Geri Dön

Bioinformatics analysis and gene expression profile of one of the topoisomerase enzymes in Tettrahymena thermophila

Tetrahymena thermophila 'da bulunan topoizomeraz enzimlerinden birinin biyoinformatik analizi ve gen ekspresyon profili

PDF İndir

  1. Tez No: 318606
  2. Yazar: HÜSNA KARABOĞA
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. SEVİM IŞIK, ÖĞR. GÖR. MEHMET TAHA YILDIZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Fatih Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 64

Özet

Topoisomerazlar her hücre için gerekli olan hatta bazı virüslerde bile bulunan DNA'nın topolojik problemlerini (zincirlenme, düğümlenme ve burkulma) çözen bir grup enzimdir. Topoizomerazlar, mekanik ve fonksiyonel özelliklerine göre tip I (monomerik) ve tip II (dimerik) olarak iki gruba ayrılırlar. Genellikle, tip II topoizomerazlar antikanser ve antibakteriyel ilaçlar tarafından tedavi için hedeflenirler. Vetebralarda tip II topoisomerazların, topoisomeraz II? ve IIß olarak bilinen, iki farklı izomeri bulunmaktadır. Topoizomeraz II? iyi tanımlanmış bir enzim olmasına rağmen topoizomeraz IIß'nın fonksiyonu henüz bilinmemektedir.Tetrahymena thermophila göllerde ve taze kaynak sularında yaşayan tek hücreli protozoa grubuna dahil, patojenik olmayan silli bir organizmadır. Deneysel analizler için ön plana çıkan model ökaryotlardan biridir. Bu organizma, maya ile homolog olmayan insan proteinleri ile yüksek oranda benzerlik göstermektedir.Biyoinformatik analizlere göre insan topoizomeraz IIß, Tetrahymena thermophila'da bulunan topoizomeraz II (topo2 and topo2b) enzimleri ile kayda değer bir homoloji göstermektedir. Tetrahymena thermophila'nın topoizomerazlarla ilgili araştırmalarda uygun bir model olup olamayacağını anlamak için deneysel analizler yapıldı ve sonuçlar Tetrahymena thermophila'nın topoizomeraz çalışmak için mükemmel bir model olduğunu doğrulamaktadır. Tetrahymena thermophila' nın topoizomeraz IIß enziminin fonksiyonunu aydınlatmak için çalışılabilecek uygun bir organizma olduğu söylenebilir.

Özet (Çeviri)

Topoisomerases which are a group of enzymes solving the topological problems of DNA (catenates, supercoils and knots) are essential for every type of cell, even for some viruses. According to their mechanistic and functional features, topoisomerases are classified as type I (monomeric) and type II (dimeric). Mostly, Type II topoisomerase enzymes are targeted for anticancer and antibacterial drugs for therapy. In vertebrate, Type II topoisomerases have two isoform known as topoisomerase II? and IIß. Although topoisomerase II? is a well known enzyme, the function of topoisomerases IIß has not been known, yet.Tettrahymena thermophila is a non-pathogenic and free-living ciliated protozoan that inhabits the lake, fresh water and ponds. It is emerging as one of the foremost model eukaryotes for experimental analysis. This organism shows high homology with human proteins and many of which has no homologous in yeast.According to bioinformatics analysis, human topoisomerase IIß shows a significant homology with topoisomerase II (topo2 and topo2b) enzymes in Tetrahymena thermophila. To investigate whether Tetrahymena thermophila is a good model for researches related to topoisomerases or not, experimental procedure was applied and our results confirm that this is a perfect organism to study topoisomerases. Tetrahymena thermophila can be used to uncover the function of topoisomerase IIß.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    352469

    Sporadik kolorektal kanser vakalarında genom ebadında kopya sayısı değişimlerinin ve transkriptom profilinin belirlenmesi ile kanserin gelişmesinde ve ilerlemesinde etken yeni genlerin tanımlanması

    Identification of new gene and gene groups involved in cancer development and progression through genome-wide copy number variation analysis and transcriptome profiling in sporadic colorectal cancer cases

    NEVİN BELDER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HİLAL ÖZDAĞ

  2. Tez No

    753284

    Türk buğday çeşitlerinde kuraklık stresi altında mikrorna'ların yeni nesil dizileme teknolojileri ile dizilenmesi ve ifade analizlerinin belirlenmesi

    Sequencing of microrna via next generation sequencing technology in Turkish wheat cultivars under drought stress and determination of their expression analysis

    FERHAT ULU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyoteknolojiKastamonu Üniversitesi

    Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET CENGİZ BALOĞLU

  3. Tez No

    897141

    Leishmania RNA virüs pozitif ve negatif suşların transkriptomik analizi ile farklı ifade edilen genlerin değerlendirilmesi

    Evaluation of differently expressed genes by transcriptomic analysis of Leishmania RNA virus positive and negative strains

    MUHAMMED NALÇACI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    ParazitolojiEge Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AHMET MERMER

    PROF. DR. SERAY TÖZ

  4. Tez No

    325513

    Transgenic analysis of the zebrafish OR101-1 gene promoter

    Zebrabalığı OR101-1 gen promotörünün transgenik analizi

    NURAY SÖĞÜNMEZ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2012

    BiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. STEFAN H. FUSS

  5. Tez No

    502614

    Expression analysis of hla-b gene in sporadic behcet syndrome patients

    Sporadik behçet sendromlu bireylerde hla-b geninin ekspresyon analizi

    ESRA KIZILTEPE KISAKESEN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Biyoistatistikİstanbul Teknik Üniversitesi

    İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EDA TAHİR TURANLI

Geri Dön