Geri Dön

Anoxybacillus gonensis g2 çift mutant w137f/v184s ve w137f/v184t ksiloz izomerazlarının saflaştırılması ve karakterizasyonu

Purification and characterization of w137f/v184s and w137f/v184t double mutant anoxybacillus gonensis g2 xylose isomerase

  1. Tez No: 315553
  2. Yazar: ZÜMRÜT ÖZTEKİN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ALİ OSMAN BELDÜZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Anoxybacillus gonensis, D-ksiloz izomeraz, mutasyon, enzim saflaştırması, enzim karakterizasyonu, Anoxybacillus gonensis, D-xylose isomerase, mutation, enzyme purification, characterization
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 73

Özet

Bu çalışma, Gönen Kaplıcası'ndan izole edilmiş olan termofilik A. gonensis G2 suşuna ait Ksiloz İzomeraz (KI) W137F/V184S ve KI W137F/V184T çift mutasyonlu enzimlerin saflaştırılmasını ve karakterizasyonunu kapsamaktadır. KI W137F/V184S için; Km= 91,13 ± 10,54 mM; Vmax= 31,71 ± 1,1 µmol/dk/mg protein; Kcat/Km = 1,161 olarak bulundu. KI W137F/V184T için ise; Km= 25,94 ± 3,73 mM; Vmax=7,66 ± 0,37 µmol/dk/mg protein; Kcat/Km = 0,985 olarak hesaplandı. KI W137F/V184S ve KI W137F/V184T için optimum sıcaklık 85°C, optimum pH 7,5 olarak belirlendi. KI W137F/V184S 70°C'de yarım saatten sonra aktivitesini hızlı bir şekilde kaybetmiştir. KI W137F/V184T ise aktivitesinin yarısını 80°C'de yarım saatte kaybetmiştir. KI W137F/V184S'nin en iyi pH 8'de kararlı kaldığı, KI W137F/V184T'nin ise, yüksek pH değerlerinde (pH 8 - 9,5) kararlı kaldığı görüldü. KI W137F/V184S'nin en yüksek aktivitesi 10 mM Mg+2 varlığında gözlendi. KI W137F/V184T'nin ise, en yüksek aktivitesi 10 mM Mn+2 varlığında gözlendi. Ca+2, Hg+2, Ni+2, Zn+2, Fe+2 ve Cu+2 bivalent metal iyonlarının her iki mutant KI üzerinde inhibitör etki gösterdiği belirlendi.

Özet (Çeviri)

This study includes purification and characterization of Xylose Isomerase (XI) of Anoxybacillus gonensis G2 with double mutations (W137F/V184S and W137F/V184T). For XI W137F/V184S, Km, Vmax and Kcat/Km values were calculated as Km= 91,13 ± 10,54 mM; Vmax= 31,71 ± 1,1 µmol/dk/mg protein; Kcat/Km = 1,161. Also for XI W137F/V184T, Km, Vmax and Kcat/Km values were calculated as Km= 25,94 ± 3,73 mM; Vmax=7,66 ± 0,37 µmol/dk/mg protein; Kcat/Km = 0,985. The optimum temprature and optimum pH for both mutant XI were determined as 85°C and pH 7,5 respectively. At 70°C, after 30 minutes XI W137F/V184S lost its activity rapidly. At 80°C, after 30 minutes XI W137F/V184T lost half of its activity. XI W137F/V184S was stable at pH 8, while XI W137F/V184T was stable at alkaline pH values. The maximum activity of XI W137F/V184S and XI W137F/V184T were observed in presence of 10 mM Mg+2 and 10 mM Mn+2 respectively. Ca+2, Hg+2, Ni+2, Zn+2, Fe+2 and Cu+2 were determined as inhibitors for activities of XI W137F/V184S and XI W137F/V184T.

Benzer Tezler

  1. Anoxybacillus gonensis G2 bakterisinin alüminyuma dirençlilik geninin belirlenmesi, ekspresyonu ve karakterizasyonu

    Cloning, expression and characterization of the aluminium resistance gene of Anoxybacillus gonensis G2

    FATİH ŞABAN BERİŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    BiyolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALİ OSMAN BELDÜZ

  2. Termofilik Anoxybacillus genensis G2 suşunun fruktoz-1,6-bisfosfat aldolaz geninin klonlanması, ekspresyonu ve karakterizasyonu

    Cloning, expression and characterization of the fructose-1,6-bisphosphate aldolase gene from thermophilic Anoxybacillus genensis G2 strain

    NAGİHAN SAĞLAM ERTUNGA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    KimyaKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. AHMET ÇOLAK

  3. Anoxybacillus gonensis D-glukoz (D-ksiloz) izomeraz geninin klonlanması, izolasyonu ve karakterizasyonu

    Cloning, isolation and characterization of D-glucose (D-Xylose) isomerase gene from Anoxybacillus gonensis

    HAKAN KARAOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    BiyolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. ALİ OSMAN BELDÜZ

  4. Anoxybacillus gonensis G2t glukoz izomerazının ısıl kararlılığının K111R-L313I-V101R-A353G/F/W VE T428E/S bölge spesifik mutasyonları ile geliştirilmesi

    Improvement thermal stability of glucose isomerase from Anoxybacillus gonensis g2t by site directed mutagenesis K111R-L313I-V101R-A353G/F/W and T428E/S

    SEYHAN RAKICI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyokimyaRecep Tayyip Erdoğan Üniversitesi

    Su Ürünleri Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ HAKAN KARAOĞLU

  5. Anoxybacillus gonensis G2T ksiloz izomeraz geninin klonlanması, gen ürününün saflaştırılması ve karakterizasyonu

    Cloning of anoxybacillus gonensis G2T xylose isomerase gene and purification and characterization of gene product

    DERYA YANMIŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    BiyokimyaKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALİ OSMAN BELDÜZ