolitle ilişkili neoplazide Wnt sinyal yolağı genlerinin metilasyon ve ekspresyon durumlarının incelemesi amaçlandı.Hasta grubu distal tip ülseratif kolit tanısı almış ve sürveyans kolonoskopisi yapılan 20 bireyden; kontrol grubu kolon kanseri taraması yapılan herhangi bir yakınması ve endoskopik patolojisi olmayan 15 bireyden oluşturuldu. Hasta ve kontrollerin kolonik biyopsilerinden DNA ve RNA elde edildi. SFRP2, SFRP4, SFRP5, APC1, APC2 ve ACTB gen ekspresyonları Real-Time PCR ve ?Comparative CT (??Ct)? analizi ile belirlendi. Metilasyon spesifik PCR ile bu genlerin metilasyon durumlarına bakıldı.APC2 geninin metilasyonu için hasta grubunda 8 kişi metile (%40) ve 12 kişi unmetile (%60) iken kontrollerin 1'i metile (%6,7), 14'ü unmetile (%93,3) idi (p=0,018). Hasta grubunda SFRP5 geni için metilasyon durumu ve ekpresyonları arasında anlamlı bir ilişki bulundu (p=0,015). Hasta ve kontroller arasında diğer genler için metilasyon, ekspresyon ve inflamasyon durumu arasında istatistiksel olarak anlamlı ilişki bulunmadı.Ülseratif kolitte APC2'nin metilasyonunun arttığı, SFRP5 metilasyon artışının ekspresyonu azalttığı bulgusunun inflamasyonla ilişkisi olduğu ileri sürülebilir. Ülseratif kolit ilişkili neoplazi ile ilişkisini söyleyebilmek için daha fazla çalışmaya ihtiyaç vardır.
Özet (Çeviri)
ABSTRACTUlcerative colitis, being chronically inflammatory disease of gastrointestinal pathway, has increased risk of colorectal cancer. The role of WNT signaling pathway in neoplasia related with ulcerative colitis has been indicated in recent publications. In this study, it is aimed to investigate the methylation and expression status of WNT signaling pathway genes in neoplasia related with ulcerative colitis.Patient group composed of 20 people diagnosed with distal type ulcerative colitis and having surveillance colonoscopy, control group composed of 15 people having colon cancer screening, not having any complaints or endoscopic pathology. DNA and RNA are obtained from the biopsies of the patient and control groups. SFRP2, SFRP4, SFRP5, APC1, APC2 and ACTB gene expressions are determined by Real-Time PCR and ?Comparative CT (??Ct)? analysis. The methylation status of the genes are studied by using methylation specific PCR.For APC2 gene methylation; in patient group 8 people are methylated (%40) and 12 are unmethylated (%60) whereas in the control group 1 is methylated (%6.7), 14 are unmethylated (93.3%) (p=0.018). In patient group, for SFRP5 gene, a significant relationship is observed between the methylation status and expressions (p=0.015). Regarding the other genes, no significant statistical relationship is observed among the methylation, expression and inflamation status between the patient and control groups.In ulcerative colitis, it is suggested that the findings of the increase in the methylation of APC2, and the decrease in the expression due to the incease of SFRP5 methylation both have a relationship with inflamation. However, further studies are needed in order to suggest its relationship with ulcerative colitis related neoplasia.
Benzer Tezler
- Development of mirna biomarkers for the differentiation between gingivitis and periodontitis: A pilot study
Gingivitis ve periodontitis ayrımı için mirna biyobelirteçlerinin geliştirilmesi: Pilot çalışma
DHAFIR LATIEF FAYADH FAYADH
Doktora
İngilizce
2023
BiyokimyaSüleyman Demirel ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA CALAPOĞLU
- Ülseratif kolitte NADPH oksidaz alt ünitesi P22phox gen ekspresyonu
Nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADPH) oxidase subunit P22phox gene expression in ulcerative colitis
NEŞE BÜLBÜL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
GastroenterolojiGaziantep Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MUSA AYDINLI
- Ülseratif kolitte, hastalık aktivitesinin belirlenmesinde serum interleukin-17 düzeyinin değeri ve konvansiyonel belirteçler ile karşılaştırılması
The role of serum ınterleukin 17 levels in determining disease activity in ulcerative colitis and a comparison with conventional markers
ALİ İBRAHİM SHORBAGİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
GastroenterolojiHacettepe Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERAP ARSLAN
- Ülseratif kolitte endoskopik ve histolojik aktivitenin klinik, laboratuvar ve ultrasonografik bulguları ile karşılaştırılması
Comparison of endoscopic and histological activity in ulcerative colitis with clinical, laboratory and ultrasonographic findings
ŞERİFE GÖZDE ŞEN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Gastroenterolojiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşaİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YUSUF ZİYA ERZİN
- Ülseratif kolitte biyolojik ajanların kolektomi sıklığı üzerine etkileri: Tersiyer merkez verileri
Impact of biologic era on colectomy rate in ulcerative colitis, tertiary center cohort study covering 1999-2021
NUR BEYZA TÜKEK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Gastroenterolojiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşaİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YUSUF ZİYA ERZİN